48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_07210 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_07210  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  323  4.0000000000000003e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00225  hypothetical protein  43.45 
 
 		 150 aa  127  6e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04630  hypothetical protein  43.26 
 
 		 166 aa  124  7e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1577  hypothetical protein  37.06 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1353  hypothetical protein  36.81 
 
 		 148 aa  100  9e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5865  hypothetical protein  37.8 
 
 		 321 aa  95.5  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1113  hypothetical protein  37.01 
 
 		 317 aa  92.8  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1193  hypothetical protein  37.01 
 
 		 317 aa  92  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0570  hypothetical protein  33.1 
 
 		 161 aa  90.9  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2293  hypothetical protein  32.87 
 
 		 320 aa  90.9  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1169  hypothetical protein  34.75 
 
 		 150 aa  90.5  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.200883 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1001  hypothetical protein  32.64 
 
 		 154 aa  90.1  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026081 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3135  hypothetical protein  35.42 
 
 		 150 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222956  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5437  hypothetical protein  34.04 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0760  Protein of unknown function DUF2383  33.81 
 
 		 151 aa  90.1  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.462088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36530  hypothetical protein  34.72 
 
 		 150 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00120253  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0797  hypothetical protein  38.39 
 
 		 179 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0831  hypothetical protein  38.39 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.521275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0820  hypothetical protein  38.39 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.169744 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1124  hypothetical protein  33.56 
 
 		 156 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221098  normal  0.514803 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4396  hypothetical protein  38.18 
 
 		 158 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.479325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2262  hypothetical protein  31.03 
 
 		 154 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132862  normal  0.0310926 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6235  Protein of unknown function DUF2383  32.41 
 
 		 151 aa  84  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1446  hypothetical protein  37.01 
 
 		 330 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1746  hypothetical protein  33.09 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1244  hypothetical protein  32.61 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0835823  unclonable  0.0000000177159 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1593  hypothetical protein  33.09 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2163  hypothetical protein  27.89 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.096246  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1304  hypothetical protein  29.45 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.448465  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2897  hypothetical protein  30.43 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0169773 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2621  hypothetical protein  32.56 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.652955 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1687  hypothetical protein  33.6 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0627  hypothetical protein  26.21 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5302  hypothetical protein  27.66 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163208  normal  0.0551746 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2659  hypothetical protein  30.43 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.295349  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1205  hypothetical protein  30.37 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512169 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3187  hypothetical protein  28.38 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455411  normal  0.995742 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4357  hypothetical protein  31.16 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4024  hypothetical protein  29.23 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3778  hypothetical protein  29.23 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119444  normal  0.0564298 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3966  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  26.09 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0555539  normal  0.194961 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1839  hypothetical protein  29.08 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.756028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0359  hypothetical protein  28.87 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401814  normal  0.430905 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1122  hypothetical protein  28.17 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234261  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0169  hypothetical protein  25.36 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.740062  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2525  hypothetical protein  27.68 
 
 		 187 aa  45.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3555  hypothetical protein  21.71 
 
 		 150 aa  44.7  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1592  hypothetical protein  28.89 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>