45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3966 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3966  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 151 aa  310  4.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0555539  normal  0.194961 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2659  hypothetical protein  63.57 
 
 		 153 aa  191  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.295349  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3187  hypothetical protein  55.03 
 
 		 155 aa  165  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455411  normal  0.995742 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1122  hypothetical protein  52.03 
 
 		 160 aa  154  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234261  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0359  hypothetical protein  52.82 
 
 		 154 aa  150  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401814  normal  0.430905 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0627  hypothetical protein  46.05 
 
 		 153 aa  133  9e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2897  hypothetical protein  44.59 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0169773 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1839  hypothetical protein  39.22 
 
 		 150 aa  114  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.756028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6235  Protein of unknown function DUF2383  38.78 
 
 		 151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1001  hypothetical protein  36.81 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026081 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4357  hypothetical protein  39.31 
 
 		 155 aa  102  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5437  hypothetical protein  38.03 
 
 		 150 aa  100  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1169  hypothetical protein  37.32 
 
 		 150 aa  96.7  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.200883 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3135  hypothetical protein  37.41 
 
 		 150 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222956  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36530  hypothetical protein  37.41 
 
 		 150 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00120253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1124  hypothetical protein  36.73 
 
 		 156 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221098  normal  0.514803 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0831  hypothetical protein  36.42 
 
 		 158 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.521275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4396  hypothetical protein  37.58 
 
 		 158 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.479325  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0797  hypothetical protein  37.58 
 
 		 179 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0820  hypothetical protein  37.58 
 
 		 158 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.169744 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2293  hypothetical protein  35.57 
 
 		 320 aa  89.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1353  hypothetical protein  36.11 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0570  hypothetical protein  35.86 
 
 		 161 aa  88.6  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1577  hypothetical protein  34.03 
 
 		 153 aa  86.7  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5302  hypothetical protein  38.03 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163208  normal  0.0551746 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2262  hypothetical protein  32.19 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132862  normal  0.0310926 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0760  Protein of unknown function DUF2383  30.37 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.462088  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1304  hypothetical protein  34.01 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.448465  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5865  hypothetical protein  39.29 
 
 		 321 aa  80.5  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1113  hypothetical protein  34.48 
 
 		 317 aa  75.5  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1193  hypothetical protein  34.48 
 
 		 317 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1593  hypothetical protein  30.14 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04630  hypothetical protein  27.4 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1446  hypothetical protein  39.56 
 
 		 330 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1746  hypothetical protein  30.56 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07210  hypothetical protein  26.09 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1205  hypothetical protein  28.57 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512169 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0178  hypothetical protein  31.39 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3555  hypothetical protein  31.33 
 
 		 150 aa  57  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2163  hypothetical protein  32.18 
 
 		 150 aa  57  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.096246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0169  hypothetical protein  25.35 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.740062  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2621  hypothetical protein  29.75 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.652955 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4091  hypothetical protein  25.71 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0271  hypothetical protein  28.36 
 
 		 175 aa  43.5  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000678514 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01766  hypothetical protein  27.66 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.756616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>