48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0570 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0570  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  333  5e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2293  hypothetical protein  56.95 
 
 		 320 aa  185  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1353  hypothetical protein  54.61 
 
 		 148 aa  164  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1577  hypothetical protein  47.97 
 
 		 153 aa  158  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5865  hypothetical protein  54.89 
 
 		 321 aa  155  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5437  hypothetical protein  50.35 
 
 		 150 aa  154  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1169  hypothetical protein  50.35 
 
 		 150 aa  152  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.200883 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1113  hypothetical protein  53.08 
 
 		 317 aa  149  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1193  hypothetical protein  53.08 
 
 		 317 aa  148  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1446  hypothetical protein  55.64 
 
 		 330 aa  142  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2262  hypothetical protein  43.15 
 
 		 154 aa  142  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132862  normal  0.0310926 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36530  hypothetical protein  44.74 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00120253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3135  hypothetical protein  44.08 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222956  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5302  hypothetical protein  43.26 
 
 		 150 aa  134  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163208  normal  0.0551746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0831  hypothetical protein  42.21 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.521275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4396  hypothetical protein  42.58 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.479325  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0797  hypothetical protein  42.58 
 
 		 179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0820  hypothetical protein  42.58 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.169744 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4357  hypothetical protein  41.29 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1124  hypothetical protein  40 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221098  normal  0.514803 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1001  hypothetical protein  41.67 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026081 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1304  hypothetical protein  39.35 
 
 		 156 aa  121  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.448465  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2163  hypothetical protein  36.11 
 
 		 150 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.096246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1593  hypothetical protein  39.01 
 
 		 148 aa  98.2  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2897  hypothetical protein  37.93 
 
 		 152 aa  95.5  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0169773 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04630  hypothetical protein  35.46 
 
 		 166 aa  93.2  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2659  hypothetical protein  35.92 
 
 		 153 aa  93.2  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.295349  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3187  hypothetical protein  35.37 
 
 		 155 aa  91.7  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455411  normal  0.995742 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07210  hypothetical protein  33.1 
 
 		 158 aa  90.9  7e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3966  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  35.86 
 
 		 151 aa  88.6  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0555539  normal  0.194961 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00225  hypothetical protein  28.08 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1746  hypothetical protein  34.04 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0169  hypothetical protein  31.39 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.740062  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1122  hypothetical protein  31.17 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234261  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0760  Protein of unknown function DUF2383  30.22 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.462088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0359  hypothetical protein  31.69 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401814  normal  0.430905 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1205  hypothetical protein  29.93 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512169 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0627  hypothetical protein  29.37 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1839  hypothetical protein  30.87 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.756028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2621  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.652955 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6235  Protein of unknown function DUF2383  27.48 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4091  hypothetical protein  27.54 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0271  hypothetical protein  23.53 
 
 		 175 aa  48.9  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000678514 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3555  hypothetical protein  25.18 
 
 		 150 aa  48.5  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2261  hypothetical protein  26.32 
 
 		 156 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0881857  normal  0.0318922 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0178  hypothetical protein  22.46 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01766  hypothetical protein  28.7 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.756616  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3040  hypothetical protein  22.63 
 
 		 144 aa  43.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000290401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>