11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3040 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3040  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  291  2e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000290401  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1592  hypothetical protein  27.14 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1873  hypothetical protein  25.71 
 
 		 156 aa  47  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0100252  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1702  Ferritin Dps family protein  27.08 
 
 		 196 aa  45.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.766547 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1871  Ferritin Dps family protein  25.55 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3021  Ferritin Dps family protein  26.76 
 
 		 191 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.331122 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0570  hypothetical protein  22.63 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0112  hypothetical protein  26.97 
 
 		 145 aa  42.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0749559 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2901  rubrerythrin:Ferritin and Dps  27.97 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.778034  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2293  hypothetical protein  26.72 
 
 		 320 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0131  hypothetical protein  26.97 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>