12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1871 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1871  Ferritin Dps family protein  100 
 
 		 148 aa  300  5.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0112  hypothetical protein  52.08 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0749559 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0131  hypothetical protein  50.69 
 
 		 145 aa  142  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1253  hypothetical protein  40.3 
 
 		 155 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.913362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1254  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.610184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4126  hypothetical protein  33.09 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5254  hypothetical protein  34.58 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.345433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6865  hypothetical protein  36.27 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3040  hypothetical protein  25.55 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000290401  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2604  hypothetical protein  26.76 
 
 		 500 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1122  hypothetical protein  26.67 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234261  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1304  hypothetical protein  26.27 
 
 		 156 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.448465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>