59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2293 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2293  hypothetical protein  100 
 
 
320 aa  649    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1193  hypothetical protein  55.49 
 
 
317 aa  277  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1446  hypothetical protein  58.07 
 
 
330 aa  278  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1113  hypothetical protein  56.11 
 
 
317 aa  276  3e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5865  hypothetical protein  52.63 
 
 
321 aa  252  7e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0570  hypothetical protein  56.95 
 
 
161 aa  186  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1353  hypothetical protein  54.17 
 
 
148 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2262  hypothetical protein  46.05 
 
 
154 aa  151  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132862  normal  0.0310926 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5437  hypothetical protein  49.64 
 
 
150 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1169  hypothetical protein  49.64 
 
 
150 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.200883 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1124  hypothetical protein  46.79 
 
 
156 aa  149  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221098  normal  0.514803 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1304  hypothetical protein  46.15 
 
 
156 aa  145  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.448465  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0831  hypothetical protein  44.94 
 
 
158 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.521275  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0797  hypothetical protein  43.48 
 
 
179 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0820  hypothetical protein  44.3 
 
 
158 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.169744 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4396  hypothetical protein  44.65 
 
 
158 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.479325  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36530  hypothetical protein  44.37 
 
 
150 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00120253  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5302  hypothetical protein  44.52 
 
 
150 aa  136  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163208  normal  0.0551746 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3135  hypothetical protein  43.66 
 
 
150 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222956  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1577  hypothetical protein  44.44 
 
 
153 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4357  hypothetical protein  48.08 
 
 
155 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2163  hypothetical protein  42.07 
 
 
150 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.096246  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1001  hypothetical protein  36.24 
 
 
154 aa  115  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026081 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1593  hypothetical protein  39.46 
 
 
148 aa  102  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2897  hypothetical protein  40.28 
 
 
152 aa  96.7  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0169773 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0169  hypothetical protein  33.1 
 
 
150 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.740062  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2659  hypothetical protein  32.24 
 
 
153 aa  92  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.295349  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3187  hypothetical protein  36 
 
 
155 aa  92  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455411  normal  0.995742 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07210  hypothetical protein  32.87 
 
 
158 aa  90.9  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3966  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  35.57 
 
 
151 aa  89.7  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0555539  normal  0.194961 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04630  hypothetical protein  30.71 
 
 
166 aa  89.7  6e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0760  Protein of unknown function DUF2383  33.59 
 
 
151 aa  87  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.462088  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1331  hypothetical protein  46.31 
 
 
225 aa  87  4e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0559942  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0359  hypothetical protein  36.49 
 
 
154 aa  86.3  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401814  normal  0.430905 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1205  hypothetical protein  34.64 
 
 
150 aa  84.7  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.512169 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1122  hypothetical protein  34.69 
 
 
160 aa  83.6  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234261  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0627  hypothetical protein  30.61 
 
 
153 aa  80.5  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1839  hypothetical protein  36.81 
 
 
150 aa  80.5  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.756028  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1042  hypothetical protein  45.64 
 
 
225 aa  80.1  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0558467  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1746  hypothetical protein  34.75 
 
 
151 aa  79.3  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0811  17 kDa surface antigen  44.67 
 
 
456 aa  75.5  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2621  hypothetical protein  36.84 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.652955 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4998  hypothetical protein  45.45 
 
 
284 aa  67.8  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0040  hypothetical protein  50 
 
 
162 aa  65.9  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000158895 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00225  hypothetical protein  24.32 
 
 
150 aa  65.5  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3555  hypothetical protein  30.71 
 
 
150 aa  62  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6235  Protein of unknown function DUF2383  25.38 
 
 
151 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0335  hypothetical protein  36.26 
 
 
109 aa  57  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.805533 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4091  hypothetical protein  22.63 
 
 
147 aa  54.3  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04113  hypothetical protein  36.84 
 
 
101 aa  50.8  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0271  hypothetical protein  23.85 
 
 
175 aa  50.4  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000678514 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4145  hypothetical protein  36.36 
 
 
369 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000490948  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0112  hypothetical protein  26.21 
 
 
145 aa  47.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0749559 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2261  hypothetical protein  24.46 
 
 
156 aa  47  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0881857  normal  0.0318922 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0005  hypothetical protein  29.33 
 
 
332 aa  47.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781712  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2525  hypothetical protein  25.16 
 
 
187 aa  45.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778896  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7022  hypothetical protein  29.73 
 
 
345 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00344317  hitchhiker  0.00000183112 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0131  hypothetical protein  25.52 
 
 
145 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0401  17 kDa surface antigen  28.68 
 
 
385 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.693676 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>