41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1746 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1746  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  309  7.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2621  hypothetical protein  45.83 
 
 
151 aa  120  8e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.652955 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1001  hypothetical protein  32.35 
 
 
154 aa  87  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026081 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0797  hypothetical protein  35.81 
 
 
179 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0820  hypothetical protein  35.81 
 
 
158 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.169744 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2659  hypothetical protein  39.26 
 
 
153 aa  85.9  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.295349  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4396  hypothetical protein  34.23 
 
 
158 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.479325  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1353  hypothetical protein  35.46 
 
 
148 aa  84.3  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0760  Protein of unknown function DUF2383  37.4 
 
 
151 aa  83.2  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.462088  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0570  hypothetical protein  34.04 
 
 
161 aa  82.4  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0831  hypothetical protein  35.42 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.521275  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07210  hypothetical protein  33.09 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1169  hypothetical protein  36.03 
 
 
150 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.200883 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5865  hypothetical protein  32.54 
 
 
321 aa  80.9  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2262  hypothetical protein  34.53 
 
 
154 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132862  normal  0.0310926 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5437  hypothetical protein  35.29 
 
 
150 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1593  hypothetical protein  36.76 
 
 
148 aa  79.3  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2293  hypothetical protein  34.75 
 
 
320 aa  80.1  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4357  hypothetical protein  33.56 
 
 
155 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1193  hypothetical protein  33.87 
 
 
317 aa  77.4  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04630  hypothetical protein  30.71 
 
 
166 aa  77  0.00000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36530  hypothetical protein  33.59 
 
 
150 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00120253  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1113  hypothetical protein  33.87 
 
 
317 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1577  hypothetical protein  29.41 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3135  hypothetical protein  32.82 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222956  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00225  hypothetical protein  27.86 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5302  hypothetical protein  33.09 
 
 
150 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163208  normal  0.0551746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6235  Protein of unknown function DUF2383  30.82 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1304  hypothetical protein  30.14 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.448465  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1124  hypothetical protein  30.6 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221098  normal  0.514803 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1446  hypothetical protein  35.71 
 
 
330 aa  70.5  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1205  hypothetical protein  29.25 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.512169 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3966  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  30.56 
 
 
151 aa  63.9  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0555539  normal  0.194961 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2897  hypothetical protein  33.1 
 
 
152 aa  61.6  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0169773 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3187  hypothetical protein  34.48 
 
 
155 aa  60.8  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455411  normal  0.995742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0627  hypothetical protein  31.48 
 
 
153 aa  57.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1122  hypothetical protein  28.37 
 
 
160 aa  55.1  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234261  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2163  hypothetical protein  26.36 
 
 
150 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.096246  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1839  hypothetical protein  29.14 
 
 
150 aa  53.9  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.756028  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0359  hypothetical protein  27.78 
 
 
154 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401814  normal  0.430905 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1244  hypothetical protein  25 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0835823  unclonable  0.0000000177159 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>