48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1169 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1169  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  304  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.200883 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5437  hypothetical protein  95.97 
 
 		 150 aa  291  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5302  hypothetical protein  64.43 
 
 		 150 aa  209  7.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163208  normal  0.0551746 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36530  hypothetical protein  56.64 
 
 		 150 aa  165  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00120253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3135  hypothetical protein  55.94 
 
 		 150 aa  164  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222956  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1124  hypothetical protein  55.78 
 
 		 156 aa  163  8e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221098  normal  0.514803 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1113  hypothetical protein  54.81 
 
 		 317 aa  155  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2262  hypothetical protein  54.68 
 
 		 154 aa  154  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132862  normal  0.0310926 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1193  hypothetical protein  54.81 
 
 		 317 aa  154  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0570  hypothetical protein  50.35 
 
 		 161 aa  152  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2293  hypothetical protein  49.64 
 
 		 320 aa  149  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5865  hypothetical protein  51.11 
 
 		 321 aa  148  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1577  hypothetical protein  47.95 
 
 		 153 aa  146  9e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1353  hypothetical protein  51.43 
 
 		 148 aa  144  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0831  hypothetical protein  50.68 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.521275  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1304  hypothetical protein  47.97 
 
 		 156 aa  140  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.448465  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0797  hypothetical protein  50 
 
 		 179 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0820  hypothetical protein  50 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.169744 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4357  hypothetical protein  52.38 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1446  hypothetical protein  54.81 
 
 		 330 aa  138  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4396  hypothetical protein  47.65 
 
 		 158 aa  137  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.479325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1001  hypothetical protein  44.83 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026081 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2163  hypothetical protein  38.41 
 
 		 150 aa  121  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.096246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1593  hypothetical protein  46.15 
 
 		 148 aa  118  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0169  hypothetical protein  38.13 
 
 		 150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.740062  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2659  hypothetical protein  37.09 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.295349  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1122  hypothetical protein  36.91 
 
 		 160 aa  99.8  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234261  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3966  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  37.32 
 
 		 151 aa  96.7  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0555539  normal  0.194961 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3187  hypothetical protein  33.56 
 
 		 155 aa  96.7  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455411  normal  0.995742 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0359  hypothetical protein  38.93 
 
 		 154 aa  95.1  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401814  normal  0.430905 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2897  hypothetical protein  37.67 
 
 		 152 aa  94.4  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0169773 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1205  hypothetical protein  36.23 
 
 		 150 aa  90.9  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512169 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07210  hypothetical protein  34.75 
 
 		 158 aa  90.5  7e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1839  hypothetical protein  38.1 
 
 		 150 aa  90.1  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.756028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0760  Protein of unknown function DUF2383  35.16 
 
 		 151 aa  88.2  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.462088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1746  hypothetical protein  36.03 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04630  hypothetical protein  30.47 
 
 		 166 aa  80.5  0.000000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00225  hypothetical protein  27.27 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2621  hypothetical protein  35.77 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.652955 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0627  hypothetical protein  30.5 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6235  Protein of unknown function DUF2383  32.33 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0178  hypothetical protein  30.43 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3555  hypothetical protein  34.09 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0271  hypothetical protein  27.69 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000678514 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2261  hypothetical protein  24.09 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0881857  normal  0.0318922 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01766  hypothetical protein  32.33 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.756616  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2525  hypothetical protein  33.9 
 
 		 187 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1244  hypothetical protein  28.36 
 
 		 152 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0835823  unclonable  0.0000000177159 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>