24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0401 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0401  17 kDa surface antigen  100 
 
 		 385 aa  767    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.693676 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3920  17 kDa surface antigen  49.06 
 
 		 429 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0425807 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1969  tetratricopeptide TPR_2  38.46 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.467519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  39.47 
 
 		 1252 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  39.47 
 
 		 1252 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.53 
 
 		 363 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.53 
 
 		 363 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 		 311 aa  49.7  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  32.94 
 
 		 3301 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  32.94 
 
 		 3172 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  42.55 
 
 		 266 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_013749  Htur_5272  hypothetical protein  25.43 
 
 		 864 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1362  hypothetical protein  23.62 
 
 		 706 aa  45.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  48.94 
 
 		 955 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  36.92 
 
 		 340 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7095  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 354 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.524118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 456 aa  43.5  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32 
 
 		 219 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1550  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.73 
 
 		 297 aa  43.1  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000389536  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 3145 aa  43.1  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.59 
 
 		 810 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0150  Apolipoprotein A1/A4/E  21.99 
 
 		 7659 aa  43.1  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0594  tetratricopeptide TPR_4  35.71 
 
 		 601 aa  42.7  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003239  hypothetical protein  22.92 
 
 		 706 aa  42.7  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>