43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3555 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3555  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  310  4.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01766  hypothetical protein  68 
 
 		 151 aa  190  6e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.756616  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0178  hypothetical protein  45.14 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1001  hypothetical protein  29.55 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026081 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5437  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1169  hypothetical protein  34.09 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.200883 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2293  hypothetical protein  30.71 
 
 		 320 aa  65.5  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0239  hypothetical protein  29.45 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0694934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1113  hypothetical protein  30.88 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3966  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  31.33 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0555539  normal  0.194961 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1193  hypothetical protein  30.88 
 
 		 317 aa  62  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0359  hypothetical protein  34.69 
 
 		 154 aa  62  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401814  normal  0.430905 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1122  hypothetical protein  32.12 
 
 		 160 aa  62  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234261  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0271  hypothetical protein  29.5 
 
 		 175 aa  60.5  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000678514 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4091  hypothetical protein  23.78 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1353  hypothetical protein  30.56 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1205  hypothetical protein  25.36 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512169 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1304  hypothetical protein  28.47 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.448465  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3187  hypothetical protein  28.1 
 
 		 155 aa  57  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455411  normal  0.995742 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5302  hypothetical protein  30.77 
 
 		 150 aa  57  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163208  normal  0.0551746 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0797  hypothetical protein  32.35 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4396  hypothetical protein  28.28 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.479325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1577  hypothetical protein  28.47 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0064  hypothetical protein  27.94 
 
 		 182 aa  53.9  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0820  hypothetical protein  28.28 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.169744 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5865  hypothetical protein  27.94 
 
 		 321 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0831  hypothetical protein  31.37 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.521275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2897  hypothetical protein  26.95 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0169773 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0570  hypothetical protein  25.18 
 
 		 161 aa  51.2  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0760  Protein of unknown function DUF2383  24.39 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.462088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4357  hypothetical protein  26.06 
 
 		 155 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07210  hypothetical protein  20.9 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0627  hypothetical protein  27.59 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2163  hypothetical protein  26.85 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.096246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2262  hypothetical protein  26.43 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132862  normal  0.0310926 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1124  hypothetical protein  24.31 
 
 		 156 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221098  normal  0.514803 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1593  hypothetical protein  23.57 
 
 		 148 aa  47  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2659  hypothetical protein  26.67 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.295349  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2261  hypothetical protein  23.48 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0881857  normal  0.0318922 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3148  hypothetical protein  27.62 
 
 		 148 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.486705 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1839  hypothetical protein  23.94 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.756028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1446  hypothetical protein  25.74 
 
 		 330 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3708  hypothetical protein  35.56 
 
 		 159 aa  40.8  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.488196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>