20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0271 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0271  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  357  7e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000678514 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4091  hypothetical protein  29.08 
 
 		 147 aa  89.4  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0239  hypothetical protein  32.59 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0694934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0178  hypothetical protein  27.54 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1169  hypothetical protein  27.69 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.200883 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5437  hypothetical protein  26.92 
 
 		 150 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3555  hypothetical protein  29.5 
 
 		 150 aa  52.4  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2293  hypothetical protein  23.85 
 
 		 320 aa  50.8  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5302  hypothetical protein  26.67 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163208  normal  0.0551746 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0570  hypothetical protein  23.53 
 
 		 161 aa  48.9  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1001  hypothetical protein  24.43 
 
 		 154 aa  48.1  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026081 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01766  hypothetical protein  27.48 
 
 		 151 aa  47.8  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.756616  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3187  hypothetical protein  25.76 
 
 		 155 aa  45.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455411  normal  0.995742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3966  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  28.36 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0555539  normal  0.194961 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2659  hypothetical protein  26.12 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.295349  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3135  hypothetical protein  22.54 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222956  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2262  hypothetical protein  24.5 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132862  normal  0.0310926 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5865  hypothetical protein  31.46 
 
 		 321 aa  42.4  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36530  hypothetical protein  21.83 
 
 		 150 aa  42.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00120253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0831  hypothetical protein  23.08 
 
 		 158 aa  41.2  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.521275  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>