50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0831 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0831  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  323  9e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.521275  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0797  hypothetical protein  96.2 
 
 		 179 aa  310  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0820  hypothetical protein  95.57 
 
 		 158 aa  309  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.169744 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4396  hypothetical protein  91.77 
 
 		 158 aa  296  5e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.479325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4357  hypothetical protein  65.82 
 
 		 155 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1124  hypothetical protein  57.59 
 
 		 156 aa  177  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221098  normal  0.514803 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2262  hypothetical protein  51.9 
 
 		 154 aa  166  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132862  normal  0.0310926 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1304  hypothetical protein  51.27 
 
 		 156 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.448465  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36530  hypothetical protein  53.74 
 
 		 150 aa  157  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00120253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3135  hypothetical protein  53.74 
 
 		 150 aa  155  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222956  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5437  hypothetical protein  50.68 
 
 		 150 aa  144  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2293  hypothetical protein  44.94 
 
 		 320 aa  144  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1169  hypothetical protein  50.68 
 
 		 150 aa  143  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.200883 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1577  hypothetical protein  46.36 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5865  hypothetical protein  45 
 
 		 321 aa  132  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1353  hypothetical protein  47.65 
 
 		 148 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0570  hypothetical protein  42.21 
 
 		 161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1113  hypothetical protein  45.07 
 
 		 317 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1001  hypothetical protein  44.16 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026081 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1193  hypothetical protein  45.07 
 
 		 317 aa  124  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5302  hypothetical protein  40.41 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163208  normal  0.0551746 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1446  hypothetical protein  47.14 
 
 		 330 aa  107  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2659  hypothetical protein  38.62 
 
 		 153 aa  99.8  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.295349  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2897  hypothetical protein  40 
 
 		 152 aa  99.8  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0169773 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0760  Protein of unknown function DUF2383  40.95 
 
 		 151 aa  97.4  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.462088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1593  hypothetical protein  37.5 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04630  hypothetical protein  41.51 
 
 		 166 aa  93.2  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3966  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  36.42 
 
 		 151 aa  92.8  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0555539  normal  0.194961 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0169  hypothetical protein  34.01 
 
 		 150 aa  90.9  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.740062  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1839  hypothetical protein  36.91 
 
 		 150 aa  88.2  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.756028  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2163  hypothetical protein  31.13 
 
 		 150 aa  87.8  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.096246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1205  hypothetical protein  34.84 
 
 		 150 aa  87.8  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512169 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07210  hypothetical protein  38.39 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6235  Protein of unknown function DUF2383  35.34 
 
 		 151 aa  84.3  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1746  hypothetical protein  35.42 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3187  hypothetical protein  32.9 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455411  normal  0.995742 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1122  hypothetical protein  34.84 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234261  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0359  hypothetical protein  33.12 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401814  normal  0.430905 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00225  hypothetical protein  28.86 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2621  hypothetical protein  30.7 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.652955 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0627  hypothetical protein  25.83 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0178  hypothetical protein  25.87 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4091  hypothetical protein  27.85 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2261  hypothetical protein  31.07 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0881857  normal  0.0318922 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3555  hypothetical protein  31.37 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01766  hypothetical protein  31.37 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.756616  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2698  hypothetical protein  26.42 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0271  hypothetical protein  23.08 
 
 		 175 aa  41.2  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000678514 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2920  hypothetical protein  31.67 
 
 		 153 aa  41.2  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.869525 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1260  hypothetical protein  31.67 
 
 		 153 aa  41.2  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>