51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2262 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2262  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  313  8e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132862  normal  0.0310926 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36530  hypothetical protein  64.23 
 
 		 150 aa  192  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00120253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3135  hypothetical protein  63.5 
 
 		 150 aa  191  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222956  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4357  hypothetical protein  59.62 
 
 		 155 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4396  hypothetical protein  53.16 
 
 		 158 aa  168  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.479325  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0797  hypothetical protein  52.53 
 
 		 179 aa  167  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0820  hypothetical protein  52.53 
 
 		 158 aa  167  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.169744 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0831  hypothetical protein  51.9 
 
 		 158 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.521275  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1304  hypothetical protein  51.28 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.448465  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5437  hypothetical protein  55.4 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1124  hypothetical protein  49.36 
 
 		 156 aa  155  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221098  normal  0.514803 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1169  hypothetical protein  54.68 
 
 		 150 aa  154  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.200883 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2293  hypothetical protein  46.05 
 
 		 320 aa  151  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5302  hypothetical protein  46.04 
 
 		 150 aa  143  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163208  normal  0.0551746 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0570  hypothetical protein  43.15 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1353  hypothetical protein  47.18 
 
 		 148 aa  140  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1577  hypothetical protein  45.89 
 
 		 153 aa  140  6e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1113  hypothetical protein  46.32 
 
 		 317 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1193  hypothetical protein  46.32 
 
 		 317 aa  130  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5865  hypothetical protein  44.12 
 
 		 321 aa  129  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1001  hypothetical protein  42.14 
 
 		 154 aa  118  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026081 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1446  hypothetical protein  47.01 
 
 		 330 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2163  hypothetical protein  35.86 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.096246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1593  hypothetical protein  38.1 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0760  Protein of unknown function DUF2383  37.23 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.462088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0169  hypothetical protein  35.46 
 
 		 150 aa  99.4  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.740062  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2897  hypothetical protein  41.67 
 
 		 152 aa  97.4  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0169773 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04630  hypothetical protein  37.31 
 
 		 166 aa  94.7  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1839  hypothetical protein  38.19 
 
 		 150 aa  93.6  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.756028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2659  hypothetical protein  34.06 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.295349  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3187  hypothetical protein  35.14 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455411  normal  0.995742 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1122  hypothetical protein  33.56 
 
 		 160 aa  86.3  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234261  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07210  hypothetical protein  31.03 
 
 		 158 aa  83.6  8e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3966  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  32.19 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0555539  normal  0.194961 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1205  hypothetical protein  34.78 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512169 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1746  hypothetical protein  34.53 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0359  hypothetical protein  32.19 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401814  normal  0.430905 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6235  Protein of unknown function DUF2383  33.33 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0627  hypothetical protein  30.14 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2621  hypothetical protein  29.71 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.652955 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00225  hypothetical protein  27.7 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2261  hypothetical protein  25.74 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0881857  normal  0.0318922 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4091  hypothetical protein  21.9 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2698  hypothetical protein  29.66 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3555  hypothetical protein  26.43 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0271  hypothetical protein  24.5 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000678514 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1260  hypothetical protein  33.8 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2920  hypothetical protein  33.8 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.869525 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2525  hypothetical protein  27.27 
 
 		 187 aa  42.4  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778896  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0112  hypothetical protein  27.91 
 
 		 145 aa  41.2  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0749559 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0131  hypothetical protein  27.13 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>