44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2897 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2897  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  302  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0169773 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1839  hypothetical protein  60.14 
 
 
150 aa  171  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.756028  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2659  hypothetical protein  46.04 
 
 
153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.295349  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3966  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  44.59 
 
 
151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0555539  normal  0.194961 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1122  hypothetical protein  43.36 
 
 
160 aa  117  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234261  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3187  hypothetical protein  40.71 
 
 
155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455411  normal  0.995742 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0359  hypothetical protein  41.73 
 
 
154 aa  110  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401814  normal  0.430905 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1001  hypothetical protein  39.58 
 
 
154 aa  107  9.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026081 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4357  hypothetical protein  40 
 
 
155 aa  100  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3135  hypothetical protein  40.56 
 
 
150 aa  100  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222956  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36530  hypothetical protein  40.56 
 
 
150 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00120253  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0831  hypothetical protein  40 
 
 
158 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.521275  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0797  hypothetical protein  40 
 
 
179 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0820  hypothetical protein  40 
 
 
158 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.169744 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2262  hypothetical protein  41.67 
 
 
154 aa  97.4  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132862  normal  0.0310926 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1124  hypothetical protein  36.13 
 
 
156 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221098  normal  0.514803 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2293  hypothetical protein  40.28 
 
 
320 aa  97.1  8e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4396  hypothetical protein  38.67 
 
 
158 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.479325  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0570  hypothetical protein  37.93 
 
 
161 aa  95.5  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5437  hypothetical protein  37.67 
 
 
150 aa  94.4  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1169  hypothetical protein  37.67 
 
 
150 aa  94.4  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.200883 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1353  hypothetical protein  42.14 
 
 
148 aa  92  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1304  hypothetical protein  36.13 
 
 
156 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.448465  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0627  hypothetical protein  34.72 
 
 
153 aa  90.5  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1577  hypothetical protein  36.3 
 
 
153 aa  90.1  9e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6235  Protein of unknown function DUF2383  33.57 
 
 
151 aa  89  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5302  hypothetical protein  34.25 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163208  normal  0.0551746 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1593  hypothetical protein  36.36 
 
 
148 aa  82  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5865  hypothetical protein  39.47 
 
 
321 aa  82  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0760  Protein of unknown function DUF2383  36.15 
 
 
151 aa  78.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.462088  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04630  hypothetical protein  30.77 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07210  hypothetical protein  30.43 
 
 
158 aa  73.9  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1113  hypothetical protein  33.08 
 
 
317 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1193  hypothetical protein  33.08 
 
 
317 aa  72  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1446  hypothetical protein  35.94 
 
 
330 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0169  hypothetical protein  28.17 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.740062  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2163  hypothetical protein  32.12 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.096246  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1205  hypothetical protein  29.37 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.512169 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1746  hypothetical protein  33.1 
 
 
151 aa  61.6  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00225  hypothetical protein  26.24 
 
 
150 aa  55.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0178  hypothetical protein  27.59 
 
 
144 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2621  hypothetical protein  34.55 
 
 
151 aa  48.1  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.652955 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3555  hypothetical protein  26.95 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2698  hypothetical protein  30.12 
 
 
152 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>