42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1839 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1839  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  299  9e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.756028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2897  hypothetical protein  60.14 
 
 		 152 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0169773 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3187  hypothetical protein  40.52 
 
 		 155 aa  120  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455411  normal  0.995742 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2659  hypothetical protein  40.69 
 
 		 153 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.295349  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3966  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  39.22 
 
 		 151 aa  114  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0555539  normal  0.194961 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1122  hypothetical protein  38.1 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234261  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0359  hypothetical protein  38 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401814  normal  0.430905 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3135  hypothetical protein  37.41 
 
 		 150 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222956  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1001  hypothetical protein  34.46 
 
 		 154 aa  95.5  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026081 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36530  hypothetical protein  37.41 
 
 		 150 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00120253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2262  hypothetical protein  38.19 
 
 		 154 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132862  normal  0.0310926 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4357  hypothetical protein  37.91 
 
 		 155 aa  92  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1124  hypothetical protein  37.33 
 
 		 156 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221098  normal  0.514803 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1169  hypothetical protein  38.1 
 
 		 150 aa  90.1  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.200883 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5437  hypothetical protein  37.41 
 
 		 150 aa  87.8  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0831  hypothetical protein  36.91 
 
 		 158 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.521275  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1304  hypothetical protein  38.16 
 
 		 156 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.448465  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0797  hypothetical protein  36.24 
 
 		 179 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0820  hypothetical protein  36.42 
 
 		 158 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.169744 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4396  hypothetical protein  36.91 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.479325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1577  hypothetical protein  35.17 
 
 		 153 aa  84.3  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0627  hypothetical protein  31.69 
 
 		 153 aa  83.6  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1353  hypothetical protein  36.67 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6235  Protein of unknown function DUF2383  32.17 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2293  hypothetical protein  36.81 
 
 		 320 aa  80.5  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1593  hypothetical protein  36.18 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5302  hypothetical protein  30.87 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163208  normal  0.0551746 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0570  hypothetical protein  30.87 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07210  hypothetical protein  29.08 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04630  hypothetical protein  27.94 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1113  hypothetical protein  30.66 
 
 		 317 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2163  hypothetical protein  32.11 
 
 		 150 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.096246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5865  hypothetical protein  32 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1193  hypothetical protein  30.66 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1446  hypothetical protein  40 
 
 		 330 aa  57.8  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0760  Protein of unknown function DUF2383  27.69 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.462088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1746  hypothetical protein  29.14 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0169  hypothetical protein  24.09 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.740062  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1205  hypothetical protein  25 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512169 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2621  hypothetical protein  30.99 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.652955 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00225  hypothetical protein  26.81 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0178  hypothetical protein  22.63 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>