46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4357 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4357  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  321  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4396  hypothetical protein  67.3 
 
 		 158 aa  218  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.479325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0820  hypothetical protein  67.09 
 
 		 158 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.169744 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0797  hypothetical protein  67.09 
 
 		 179 aa  216  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0831  hypothetical protein  65.82 
 
 		 158 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.521275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2262  hypothetical protein  59.62 
 
 		 154 aa  186  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132862  normal  0.0310926 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1304  hypothetical protein  57.05 
 
 		 156 aa  179  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.448465  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1124  hypothetical protein  57.05 
 
 		 156 aa  175  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221098  normal  0.514803 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36530  hypothetical protein  55.78 
 
 		 150 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00120253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3135  hypothetical protein  55.1 
 
 		 150 aa  163  9e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222956  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5437  hypothetical protein  52.38 
 
 		 150 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1169  hypothetical protein  52.38 
 
 		 150 aa  150  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.200883 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2293  hypothetical protein  48.08 
 
 		 320 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1577  hypothetical protein  48.65 
 
 		 153 aa  141  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1353  hypothetical protein  51.37 
 
 		 148 aa  140  8e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1113  hypothetical protein  49.64 
 
 		 317 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1193  hypothetical protein  48.92 
 
 		 317 aa  135  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5865  hypothetical protein  45.99 
 
 		 321 aa  131  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0570  hypothetical protein  41.29 
 
 		 161 aa  131  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5302  hypothetical protein  42.86 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163208  normal  0.0551746 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1001  hypothetical protein  42.28 
 
 		 154 aa  122  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026081 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1593  hypothetical protein  42.67 
 
 		 148 aa  110  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1446  hypothetical protein  46.38 
 
 		 330 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2897  hypothetical protein  40 
 
 		 152 aa  104  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0169773 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2659  hypothetical protein  39.16 
 
 		 153 aa  104  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.295349  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3966  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  39.31 
 
 		 151 aa  103  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0555539  normal  0.194961 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1839  hypothetical protein  38.67 
 
 		 150 aa  96.3  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.756028  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04630  hypothetical protein  38.89 
 
 		 166 aa  92.8  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1122  hypothetical protein  35.33 
 
 		 160 aa  92.4  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234261  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2163  hypothetical protein  32.21 
 
 		 150 aa  90.9  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.096246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3187  hypothetical protein  37.5 
 
 		 155 aa  91.3  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455411  normal  0.995742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0760  Protein of unknown function DUF2383  32.06 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.462088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1746  hypothetical protein  33.56 
 
 		 151 aa  87.4  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6235  Protein of unknown function DUF2383  33.33 
 
 		 151 aa  86.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0169  hypothetical protein  29.73 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.740062  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0359  hypothetical protein  34.87 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401814  normal  0.430905 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2621  hypothetical protein  34.78 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.652955 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1205  hypothetical protein  30.2 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512169 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07210  hypothetical protein  30.5 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0627  hypothetical protein  26.03 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00225  hypothetical protein  26.53 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0178  hypothetical protein  26.06 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01766  hypothetical protein  31.73 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.756616  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3555  hypothetical protein  26.06 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2261  hypothetical protein  30 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0881857  normal  0.0318922 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4091  hypothetical protein  22.92 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>