49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5437 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5437  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  304  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1169  hypothetical protein  95.97 
 
 		 150 aa  291  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.200883 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5302  hypothetical protein  66.44 
 
 		 150 aa  216  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163208  normal  0.0551746 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36530  hypothetical protein  55.94 
 
 		 150 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00120253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3135  hypothetical protein  55.24 
 
 		 150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222956  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1124  hypothetical protein  54.73 
 
 		 156 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221098  normal  0.514803 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2262  hypothetical protein  55.4 
 
 		 154 aa  155  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132862  normal  0.0310926 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1113  hypothetical protein  54.07 
 
 		 317 aa  155  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1193  hypothetical protein  54.07 
 
 		 317 aa  154  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0570  hypothetical protein  50.35 
 
 		 161 aa  154  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2293  hypothetical protein  49.64 
 
 		 320 aa  151  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5865  hypothetical protein  51.11 
 
 		 321 aa  148  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1353  hypothetical protein  52.14 
 
 		 148 aa  147  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1577  hypothetical protein  47.48 
 
 		 153 aa  144  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0831  hypothetical protein  50.68 
 
 		 158 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.521275  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1304  hypothetical protein  48.65 
 
 		 156 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.448465  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4357  hypothetical protein  52 
 
 		 155 aa  141  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0820  hypothetical protein  50 
 
 		 158 aa  140  9e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.169744 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0797  hypothetical protein  50 
 
 		 179 aa  140  9e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4396  hypothetical protein  47.65 
 
 		 158 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.479325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1446  hypothetical protein  53.68 
 
 		 330 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1001  hypothetical protein  45.21 
 
 		 154 aa  134  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026081 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2163  hypothetical protein  38.41 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.096246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1593  hypothetical protein  46.15 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0169  hypothetical protein  38.41 
 
 		 150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.740062  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2659  hypothetical protein  37.75 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.295349  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3966  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  38.03 
 
 		 151 aa  100  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0555539  normal  0.194961 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1122  hypothetical protein  36.24 
 
 		 160 aa  96.7  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234261  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3187  hypothetical protein  32.67 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455411  normal  0.995742 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2897  hypothetical protein  37.67 
 
 		 152 aa  94.4  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0169773 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1205  hypothetical protein  36.23 
 
 		 150 aa  92.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512169 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0359  hypothetical protein  38.26 
 
 		 154 aa  92  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401814  normal  0.430905 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07210  hypothetical protein  34.04 
 
 		 158 aa  89.7  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1839  hypothetical protein  37.41 
 
 		 150 aa  87.8  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.756028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0760  Protein of unknown function DUF2383  35.16 
 
 		 151 aa  87  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.462088  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04630  hypothetical protein  31.25 
 
 		 166 aa  82  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0627  hypothetical protein  31.91 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1746  hypothetical protein  35.29 
 
 		 151 aa  80.1  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00225  hypothetical protein  27.97 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2621  hypothetical protein  35.04 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.652955 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6235  Protein of unknown function DUF2383  31.58 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3555  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0178  hypothetical protein  29.71 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01766  hypothetical protein  33.83 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.756616  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0271  hypothetical protein  26.92 
 
 		 175 aa  53.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000678514 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2261  hypothetical protein  23.36 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0881857  normal  0.0318922 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4091  hypothetical protein  23.78 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2525  hypothetical protein  30.7 
 
 		 187 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1244  hypothetical protein  27.78 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0835823  unclonable  0.0000000177159 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>