38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01766 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01766  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  308  1e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.756616  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3555  hypothetical protein  68 
 
 
150 aa  199  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0178  hypothetical protein  43.26 
 
 
144 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5437  hypothetical protein  33.83 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5302  hypothetical protein  32.87 
 
 
150 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163208  normal  0.0551746 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1122  hypothetical protein  29.25 
 
 
160 aa  62.8  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234261  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1001  hypothetical protein  27.27 
 
 
154 aa  62  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026081 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1169  hypothetical protein  32.33 
 
 
150 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.200883 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0239  hypothetical protein  27.4 
 
 
150 aa  60.5  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0694934  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4091  hypothetical protein  27.13 
 
 
147 aa  59.7  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1205  hypothetical protein  26.81 
 
 
150 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.512169 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0271  hypothetical protein  27.48 
 
 
175 aa  57.8  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000678514 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0797  hypothetical protein  32.35 
 
 
179 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0359  hypothetical protein  32.35 
 
 
154 aa  54.7  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401814  normal  0.430905 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4396  hypothetical protein  31.37 
 
 
158 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.479325  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0820  hypothetical protein  31.37 
 
 
158 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.169744 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3966  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  27.61 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0555539  normal  0.194961 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4357  hypothetical protein  29.58 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0570  hypothetical protein  26.24 
 
 
161 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2293  hypothetical protein  26.95 
 
 
320 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0831  hypothetical protein  31.37 
 
 
158 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.521275  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1577  hypothetical protein  28.06 
 
 
153 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3187  hypothetical protein  30.51 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455411  normal  0.995742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0627  hypothetical protein  25.4 
 
 
153 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1353  hypothetical protein  28.57 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1593  hypothetical protein  24.43 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0760  Protein of unknown function DUF2383  23.73 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.462088  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3148  hypothetical protein  30 
 
 
148 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.486705 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3419  hypothetical protein  27.27 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.939671  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6198  hypothetical protein  27.27 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.697848  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1124  hypothetical protein  25.89 
 
 
156 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221098  normal  0.514803 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1113  hypothetical protein  28.03 
 
 
317 aa  44.7  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1193  hypothetical protein  28.03 
 
 
317 aa  43.9  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1304  hypothetical protein  27.68 
 
 
156 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.448465  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2897  hypothetical protein  23.29 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0169773 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2163  hypothetical protein  23.02 
 
 
150 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.096246  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0064  hypothetical protein  27.87 
 
 
182 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0169  hypothetical protein  27.4 
 
 
150 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.740062  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>