27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4091 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4091  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  303  6e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0239  hypothetical protein  46.04 
 
 		 150 aa  125  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0694934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0271  hypothetical protein  29.08 
 
 		 175 aa  89.4  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000678514 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1353  hypothetical protein  28.28 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001935  hypothetical protein  27.54 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0178  hypothetical protein  26.81 
 
 		 144 aa  62  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1205  hypothetical protein  26.21 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512169 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2293  hypothetical protein  22.63 
 
 		 320 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1001  hypothetical protein  24.66 
 
 		 154 aa  53.5  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026081 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3555  hypothetical protein  23.78 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1304  hypothetical protein  27.34 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.448465  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0797  hypothetical protein  28.21 
 
 		 179 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0570  hypothetical protein  27.54 
 
 		 161 aa  51.6  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0820  hypothetical protein  28.21 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.169744 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5865  hypothetical protein  26.5 
 
 		 321 aa  51.2  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0831  hypothetical protein  27.85 
 
 		 158 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.521275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5302  hypothetical protein  25 
 
 		 150 aa  50.8  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163208  normal  0.0551746 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4396  hypothetical protein  25 
 
 		 158 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.479325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5437  hypothetical protein  23.78 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1113  hypothetical protein  22.5 
 
 		 317 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2262  hypothetical protein  21.9 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132862  normal  0.0310926 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01766  hypothetical protein  26.52 
 
 		 151 aa  45.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.756616  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1193  hypothetical protein  22.5 
 
 		 317 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3966  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  25.71 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0555539  normal  0.194961 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1593  hypothetical protein  22.38 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1577  hypothetical protein  18.62 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1124  hypothetical protein  25 
 
 		 156 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221098  normal  0.514803 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>