37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0178 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0178  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  291  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3555  hypothetical protein  43.62 
 
 		 150 aa  103  9e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01766  hypothetical protein  43.26 
 
 		 151 aa  100  9e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.756616  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1577  hypothetical protein  30.88 
 
 		 153 aa  72  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1001  hypothetical protein  31.11 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026081 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0239  hypothetical protein  31.72 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0694934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0271  hypothetical protein  27.54 
 
 		 175 aa  64.7  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000678514 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1122  hypothetical protein  32.59 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234261  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0359  hypothetical protein  31.39 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401814  normal  0.430905 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1169  hypothetical protein  30.43 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.200883 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4091  hypothetical protein  26.81 
 
 		 147 aa  62  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3966  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  31.39 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0555539  normal  0.194961 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5437  hypothetical protein  29.71 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3187  hypothetical protein  31.85 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455411  normal  0.995742 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1205  hypothetical protein  28.78 
 
 		 150 aa  57  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512169 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2659  hypothetical protein  29.2 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.295349  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5302  hypothetical protein  30.88 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163208  normal  0.0551746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0831  hypothetical protein  25.87 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.521275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4396  hypothetical protein  24.11 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.479325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1113  hypothetical protein  26.32 
 
 		 317 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1193  hypothetical protein  28.89 
 
 		 317 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0797  hypothetical protein  24.11 
 
 		 179 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1124  hypothetical protein  23.91 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221098  normal  0.514803 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0820  hypothetical protein  24.11 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.169744 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4357  hypothetical protein  24.64 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2897  hypothetical protein  27.59 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0169773 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001935  hypothetical protein  24.11 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0760  Protein of unknown function DUF2383  24.77 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.462088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0627  hypothetical protein  25.74 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5865  hypothetical protein  28.03 
 
 		 321 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0570  hypothetical protein  22.46 
 
 		 161 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3135  hypothetical protein  23.13 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222956  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1353  hypothetical protein  22.7 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1839  hypothetical protein  22.63 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.756028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2621  hypothetical protein  26.17 
 
 		 151 aa  42  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.652955 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36530  hypothetical protein  22.39 
 
 		 150 aa  41.2  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00120253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2293  hypothetical protein  23.57 
 
 		 320 aa  40  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>