16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2525 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2525  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  384  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778896  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04630  hypothetical protein  26.32 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1593  hypothetical protein  26.88 
 
 		 148 aa  51.6  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1205  hypothetical protein  27.72 
 
 		 150 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512169 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00225  hypothetical protein  27.21 
 
 		 150 aa  50.1  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1113  hypothetical protein  30.56 
 
 		 317 aa  47  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1193  hypothetical protein  30.56 
 
 		 317 aa  46.2  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2293  hypothetical protein  25.16 
 
 		 320 aa  45.4  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1353  hypothetical protein  29.57 
 
 		 148 aa  45.4  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1169  hypothetical protein  33.9 
 
 		 150 aa  44.7  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.200883 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5437  hypothetical protein  30.7 
 
 		 150 aa  44.7  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07210  hypothetical protein  27.68 
 
 		 158 aa  45.1  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1001  hypothetical protein  31.11 
 
 		 154 aa  43.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026081 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2621  hypothetical protein  29.25 
 
 		 151 aa  43.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.652955 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2262  hypothetical protein  27.27 
 
 		 154 aa  42.4  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132862  normal  0.0310926 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1577  hypothetical protein  28.18 
 
 		 153 aa  42  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>