More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2856 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2856  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  473  1e-133  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4311  hypothetical protein  53.07 
 
 
235 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1664  hypothetical protein  51.53 
 
 
239 aa  236  3e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1580  hypothetical protein  51.79 
 
 
232 aa  230  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3459  CTP synthase domain protein  51.1 
 
 
244 aa  226  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3700  hypothetical protein  49.78 
 
 
230 aa  225  6e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3240  hypothetical protein  51.34 
 
 
240 aa  224  7e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0678648  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2971  hypothetical protein  49.12 
 
 
356 aa  218  7e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35240  hypothetical protein  48.68 
 
 
356 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.788403 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4426  hypothetical protein  44.93 
 
 
232 aa  206  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0226053  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4529  CTP synthase  41.63 
 
 
251 aa  168  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271977  normal  0.613298 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1183  CTP synthase  30.71 
 
 
535 aa  124  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0724747  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2015  CTP synthase  33.2 
 
 
565 aa  121  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508259  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0228  CTP synthetase  33.05 
 
 
531 aa  120  9.999999999999999e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0116565 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0760  CTP synthase  35.86 
 
 
562 aa  117  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1393  CTP synthetase  35.47 
 
 
550 aa  115  6e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.438798  normal  0.174623 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2717  CTP synthase  34.16 
 
 
568 aa  115  7.999999999999999e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0427  CTP synthetase  35 
 
 
552 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.441516  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0333  CTP synthetase  35.15 
 
 
542 aa  111  8.000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2594  CTP synthetase  35.86 
 
 
551 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.693911  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2712  CTP synthase  33.19 
 
 
563 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0027  CTP synthetase  28.8 
 
 
543 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2140  CTP synthetase  33.04 
 
 
526 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0157  CTP synthetase  32.37 
 
 
539 aa  110  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.337203  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0054  CTP synthetase  28.8 
 
 
543 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2383  CTP synthetase  27.87 
 
 
537 aa  108  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.508995  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0862  CTP synthetase  34.84 
 
 
546 aa  108  6e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0878  CTP synthetase  29.29 
 
 
528 aa  108  6e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0012  CTP synthetase  28.57 
 
 
545 aa  107  1e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0029  CTP synthetase  28.4 
 
 
543 aa  107  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2536  CTP synthetase  30.77 
 
 
539 aa  105  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1487  CTP synthase  32.39 
 
 
558 aa  105  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.883119  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0799  CTP synthetase  28.09 
 
 
530 aa  105  6e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000239863 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0134  CTP synthetase  28.28 
 
 
541 aa  105  7e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  31.98 
 
 
531 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0045  CTP synthase  30.84 
 
 
546 aa  104  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1984  CTP synthetase  30 
 
 
531 aa  104  1e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  29.39 
 
 
535 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  29.39 
 
 
535 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  31.98 
 
 
535 aa  104  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  28.87 
 
 
534 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  33.47 
 
 
551 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08471  CTP synthetase  27.66 
 
 
539 aa  103  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.859496  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  34.13 
 
 
533 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  30.42 
 
 
534 aa  103  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0070  CTP synthetase  34.63 
 
 
525 aa  103  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1955  CTP synthetase  29.79 
 
 
530 aa  102  4e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1899  CTP synthetase  31.78 
 
 
529 aa  102  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2528  CTP synthetase  37.27 
 
 
527 aa  102  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2240  CTP synthase  29.03 
 
 
538 aa  102  6e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.480031  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1439  CTP synthase  32.78 
 
 
545 aa  102  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  31.58 
 
 
531 aa  101  9e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6612  CTP synthetase  30.71 
 
 
550 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174922  hitchhiker  0.00487095 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  31.8 
 
 
532 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0071  CTP synthase  29.41 
 
 
559 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  31.17 
 
 
535 aa  99.8  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  31.17 
 
 
535 aa  99.8  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  31.17 
 
 
535 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1262  CTP synthetase  29.84 
 
 
543 aa  99.4  5e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  31.17 
 
 
535 aa  99.4  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3141  CTP synthetase  32.22 
 
 
572 aa  99.4  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151944  normal  0.766797 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  31.17 
 
 
535 aa  99  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  31.17 
 
 
535 aa  99  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  31.17 
 
 
535 aa  99  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  31.17 
 
 
535 aa  99  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2586  CTP synthetase  29.63 
 
 
538 aa  98.6  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0528943 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1134  CTP synthetase  33.33 
 
 
527 aa  98.2  9e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  31.17 
 
 
535 aa  98.2  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0919  CTP synthetase  25.32 
 
 
533 aa  98.2  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  30.65 
 
 
535 aa  97.8  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  29.46 
 
 
536 aa  97.1  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0791  CTP synthase  29.49 
 
 
534 aa  97.4  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  28.03 
 
 
536 aa  97.4  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  28.03 
 
 
536 aa  97.4  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  30.77 
 
 
535 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1151  CTP synthetase  26.75 
 
 
554 aa  97.4  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.485284  normal  0.0237518 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1730  CTP synthase  33.63 
 
 
555 aa  96.7  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1716  CTP synthase  29.17 
 
 
545 aa  96.7  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1754  CTP synthetase  25.2 
 
 
546 aa  96.3  3e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1243  CTP synthetase  29.15 
 
 
543 aa  95.9  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.381709  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1282  CTP synthetase  30.61 
 
 
534 aa  96.3  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2035  CTP synthase  27.82 
 
 
533 aa  96.3  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00063614  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1472  CTP synthase  30.65 
 
 
555 aa  95.5  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38810  CTP synthetase  27.42 
 
 
543 aa  95.1  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  29.88 
 
 
542 aa  95.1  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25420  CTP synthetase  29.37 
 
 
566 aa  95.5  7e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.199429 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1291  CTP synthetase  31.22 
 
 
555 aa  95.1  8e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  31.45 
 
 
537 aa  95.1  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21631  CTP synthetase  31.22 
 
 
555 aa  95.1  8e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.397558 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29581  CTP synthetase  30.33 
 
 
558 aa  94.4  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1190  CTP synthetase  28.98 
 
 
545 aa  94.4  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14180  CTP synthetase  33.62 
 
 
563 aa  94.7  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.609851  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1887  CTP synthetase  28.57 
 
 
542 aa  94.4  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.424468  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0123  CTP synthetase  29.66 
 
 
524 aa  94.4  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000806714  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1408  CTP synthetase  29.51 
 
 
542 aa  94.7  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0617949  hitchhiker  0.0000124662 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  29.96 
 
 
541 aa  94.7  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0125  CTP synthetase  31.09 
 
 
524 aa  94  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000107739  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  28.27 
 
 
534 aa  93.6  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0662  CTP synthetase  28.86 
 
 
549 aa  93.6  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  28.57 
 
 
547 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>