More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1945 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  59.32 
 
 		 533 aa  671    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3086  CTP synthetase  56.93 
 
 		 545 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35033  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  73.72 
 
 		 536 aa  842    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  57.01 
 
 		 542 aa  655    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1727  CTP synthetase  71.35 
 
 		 535 aa  786    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  56.95 
 
 		 535 aa  639    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2513  CTP synthetase  59.44 
 
 		 552 aa  659    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294945  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0052  CTP synthetase  58.98 
 
 		 554 aa  678    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3137  CTP synthetase  56.01 
 
 		 545 aa  637    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000110473  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  56.6 
 
 		 535 aa  639    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5202  CTP synthetase  60.04 
 
 		 542 aa  640    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.893159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  59.32 
 
 		 542 aa  671    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  56.2 
 
 		 536 aa  642    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3441  CTP synthetase  56.75 
 
 		 546 aa  642    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1552  CTP synthase  57.33 
 
 		 543 aa  642    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.873983  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  56.6 
 
 		 535 aa  640    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  56.42 
 
 		 535 aa  638    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  56.42 
 
 		 535 aa  639    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1563  CTP synthetase  60.54 
 
 		 534 aa  682    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1184  CTP synthetase  58.23 
 
 		 545 aa  647    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1190  CTP synthetase  58.04 
 
 		 545 aa  649    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1361  CTP synthetase  57.33 
 
 		 543 aa  642    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0802006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1641  CTP synthetase  57.17 
 
 		 544 aa  636    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.118223  hitchhiker  0.0000254043 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2366  CTP synthetase  62.48 
 
 		 546 aa  698    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.863535  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3156  CTP synthetase  58.66 
 
 		 542 aa  637    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.11737  normal  0.0821196 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  56.6 
 
 		 535 aa  643    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  58.71 
 
 		 545 aa  642    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2845  CTP synthetase  57.46 
 
 		 555 aa  635    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0619  CTP synthetase  63.59 
 
 		 546 aa  699    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.626167  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1298  CTP synthetase  57.64 
 
 		 544 aa  634    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  57.55 
 
 		 545 aa  640    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  57.52 
 
 		 533 aa  642    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0850  CTP synthetase  57.62 
 
 		 550 aa  652    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1119  CTP synthetase  57.51 
 
 		 543 aa  652    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  100 
 
 		 534 aa  1100    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3111  CTP synthetase  56.93 
 
 		 545 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  57.93 
 
 		 542 aa  656    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  57.01 
 
 		 542 aa  655    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1441  CTP synthetase  59.16 
 
 		 553 aa  644    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  75.28 
 
 		 538 aa  858    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  62.92 
 
 		 548 aa  710    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1262  CTP synthetase  61.9 
 
 		 543 aa  680    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  56.6 
 
 		 535 aa  640    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  58.46 
 
 		 533 aa  642    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  57.77 
 
 		 546 aa  647    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1227  CTP synthetase  60.89 
 
 		 566 aa  659    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  65.09 
 
 		 555 aa  726    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  59.74 
 
 		 537 aa  663    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  57.01 
 
 		 542 aa  655    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  66.79 
 
 		 555 aa  731    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3128  CTP synthetase  56.01 
 
 		 545 aa  637    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000112535  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3169  CTP synthetase  56.93 
 
 		 545 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0659472  normal  0.252968 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3234  CTP synthetase  56.93 
 
 		 545 aa  637    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  0.167491 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1872  CTP synthetase  60.82 
 
 		 555 aa  670    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1439  CTP synthetase  60.04 
 
 		 551 aa  667    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0767506  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2758  CTP synthetase  56.19 
 
 		 545 aa  639    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000221418  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1243  CTP synthetase  57.2 
 
 		 543 aa  654    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  59.77 
 
 		 533 aa  669    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1911  CTP synthetase  62.27 
 
 		 542 aa  695    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.884152  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  58.08 
 
 		 533 aa  641    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1571  CTP synthetase  58.42 
 
 		 557 aa  638    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.465584  normal  0.494207 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1195  CTP synthetase  57.12 
 
 		 545 aa  640    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.111429  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  61.25 
 
 		 540 aa  676    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0617  CTP synthetase  58.08 
 
 		 548 aa  640    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  57.84 
 
 		 543 aa  647    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1875  CTP synthetase  56.99 
 
 		 544 aa  637    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000103989 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2383  CTP synthetase  55.91 
 
 		 537 aa  639    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.508995  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4305  CTP synthetase  66.6 
 
 		 555 aa  729    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  61.99 
 
 		 558 aa  707    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1511  CTP synthetase  62.36 
 
 		 547 aa  707    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174656  decreased coverage  0.000112124 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1184  CTP synthetase  57.12 
 
 		 546 aa  635    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0154566  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  56.64 
 
 		 542 aa  649    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300969 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  63.33 
 
 		 553 aa  722    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  57.22 
 
 		 534 aa  644    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1600  CTP synthetase  71.86 
 
 		 533 aa  806    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2536  CTP synthetase  57.01 
 
 		 539 aa  644    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  57.25 
 
 		 535 aa  643    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  57.25 
 
 		 535 aa  643    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0552  CTP synthetase  57.36 
 
 		 542 aa  642    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3150  CTP synthetase  56.93 
 
 		 545 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0858121  normal  0.288938 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1114  CTP synthetase  56.56 
 
 		 546 aa  639    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000131384  normal  0.869869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1185  CTP synthetase  56.38 
 
 		 546 aa  639    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000285694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  59.81 
 
 		 540 aa  671    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2562  CTP synthetase  58.24 
 
 		 557 aa  636    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.542571  normal  0.0982923 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  58.54 
 
 		 542 aa  669    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1408  CTP synthetase  58.88 
 
 		 542 aa  650    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0617949  hitchhiker  0.0000124662 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3280  CTP synthetase  56.01 
 
 		 545 aa  637    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000222232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  57.93 
 
 		 542 aa  656    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2979  CTP synthetase  73.72 
 
 		 534 aa  818    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.535852  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2887  CTP synthetase  58.76 
 
 		 537 aa  635    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1093  CTP synthetase  55.98 
 
 		 533 aa  647    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  66.79 
 
 		 557 aa  749    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1557  CTP synthetase  60.52 
 
 		 547 aa  671    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.591143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1115  CTP synthetase  56.56 
 
 		 546 aa  639    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000891455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0320  CTP synthetase  60.45 
 
 		 555 aa  665    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1614  CTP synthetase  73.53 
 
 		 535 aa  792    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.23037  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  56.2 
 
 		 536 aa  642    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3267  CTP synthetase  56.93 
 
 		 545 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0428959 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1035  CTP synthetase  57.3 
 
 		 545 aa  639    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.946581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0668  CTP synthetase  55.82 
 
 		 545 aa  637    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00226842  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>