More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4311 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4311  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  478  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3459  CTP synthase domain protein  56.03 
 
 		 244 aa  259  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3240  hypothetical protein  57.46 
 
 		 240 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0678648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2971  hypothetical protein  54.67 
 
 		 356 aa  249  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35240  hypothetical protein  54.67 
 
 		 356 aa  248  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.788403 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2856  hypothetical protein  53.07 
 
 		 231 aa  244  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1664  hypothetical protein  52.89 
 
 		 239 aa  239  2.9999999999999997e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3700  hypothetical protein  51.56 
 
 		 230 aa  236  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4426  hypothetical protein  48.25 
 
 		 232 aa  228  8e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0226053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1580  hypothetical protein  50.22 
 
 		 232 aa  208  6e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4529  CTP synthase  46.15 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271977  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2712  CTP synthase  33.61 
 
 		 563 aa  124  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0228  CTP synthetase  32.64 
 
 		 531 aa  115  6.9999999999999995e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0116565 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0662  CTP synthetase  30.31 
 
 		 549 aa  104  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0012  CTP synthetase  27.38 
 
 		 545 aa  103  3e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0791  CTP synthase  35.05 
 
 		 534 aa  101  8e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0027  CTP synthetase  26.88 
 
 		 543 aa  101  9e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0054  CTP synthetase  26.88 
 
 		 543 aa  101  9e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  33.2 
 
 		 532 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0134  CTP synthetase  27.53 
 
 		 541 aa  100  2e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0029  CTP synthetase  26.88 
 
 		 543 aa  100  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  29.63 
 
 		 531 aa  99.4  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0325  CTP synthetase  30.24 
 
 		 534 aa  99.4  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000736967  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0862  CTP synthetase  34.27 
 
 		 546 aa  99.8  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6612  CTP synthetase  29.96 
 
 		 550 aa  99  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174922  hitchhiker  0.00487095 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0333  CTP synthetase  30.54 
 
 		 542 aa  99  6e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  30.04 
 
 		 531 aa  98.2  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1183  CTP synthase  27.27 
 
 		 535 aa  97.4  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0724747  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3181  CTP synthetase  28.85 
 
 		 547 aa  97.1  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.482242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2744  CTP synthetase  29.64 
 
 		 547 aa  97.1  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0124584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2015  CTP synthase  29.27 
 
 		 565 aa  96.3  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2536  CTP synthetase  27.69 
 
 		 539 aa  95.9  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  27.5 
 
 		 535 aa  95.1  7e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  29.15 
 
 		 536 aa  94.7  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1899  CTP synthetase  32.16 
 
 		 529 aa  94.7  9e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1190  CTP synthetase  28.52 
 
 		 545 aa  94.7  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1134  CTP synthetase  32.42 
 
 		 527 aa  94.7  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0045  CTP synthase  29.76 
 
 		 546 aa  94.4  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0230  CTP synthetase  27.64 
 
 		 534 aa  94.7  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181921  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1716  CTP synthase  30.04 
 
 		 545 aa  94.4  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  30.08 
 
 		 533 aa  93.6  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2717  CTP synthase  29.8 
 
 		 568 aa  94.4  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  29.39 
 
 		 535 aa  93.2  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2140  CTP synthetase  33.49 
 
 		 526 aa  93.6  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1262  CTP synthetase  28.46 
 
 		 543 aa  92.8  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1184  CTP synthetase  28.12 
 
 		 545 aa  92.4  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0919  CTP synthetase  24.18 
 
 		 533 aa  92.4  5e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  29.34 
 
 		 533 aa  92  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0157  CTP synthetase  28.74 
 
 		 539 aa  91.7  9e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.337203  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38810  CTP synthetase  28.24 
 
 		 543 aa  91.7  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1552  CTP synthase  29.15 
 
 		 543 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.873983  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1361  CTP synthetase  29.15 
 
 		 543 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0802006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4200  CTP synthetase  28.46 
 
 		 542 aa  91.3  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.525149 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2586  CTP synthetase  28.16 
 
 		 538 aa  91.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0528943 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0873  CTP synthetase  28.46 
 
 		 547 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.666117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0760  CTP synthase  31.71 
 
 		 562 aa  91.3  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0608  CTP synthetase  29.96 
 
 		 553 aa  91.7  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.235124  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08471  CTP synthetase  27.31 
 
 		 539 aa  91.3  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.859496  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1754  CTP synthetase  23.53 
 
 		 546 aa  90.9  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  28.98 
 
 		 535 aa  90.9  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0040  CTP synthase  25.82 
 
 		 531 aa  90.1  3e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  28.57 
 
 		 535 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0070  CTP synthetase  34.26 
 
 		 525 aa  90.1  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0368  CTP synthetase  27.67 
 
 		 547 aa  89.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2084  CTP synthetase  25.91 
 
 		 544 aa  89.7  3e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0736609  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  28.98 
 
 		 535 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  27.92 
 
 		 542 aa  90.1  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  28.98 
 
 		 535 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  28.8 
 
 		 542 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  28.98 
 
 		 535 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  28.8 
 
 		 542 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  28.8 
 
 		 542 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0028  CTP synthetase  27.42 
 
 		 534 aa  89.4  4e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.23296  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  28.98 
 
 		 535 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2012  CTP synthetase  27.67 
 
 		 547 aa  89.7  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00909929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1151  CTP synthetase  25.42 
 
 		 554 aa  89.4  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.485284  normal  0.0237518 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  28.57 
 
 		 535 aa  89  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  29.2 
 
 		 542 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300969 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  30.08 
 
 		 535 aa  89.4  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  30.08 
 
 		 535 aa  89.4  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  28.46 
 
 		 533 aa  89  7e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  27.76 
 
 		 535 aa  88.6  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  27.76 
 
 		 535 aa  88.6  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0519  CTP synthetase  28.69 
 
 		 537 aa  88.2  9e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.354414  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  29.67 
 
 		 535 aa  88.6  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0525  CTP synthetase  27.46 
 
 		 539 aa  88.2  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.693312 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2528  CTP synthetase  31.53 
 
 		 527 aa  88.2  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  25.83 
 
 		 536 aa  87.4  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  27.64 
 
 		 533 aa  87.4  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1782  CTP synthetase  27.08 
 
 		 536 aa  87  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  25.83 
 
 		 536 aa  87.4  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1325  CTP synthetase  28.1 
 
 		 536 aa  87.4  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00186219  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0171  CTP synthetase  27.46 
 
 		 532 aa  87.4  2e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1387  CTP synthetase  29.54 
 
 		 549 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  27.45 
 
 		 543 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0908  CTP synthetase  24.7 
 
 		 544 aa  87.4  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18991  CTP synthetase  27.85 
 
 		 536 aa  87.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.433411  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  27.64 
 
 		 534 aa  86.3  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5202  CTP synthetase  29.44 
 
 		 542 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.893159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  28.57 
 
 		 542 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>