More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0333 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0878  CTP synthetase  62.05 
 
 
528 aa  684    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1955  CTP synthetase  63.4 
 
 
530 aa  696    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1984  CTP synthetase  62.62 
 
 
531 aa  695    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0333  CTP synthetase  100 
 
 
542 aa  1113    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0799  CTP synthetase  60.91 
 
 
530 aa  675    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000239863 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1183  CTP synthase  54.92 
 
 
535 aa  595  1e-169  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0724747  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0791  CTP synthase  53.96 
 
 
534 aa  584  1.0000000000000001e-165  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0228  CTP synthetase  56.02 
 
 
531 aa  582  1.0000000000000001e-165  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0116565 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  52.16 
 
 
533 aa  570  1e-161  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  51.78 
 
 
533 aa  567  1e-160  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  52.64 
 
 
547 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  52.16 
 
 
531 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1730  CTP synthase  53.26 
 
 
555 aa  564  1.0000000000000001e-159  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  51.42 
 
 
533 aa  561  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0071  CTP synthase  52.26 
 
 
559 aa  558  1e-158  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  51.03 
 
 
541 aa  560  1e-158  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  51.41 
 
 
533 aa  561  1e-158  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  50.47 
 
 
542 aa  551  1e-156  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  52.26 
 
 
537 aa  553  1e-156  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  51.41 
 
 
531 aa  553  1e-156  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  50.66 
 
 
536 aa  549  1e-155  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1563  CTP synthetase  51.69 
 
 
534 aa  550  1e-155  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1282  CTP synthetase  50.66 
 
 
534 aa  546  1e-154  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  51.32 
 
 
533 aa  548  1e-154  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2586  CTP synthetase  49.06 
 
 
538 aa  545  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0528943 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1743  CTP synthetase  51.7 
 
 
547 aa  547  1e-154  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0432346  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3115  CTP synthetase  51.32 
 
 
557 aa  541  1e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000124409  hitchhiker  0.00148298 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0827  CTP synthetase  50.47 
 
 
553 aa  543  1e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.471877  normal  0.577462 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2536  CTP synthetase  50 
 
 
539 aa  542  1e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  50.47 
 
 
535 aa  544  1e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  50.47 
 
 
535 aa  544  1e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1439  CTP synthase  52.89 
 
 
545 aa  544  1e-153  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0862  CTP synthetase  49.91 
 
 
546 aa  542  1e-153  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1093  CTP synthetase  49.72 
 
 
533 aa  541  1e-153  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0028  CTP synthetase  48.78 
 
 
534 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.23296  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  49.25 
 
 
535 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  49.25 
 
 
535 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  49.25 
 
 
535 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  51.7 
 
 
555 aa  540  9.999999999999999e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  50.28 
 
 
534 aa  538  9.999999999999999e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  50.19 
 
 
535 aa  536  1e-151  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  48.68 
 
 
535 aa  535  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21631  CTP synthetase  49.34 
 
 
555 aa  535  1e-151  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.397558 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  48.87 
 
 
535 aa  535  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  48.87 
 
 
535 aa  536  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  49.53 
 
 
534 aa  537  1e-151  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1291  CTP synthetase  49.34 
 
 
555 aa  535  1e-151  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0919  CTP synthetase  50.28 
 
 
533 aa  537  1e-151  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1262  CTP synthetase  50.55 
 
 
543 aa  538  1e-151  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  48.87 
 
 
535 aa  536  1e-151  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  48.87 
 
 
535 aa  536  1e-151  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  48.68 
 
 
535 aa  535  1e-151  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  48.87 
 
 
535 aa  536  1e-151  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  48.5 
 
 
535 aa  535  1e-150  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  49.25 
 
 
536 aa  533  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1325  CTP synthetase  50.84 
 
 
536 aa  533  1e-150  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00186219  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  49.35 
 
 
535 aa  534  1e-150  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  49.25 
 
 
536 aa  533  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1135  CTP synthetase  50.57 
 
 
535 aa  533  1e-150  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  49.25 
 
 
532 aa  531  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  49.72 
 
 
542 aa  532  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  49.72 
 
 
536 aa  528  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2692  CTP synthetase  48.22 
 
 
536 aa  531  1e-149  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2513  CTP synthetase  49.27 
 
 
552 aa  528  1e-149  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294945  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  49.53 
 
 
540 aa  530  1e-149  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1182  CTP synthetase  50.92 
 
 
547 aa  530  1e-149  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2235  CTP synthetase  49.72 
 
 
549 aa  529  1e-149  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0427  CTP synthetase  49.91 
 
 
552 aa  529  1e-149  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.441516  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  48.7 
 
 
546 aa  531  1e-149  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0174  CTP synthetase  49.17 
 
 
542 aa  531  1e-149  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.472124  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22080  CTP synthase  49.72 
 
 
554 aa  530  1e-149  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202828  normal  0.968992 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  50.19 
 
 
551 aa  531  1e-149  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  47.7 
 
 
542 aa  531  1e-149  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  48.8 
 
 
542 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  49.53 
 
 
558 aa  527  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2751  CTP synthase  49.43 
 
 
555 aa  525  1e-148  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0184273 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29581  CTP synthetase  49.06 
 
 
558 aa  526  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0320  CTP synthetase  49.45 
 
 
555 aa  526  1e-148  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3518  CTP synthetase  51.24 
 
 
534 aa  525  1e-148  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0204135  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  49.06 
 
 
545 aa  526  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  48.8 
 
 
542 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1151  CTP synthetase  47.65 
 
 
554 aa  526  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.485284  normal  0.0237518 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08471  CTP synthetase  48.96 
 
 
539 aa  526  1e-148  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.859496  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1872  CTP synthetase  49.45 
 
 
555 aa  526  1e-148  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  50.28 
 
 
540 aa  526  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0662  CTP synthetase  50.55 
 
 
549 aa  526  1e-148  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1393  CTP synthetase  49.81 
 
 
550 aa  528  1e-148  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.438798  normal  0.174623 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  50.09 
 
 
545 aa  525  1e-148  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5105  CTP synthetase  48.56 
 
 
552 aa  523  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1250  CTP synthase  48.5 
 
 
530 aa  524  1e-147  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  48.96 
 
 
534 aa  524  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2598  CTP synthetase  49.15 
 
 
549 aa  524  1e-147  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0553655  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  48.61 
 
 
542 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1472  CTP synthase  50.28 
 
 
555 aa  523  1e-147  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2383  CTP synthetase  48.78 
 
 
537 aa  522  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.508995  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1387  CTP synthetase  48.6 
 
 
549 aa  519  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0027  CTP synthetase  48.88 
 
 
543 aa  519  1e-146  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0619  CTP synthetase  49.63 
 
 
546 aa  518  1e-146  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.626167  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2887  CTP synthetase  48.5 
 
 
537 aa  521  1e-146  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1911  CTP synthetase  50 
 
 
542 aa  521  1e-146  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.884152  normal  0.767011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>