More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1448 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  62.64 
 
 
532 aa  703    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1410  CTP synthetase  58.2 
 
 
544 aa  639    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0373811  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  60.23 
 
 
535 aa  681    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  58.68 
 
 
536 aa  655    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  64.2 
 
 
541 aa  711    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  57.94 
 
 
535 aa  653    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25420  CTP synthetase  61.04 
 
 
566 aa  653    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.199429 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  60.46 
 
 
534 aa  668    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  60.23 
 
 
535 aa  681    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  60.04 
 
 
535 aa  679    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0107  CTP synthetase  56.42 
 
 
534 aa  641    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0171408  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08750  CTP synthetase  59.47 
 
 
535 aa  651    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  unclonable  0.00000000194145 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  58.05 
 
 
533 aa  649    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  63.52 
 
 
533 aa  698    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  60.41 
 
 
535 aa  683    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  60.04 
 
 
535 aa  680    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  62.95 
 
 
531 aa  701    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  60.23 
 
 
535 aa  681    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22080  CTP synthase  61.19 
 
 
554 aa  657    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202828  normal  0.968992 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1217  CTP synthetase  58.75 
 
 
544 aa  642    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3115  CTP synthetase  62.11 
 
 
557 aa  685    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000124409  hitchhiker  0.00148298 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1387  CTP synthetase  61.81 
 
 
549 aa  646    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29581  CTP synthetase  59.41 
 
 
558 aa  649    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1199  CTP synthetase  61.27 
 
 
581 aa  660    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.129574  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1291  CTP synthetase  59.89 
 
 
555 aa  648    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  61.74 
 
 
533 aa  698    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2785  CTP synthetase  62.05 
 
 
538 aa  688    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963897  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1487  CTP synthase  62 
 
 
558 aa  654    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.883119  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  59.89 
 
 
545 aa  672    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3141  CTP synthetase  59.14 
 
 
572 aa  639    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151944  normal  0.766797 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  59.18 
 
 
533 aa  657    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  62 
 
 
547 aa  679    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18211  CTP synthetase  60.84 
 
 
555 aa  664    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2586  CTP synthetase  56.51 
 
 
538 aa  634    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0528943 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2235  CTP synthetase  61.98 
 
 
549 aa  652    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1250  CTP synthase  60.19 
 
 
530 aa  635    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2598  CTP synthetase  61.6 
 
 
549 aa  657    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0553655  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3001  CTP synthase  61.62 
 
 
566 aa  637    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.427451  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  60.68 
 
 
542 aa  681    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  60.41 
 
 
535 aa  683    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  59.89 
 
 
546 aa  655    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0230  CTP synthetase  59.33 
 
 
534 aa  659    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181921  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  63.62 
 
 
537 aa  709    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  58.68 
 
 
536 aa  655    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1132  CTP synthetase  59.74 
 
 
558 aa  647    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3157  CTP synthetase  61.71 
 
 
608 aa  663    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0522365  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1191  CTP synthetase  58.75 
 
 
544 aa  640    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21631  CTP synthetase  59.89 
 
 
555 aa  649    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.397558 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  63.52 
 
 
531 aa  712    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  59.85 
 
 
535 aa  679    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0969  CTP synthase  59.59 
 
 
546 aa  649    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.538068  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  58.43 
 
 
533 aa  650    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0028  CTP synthetase  58.08 
 
 
534 aa  643    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.23296  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0174  CTP synthetase  56.9 
 
 
542 aa  645    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.472124  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1664  CTP synthase  60.98 
 
 
553 aa  642    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.210101  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1743  CTP synthetase  63.26 
 
 
547 aa  676    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0432346  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  60.64 
 
 
534 aa  674    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2887  CTP synthetase  58.03 
 
 
537 aa  651    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2035  CTP synthase  56.25 
 
 
533 aa  645    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00063614  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2349  CTP synthetase  60.19 
 
 
567 aa  651    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00181138  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2990  CTP synthase  61.64 
 
 
563 aa  650    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781575  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  63.64 
 
 
555 aa  680    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2836  CTP synthase  59.96 
 
 
559 aa  642    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0206831  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  100 
 
 
551 aa  1112    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  61.25 
 
 
540 aa  663    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  60.87 
 
 
558 aa  672    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  60.92 
 
 
547 aa  679    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  60.9 
 
 
535 aa  684    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  60.9 
 
 
535 aa  684    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2872  CTP synthetase  60.26 
 
 
571 aa  665    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  60.79 
 
 
535 aa  691    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0325  CTP synthetase  58.68 
 
 
534 aa  637    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000736967  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2106  CTP synthetase  60.53 
 
 
533 aa  644    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0473416  normal  0.014711 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4064  CTP synthetase  61.22 
 
 
583 aa  642    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.541211  normal  0.525358 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  58.8 
 
 
542 aa  669    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0475  CTP synthetase  58.86 
 
 
549 aa  636    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.984094 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  60.23 
 
 
535 aa  681    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09600  CTP synthetase  59.66 
 
 
532 aa  657    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0671161 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  61.17 
 
 
536 aa  682    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  59.41 
 
 
545 aa  656    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4432  CTP synthase  58.35 
 
 
587 aa  653    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.281255  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0193  CTP synthetase  56.55 
 
 
534 aa  642    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0420117  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0071  CTP synthase  60.42 
 
 
559 aa  670    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  64.54 
 
 
547 aa  710    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  56.65 
 
 
557 aa  644    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1754  CTP synthetase  61.44 
 
 
652 aa  650    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206256  hitchhiker  0.00103098 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1243  CTP synthetase  61.61 
 
 
558 aa  641    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0811753  normal  0.94922 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1347  CTP synthase  59.18 
 
 
560 aa  635    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543908  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1325  CTP synthetase  58.36 
 
 
536 aa  642    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00186219  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  61.02 
 
 
535 aa  678    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2485  CTP synthetase  60.3 
 
 
569 aa  656    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.996454  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  60.04 
 
 
535 aa  682    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3086  CTP synthase  60.79 
 
 
571 aa  633  1e-180  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716725  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  56.86 
 
 
548 aa  631  1e-180  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  57.31 
 
 
558 aa  632  1e-180  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1135  CTP synthetase  61.36 
 
 
535 aa  634  1e-180  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  58.33 
 
 
536 aa  629  1e-179  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  56.75 
 
 
553 aa  629  1e-179  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1782  CTP synthetase  57.12 
 
 
536 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18991  CTP synthetase  57.12 
 
 
536 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.433411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>