More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2472 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0230  CTP synthetase  62.66 
 
 
534 aa  709    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181921  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  61.32 
 
 
547 aa  709    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0433  CTP synthetase  56.96 
 
 
550 aa  635    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589327 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  59.85 
 
 
536 aa  670    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  70.62 
 
 
535 aa  800    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  60.23 
 
 
555 aa  675    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  70.47 
 
 
541 aa  821    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  63.58 
 
 
535 aa  718    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  68.93 
 
 
533 aa  777    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2383  CTP synthetase  56.95 
 
 
537 aa  644    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.508995  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  70.81 
 
 
535 aa  802    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0105  CTP synthetase  59.85 
 
 
569 aa  644    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000148991  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2959  CTP synthetase  57.01 
 
 
579 aa  638    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.736461 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0107  CTP synthetase  60.45 
 
 
534 aa  706    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0171408  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1600  CTP synthetase  59.36 
 
 
533 aa  636    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  57.87 
 
 
555 aa  644    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0097  CTP synthetase  59.47 
 
 
565 aa  640    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000852269  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  70.81 
 
 
535 aa  803    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  70.62 
 
 
535 aa  801    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0028  CTP synthetase  60.79 
 
 
534 aa  664    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.23296  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  70.62 
 
 
535 aa  801    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  70.11 
 
 
534 aa  805    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  63.65 
 
 
540 aa  694    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  70.62 
 
 
535 aa  800    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  69.1 
 
 
535 aa  770    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1743  CTP synthetase  60.34 
 
 
547 aa  675    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0432346  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1199  CTP synthetase  59.26 
 
 
581 aa  663    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.129574  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1291  CTP synthetase  62.62 
 
 
555 aa  712    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2349  CTP synthetase  57.83 
 
 
567 aa  646    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00181138  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  60.8 
 
 
545 aa  692    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  66.29 
 
 
533 aa  764    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  70.38 
 
 
531 aa  804    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  57.25 
 
 
534 aa  643    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  70.49 
 
 
542 aa  807    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0100  CTP synthetase  61.73 
 
 
597 aa  663    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000644202  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2235  CTP synthetase  62.43 
 
 
549 aa  707    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2613  CTP synthetase  59.74 
 
 
533 aa  641    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2598  CTP synthetase  62.24 
 
 
549 aa  708    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0553655  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  60.41 
 
 
538 aa  665    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  57.33 
 
 
548 aa  639    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1262  CTP synthetase  57.49 
 
 
543 aa  634    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  70.81 
 
 
535 aa  803    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1782  CTP synthetase  61.51 
 
 
536 aa  697    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  60.94 
 
 
546 aa  695    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1563  CTP synthetase  53.98 
 
 
534 aa  635    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1518  CTP synthetase  58.3 
 
 
587 aa  652    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000885327 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1325  CTP synthetase  59.21 
 
 
536 aa  663    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00186219  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  68.12 
 
 
537 aa  758    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  57.12 
 
 
555 aa  635    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3157  CTP synthetase  58.5 
 
 
608 aa  667    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0522365  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21631  CTP synthetase  62.62 
 
 
555 aa  713    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.397558 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3115  CTP synthetase  59.47 
 
 
557 aa  671    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000124409  hitchhiker  0.00148298 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  59.66 
 
 
545 aa  679    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  70.62 
 
 
535 aa  801    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  60.57 
 
 
534 aa  693    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29581  CTP synthetase  62.62 
 
 
558 aa  712    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1387  CTP synthetase  60.91 
 
 
549 aa  661    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2887  CTP synthetase  64.78 
 
 
537 aa  731    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18801  CTP synthetase  61.67 
 
 
536 aa  694    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2979  CTP synthetase  59.96 
 
 
534 aa  650    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.535852  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  63.71 
 
 
536 aa  723    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  57.46 
 
 
558 aa  639    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  70.24 
 
 
535 aa  796    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  61.16 
 
 
533 aa  673    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18801  CTP synthetase  61.29 
 
 
536 aa  691    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.061143  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2944  CTP synthetase  57.01 
 
 
579 aa  638    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  60.9 
 
 
551 aa  684    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0325  CTP synthetase  63.76 
 
 
534 aa  715    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000736967  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0174  CTP synthetase  57.59 
 
 
542 aa  650    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.472124  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  65.73 
 
 
532 aa  750    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  100 
 
 
535 aa  1098    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  100 
 
 
535 aa  1098    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  63.71 
 
 
536 aa  723    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2872  CTP synthetase  59.52 
 
 
571 aa  687    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1754  CTP synthetase  58.11 
 
 
652 aa  649    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206256  hitchhiker  0.00103098 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  70.62 
 
 
535 aa  801    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  56.93 
 
 
540 aa  635    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3141  CTP synthetase  58.36 
 
 
572 aa  659    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151944  normal  0.766797 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  64.03 
 
 
542 aa  739    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  70.24 
 
 
535 aa  799    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18991  CTP synthetase  61.48 
 
 
536 aa  694    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.433411  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1093  CTP synthetase  56.23 
 
 
533 aa  637    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0497  CTP synthetase  60.15 
 
 
535 aa  689    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0144764  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1786  CTP synthetase  59.59 
 
 
544 aa  674    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0226  CTP synthetase  56.79 
 
 
540 aa  645    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000246238  hitchhiker  4.1491499999999996e-20 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0519  CTP synthetase  58.72 
 
 
537 aa  669    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.354414  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0193  CTP synthetase  62.71 
 
 
534 aa  719    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0420117  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1519  CTP synthetase  58.3 
 
 
597 aa  656    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.154813  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18211  CTP synthetase  62.74 
 
 
555 aa  709    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  57.86 
 
 
557 aa  653    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1557  CTP synthetase  58.15 
 
 
547 aa  652    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.591143  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  57.51 
 
 
553 aa  644    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1243  CTP synthetase  58.89 
 
 
558 aa  639    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0811753  normal  0.94922 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  59.55 
 
 
558 aa  693    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2661  CTP synthetase  61.35 
 
 
565 aa  658    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00871872  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2485  CTP synthetase  58.86 
 
 
569 aa  666    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.996454  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  61.73 
 
 
533 aa  679    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2988  CTP synthetase  57.01 
 
 
579 aa  638    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.705391  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  60.79 
 
 
533 aa  671    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4327  CTP synthetase  57.12 
 
 
555 aa  635    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>