More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0230 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  64.22 
 
 		 536 aa  724    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2887  CTP synthetase  58.61 
 
 		 537 aa  656    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2035  CTP synthase  60.08 
 
 		 533 aa  686    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00063614  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0525  CTP synthetase  56.37 
 
 		 539 aa  634    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.693312 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  69.29 
 
 		 535 aa  780    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  64.41 
 
 		 535 aa  729    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  69.48 
 
 		 535 aa  783    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3115  CTP synthetase  59.47 
 
 		 557 aa  652    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000124409  hitchhiker  0.00148298 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  69.1 
 
 		 535 aa  776    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  68.91 
 
 		 535 aa  775    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  61.16 
 
 		 542 aa  695    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0107  CTP synthetase  69.61 
 
 		 534 aa  798    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0171408  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2785  CTP synthetase  63.14 
 
 		 538 aa  712    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963897  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  69.1 
 
 		 535 aa  777    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  69.1 
 
 		 535 aa  777    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  68.91 
 
 		 535 aa  776    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  68.91 
 
 		 535 aa  776    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  62.17 
 
 		 533 aa  694    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0475  CTP synthetase  58.8 
 
 		 549 aa  644    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.984094 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  55.08 
 
 		 558 aa  640    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  56.79 
 
 		 545 aa  645    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  62.78 
 
 		 536 aa  703    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  56.39 
 
 		 547 aa  650    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0325  CTP synthetase  57.74 
 
 		 534 aa  644    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000736967  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  61.89 
 
 		 547 aa  685    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  69.1 
 
 		 535 aa  777    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  56.98 
 
 		 546 aa  648    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  63.4 
 
 		 537 aa  705    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  62.17 
 
 		 533 aa  713    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0071  CTP synthase  59.96 
 
 		 559 aa  680    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  57.28 
 
 		 533 aa  635    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  60.34 
 
 		 534 aa  676    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  58.02 
 
 		 533 aa  639    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  61.09 
 
 		 541 aa  707    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  60.04 
 
 		 555 aa  655    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  70.36 
 
 		 531 aa  787    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21631  CTP synthetase  55.66 
 
 		 555 aa  636    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.397558 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  69.81 
 
 		 531 aa  784    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  59.33 
 
 		 551 aa  659    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  57.36 
 
 		 545 aa  648    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  62.66 
 
 		 535 aa  709    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  62.66 
 
 		 535 aa  709    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  61.73 
 
 		 540 aa  698    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  69.1 
 
 		 535 aa  778    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  68.91 
 
 		 535 aa  775    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  59.93 
 
 		 542 aa  690    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0497  CTP synthetase  65.98 
 
 		 535 aa  759    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0144764  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1786  CTP synthetase  63.58 
 
 		 544 aa  734    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0226  CTP synthetase  66.42 
 
 		 540 aa  745    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000246238  hitchhiker  4.1491499999999996e-20 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0519  CTP synthetase  67.8 
 
 		 537 aa  769    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.354414  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0193  CTP synthetase  71.11 
 
 		 534 aa  811    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0420117  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1743  CTP synthetase  58.83 
 
 		 547 aa  648    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0432346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  56.2 
 
 		 547 aa  649    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  63.48 
 
 		 532 aa  707    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0040  CTP synthase  60.3 
 
 		 531 aa  665    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  64.22 
 
 		 536 aa  724    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0230  CTP synthetase  100 
 
 		 534 aa  1105    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181921  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09600  CTP synthetase  57.89 
 
 		 532 aa  638    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0671161 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  60.41 
 
 		 534 aa  671    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  62.94 
 
 		 535 aa  714    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1291  CTP synthetase  55.66 
 
 		 555 aa  634  1e-180  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1250  CTP synthase  57.06 
 
 		 530 aa  632  1e-180  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  57.09 
 
 		 533 aa  632  1e-180  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  55.99 
 
 		 557 aa  633  1e-180  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  55.72 
 
 		 536 aa  628  1e-179  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0028  CTP synthetase  57.49 
 
 		 534 aa  629  1e-179  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.23296  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2598  CTP synthetase  54.89 
 
 		 549 aa  629  1e-179  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0553655  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  57.27 
 
 		 553 aa  628  1e-179  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08750  CTP synthetase  57.17 
 
 		 535 aa  628  1e-179  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  unclonable  0.00000000194145 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2586  CTP synthetase  56.66 
 
 		 538 aa  630  1e-179  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0528943 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1387  CTP synthetase  56.98 
 
 		 549 aa  625  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1093  CTP synthetase  55.43 
 
 		 533 aa  625  1e-178  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1191  CTP synthetase  58.3 
 
 		 544 aa  626  1e-178  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  55.31 
 
 		 558 aa  625  1e-178  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0170  CTP synthetase  55.72 
 
 		 535 aa  625  1e-178  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.357981 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2872  CTP synthetase  53.78 
 
 		 571 aa  626  1e-178  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  57.22 
 
 		 540 aa  625  1e-178  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0052  CTP synthetase  57.82 
 
 		 554 aa  625  1e-178  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1347  CTP synthase  56.11 
 
 		 560 aa  626  1e-178  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543908  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1217  CTP synthetase  57.55 
 
 		 544 aa  622  1e-177  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  55.95 
 
 		 534 aa  622  1e-177  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2235  CTP synthetase  54.7 
 
 		 549 aa  624  1e-177  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1782  CTP synthetase  53.85 
 
 		 536 aa  621  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1563  CTP synthetase  54.82 
 
 		 534 aa  624  1e-177  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2712  CTP synthase  55.6 
 
 		 563 aa  623  1e-177  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1607  CTP synthetase  55.78 
 
 		 546 aa  621  1e-177  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.353292 
 
 
-
 
NC_002936  DET1410  CTP synthetase  57.17 
 
 		 544 aa  619  1e-176  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0373811  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0969  CTP synthase  55.95 
 
 		 546 aa  619  1e-176  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.538068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4327  CTP synthetase  55.91 
 
 		 555 aa  620  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1199  CTP synthetase  55.22 
 
 		 581 aa  618  1e-176  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.129574  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2613  CTP synthetase  57.2 
 
 		 533 aa  618  1e-176  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2106  CTP synthetase  56.12 
 
 		 533 aa  620  1e-176  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0473416  normal  0.014711 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  55.72 
 
 		 538 aa  620  1e-176  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6612  CTP synthetase  54.46 
 
 		 550 aa  620  1e-176  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174922  hitchhiker  0.00487095 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  55.91 
 
 		 555 aa  619  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4305  CTP synthetase  55.72 
 
 		 555 aa  618  1e-176  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29581  CTP synthetase  54.34 
 
 		 558 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1182  CTP synthetase  56.11 
 
 		 547 aa  619  1e-176  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18991  CTP synthetase  53.38 
 
 		 536 aa  615  1e-175  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.433411  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0133  CTP synthetase  53.85 
 
 		 532 aa  615  1e-175  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>