More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3337 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_18991  CTP synthetase  61.55 
 
 
536 aa  711    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.433411  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  57.3 
 
 
542 aa  646    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29581  CTP synthetase  62.31 
 
 
558 aa  714    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1410  CTP synthetase  59.43 
 
 
544 aa  656    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0373811  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  60.83 
 
 
536 aa  682    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  57.3 
 
 
542 aa  646    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1204  CTP synthetase  58.55 
 
 
545 aa  642    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000204322  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2692  CTP synthetase  58.22 
 
 
536 aa  672    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  74.15 
 
 
535 aa  829    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2513  CTP synthetase  59.29 
 
 
552 aa  652    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294945  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18801  CTP synthetase  61.74 
 
 
536 aa  704    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.061143  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  86.01 
 
 
535 aa  969    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  74.39 
 
 
536 aa  835    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18801  CTP synthetase  61.74 
 
 
536 aa  711    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0107  CTP synthetase  69.55 
 
 
534 aa  798    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0171408  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3441  CTP synthetase  58.1 
 
 
546 aa  639    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  61.12 
 
 
533 aa  694    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  86.77 
 
 
535 aa  973    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  86.58 
 
 
535 aa  971    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0325  CTP synthetase  64.39 
 
 
534 aa  726    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000736967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  86.39 
 
 
535 aa  971    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  71.32 
 
 
533 aa  811    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1184  CTP synthetase  59.48 
 
 
545 aa  640    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1190  CTP synthetase  59.48 
 
 
545 aa  641    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  57.3 
 
 
542 aa  645    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  56.48 
 
 
542 aa  643    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2366  CTP synthetase  58.78 
 
 
546 aa  641    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.863535  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1199  CTP synthetase  57.54 
 
 
581 aa  640    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.129574  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1291  CTP synthetase  63.07 
 
 
555 aa  725    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  60.93 
 
 
533 aa  691    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0619  CTP synthetase  58.38 
 
 
546 aa  638    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.626167  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  61.96 
 
 
545 aa  715    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2979  CTP synthetase  59.74 
 
 
534 aa  638    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.535852  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0850  CTP synthetase  57.86 
 
 
550 aa  637    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1119  CTP synthetase  56.38 
 
 
543 aa  635    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  57.74 
 
 
534 aa  659    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  70.89 
 
 
533 aa  808    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0100  CTP synthetase  57.92 
 
 
597 aa  636    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000644202  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2235  CTP synthetase  63.65 
 
 
549 aa  725    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18211  CTP synthetase  63.26 
 
 
555 aa  723    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2598  CTP synthetase  63.65 
 
 
549 aa  728    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0553655  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  61.02 
 
 
538 aa  681    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  59.89 
 
 
548 aa  669    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1262  CTP synthetase  58.18 
 
 
543 aa  644    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  86.77 
 
 
535 aa  973    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1782  CTP synthetase  61.74 
 
 
536 aa  714    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  62.95 
 
 
546 aa  724    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0230  CTP synthetase  69.81 
 
 
534 aa  784    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181921  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  86.01 
 
 
535 aa  970    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  72.64 
 
 
537 aa  815    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1217  CTP synthetase  59.81 
 
 
544 aa  660    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  66.79 
 
 
540 aa  746    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3157  CTP synthetase  57.62 
 
 
608 aa  667    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0522365  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1511  CTP synthetase  58.74 
 
 
547 aa  644    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174656  decreased coverage  0.000112124 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  60.56 
 
 
533 aa  688    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1911  CTP synthetase  58.41 
 
 
542 aa  639    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.884152  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21631  CTP synthetase  63.07 
 
 
555 aa  727    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.397558 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3128  CTP synthetase  58.47 
 
 
545 aa  640    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000112535  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1195  CTP synthetase  58.33 
 
 
545 aa  645    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.111429  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  58.26 
 
 
542 aa  654    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  62.95 
 
 
545 aa  722    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  64.78 
 
 
555 aa  732    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  57.44 
 
 
555 aa  635    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  58.61 
 
 
558 aa  655    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1439  CTP synthetase  58.04 
 
 
551 aa  652    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0767506  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1754  CTP synthetase  58.38 
 
 
652 aa  660    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206256  hitchhiker  0.00103098 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1184  CTP synthetase  58.66 
 
 
546 aa  642    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0154566  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  63.52 
 
 
551 aa  712    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3265  CTP synthetase  59.48 
 
 
543 aa  638    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2536  CTP synthetase  56.06 
 
 
539 aa  634    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  70.38 
 
 
535 aa  804    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  70.38 
 
 
535 aa  804    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0028  CTP synthetase  60 
 
 
534 aa  676    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.23296  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2872  CTP synthetase  61.65 
 
 
571 aa  721    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1114  CTP synthetase  58.47 
 
 
546 aa  641    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000131384  normal  0.869869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1185  CTP synthetase  58.29 
 
 
546 aa  641    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000285694  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  57.86 
 
 
540 aa  653    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3280  CTP synthetase  58.47 
 
 
545 aa  640    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000222232  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  66.73 
 
 
542 aa  759    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2758  CTP synthetase  58.66 
 
 
545 aa  642    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000221418  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  69.81 
 
 
542 aa  800    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  56.48 
 
 
542 aa  643    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0497  CTP synthetase  65.35 
 
 
535 aa  767    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0144764  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1786  CTP synthetase  62.64 
 
 
544 aa  712    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0226  CTP synthetase  63.84 
 
 
540 aa  724    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000246238  hitchhiker  4.1491499999999996e-20 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0519  CTP synthetase  64.72 
 
 
537 aa  739    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.354414  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0193  CTP synthetase  69.92 
 
 
534 aa  793    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0420117  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1519  CTP synthetase  58.58 
 
 
597 aa  645    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.154813  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  74.39 
 
 
536 aa  835    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  57.86 
 
 
557 aa  665    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1557  CTP synthetase  57.78 
 
 
547 aa  647    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.591143  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1115  CTP synthetase  58.47 
 
 
546 aa  641    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000891455  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0174  CTP synthetase  59.55 
 
 
542 aa  674    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.472124  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  64.97 
 
 
534 aa  757    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  85.44 
 
 
535 aa  963    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3137  CTP synthetase  58.47 
 
 
545 aa  640    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000110473  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2485  CTP synthetase  56.19 
 
 
569 aa  638    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.996454  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1035  CTP synthetase  59.22 
 
 
545 aa  645    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.946581  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  59 
 
 
553 aa  664    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0668  CTP synthetase  58.55 
 
 
545 aa  644    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00226842  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>