More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0519 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  55.93 
 
 
542 aa  636    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  65.6 
 
 
531 aa  742    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  63.14 
 
 
535 aa  722    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  65.09 
 
 
535 aa  738    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  56.79 
 
 
534 aa  660    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0107  CTP synthetase  65.47 
 
 
534 aa  758    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0171408  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1743  CTP synthetase  56.42 
 
 
547 aa  640    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0432346  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  65.09 
 
 
535 aa  738    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  65.09 
 
 
535 aa  738    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  65.28 
 
 
535 aa  739    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  65.28 
 
 
535 aa  739    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  64.72 
 
 
531 aa  739    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  64.72 
 
 
535 aa  733    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  60.3 
 
 
533 aa  671    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  55.83 
 
 
545 aa  639    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  57.28 
 
 
536 aa  659    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  59.43 
 
 
532 aa  678    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  65.09 
 
 
535 aa  738    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3115  CTP synthetase  56.5 
 
 
557 aa  639    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000124409  hitchhiker  0.00148298 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  59.32 
 
 
537 aa  679    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  59.62 
 
 
533 aa  692    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  59.74 
 
 
541 aa  678    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  64.91 
 
 
535 aa  734    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  62.26 
 
 
536 aa  716    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  58.72 
 
 
535 aa  669    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  58.72 
 
 
535 aa  669    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  62.26 
 
 
536 aa  716    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  64.91 
 
 
535 aa  734    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2035  CTP synthase  56.5 
 
 
533 aa  649    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00063614  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2785  CTP synthetase  59.09 
 
 
538 aa  667    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963897  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  56.25 
 
 
542 aa  640    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  65.28 
 
 
535 aa  739    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0497  CTP synthetase  64.03 
 
 
535 aa  739    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0144764  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1786  CTP synthetase  66.17 
 
 
544 aa  764    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0226  CTP synthetase  64.65 
 
 
540 aa  728    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000246238  hitchhiker  4.1491499999999996e-20 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0519  CTP synthetase  100 
 
 
537 aa  1108    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.354414  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0193  CTP synthetase  67.23 
 
 
534 aa  770    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0420117  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  65.28 
 
 
535 aa  739    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0230  CTP synthetase  67.8 
 
 
534 aa  769    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181921  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  58.44 
 
 
540 aa  674    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  59.47 
 
 
547 aa  655    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  56.64 
 
 
535 aa  650    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  56.06 
 
 
534 aa  632  1e-180  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0071  CTP synthase  55.85 
 
 
559 aa  633  1e-180  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  55.87 
 
 
545 aa  630  1e-179  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  55.56 
 
 
555 aa  629  1e-179  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0325  CTP synthetase  56.55 
 
 
534 aa  625  1e-178  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000736967  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  56.52 
 
 
551 aa  626  1e-178  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0040  CTP synthase  56.74 
 
 
531 aa  622  1e-177  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  53.98 
 
 
546 aa  622  1e-177  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  55.3 
 
 
558 aa  622  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21631  CTP synthetase  54.27 
 
 
555 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.397558 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1347  CTP synthase  54.61 
 
 
560 aa  620  1e-176  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543908  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09600  CTP synthetase  55.2 
 
 
532 aa  618  1e-176  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0671161 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1291  CTP synthetase  54.27 
 
 
555 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2235  CTP synthetase  55.22 
 
 
549 aa  618  1e-176  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2887  CTP synthetase  55.83 
 
 
537 aa  616  1e-175  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1132  CTP synthetase  54.19 
 
 
558 aa  617  1e-175  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  54.17 
 
 
547 aa  615  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29581  CTP synthetase  54.08 
 
 
558 aa  611  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18211  CTP synthetase  54.08 
 
 
555 aa  614  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  52.66 
 
 
557 aa  613  9.999999999999999e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  54.17 
 
 
547 aa  614  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1487  CTP synthase  56.51 
 
 
558 aa  611  1e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.883119  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  55.2 
 
 
533 aa  609  1e-173  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2598  CTP synthetase  54.08 
 
 
549 aa  609  1e-173  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0553655  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3157  CTP synthetase  53.16 
 
 
608 aa  609  1e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0522365  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1782  CTP synthetase  53.21 
 
 
536 aa  605  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2872  CTP synthetase  53.6 
 
 
571 aa  605  9.999999999999999e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18991  CTP synthetase  53.51 
 
 
536 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.433411  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1191  CTP synthetase  55.39 
 
 
544 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1217  CTP synthetase  55.2 
 
 
544 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2836  CTP synthase  55.45 
 
 
559 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0206831  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0969  CTP synthase  53.17 
 
 
546 aa  604  1.0000000000000001e-171  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.538068  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1410  CTP synthetase  54.44 
 
 
544 aa  598  1e-170  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0373811  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1716  CTP synthase  53.48 
 
 
545 aa  600  1e-170  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1199  CTP synthetase  53.9 
 
 
581 aa  601  1e-170  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.129574  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  51.32 
 
 
534 aa  598  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3141  CTP synthetase  52.33 
 
 
572 aa  600  1e-170  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151944  normal  0.766797 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1182  CTP synthetase  54.56 
 
 
547 aa  600  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0433  CTP synthetase  51.65 
 
 
550 aa  599  1e-170  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589327 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2990  CTP synthase  55.68 
 
 
563 aa  600  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781575  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18801  CTP synthetase  53.32 
 
 
536 aa  601  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1387  CTP synthetase  55.56 
 
 
549 aa  598  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2383  CTP synthetase  52.72 
 
 
537 aa  597  1e-169  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.508995  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1754  CTP synthetase  53 
 
 
652 aa  595  1e-169  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206256  hitchhiker  0.00103098 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0475  CTP synthetase  54.02 
 
 
549 aa  597  1e-169  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.984094 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1439  CTP synthetase  53.52 
 
 
551 aa  595  1e-169  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0767506  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1250  CTP synthase  53.88 
 
 
530 aa  597  1e-169  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4064  CTP synthetase  52.84 
 
 
583 aa  597  1e-169  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.541211  normal  0.525358 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2751  CTP synthase  54.24 
 
 
555 aa  598  1e-169  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0184273 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18801  CTP synthetase  52.75 
 
 
536 aa  596  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.061143  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  53.17 
 
 
533 aa  597  1e-169  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0028  CTP synthetase  53.92 
 
 
534 aa  597  1e-169  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.23296  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  53.36 
 
 
533 aa  595  1e-169  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1135  CTP synthetase  53.02 
 
 
535 aa  594  1e-168  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0100  CTP synthetase  53 
 
 
597 aa  592  1e-168  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000644202  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22080  CTP synthase  52.41 
 
 
554 aa  592  1e-168  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202828  normal  0.968992 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1664  CTP synthase  52.63 
 
 
553 aa  593  1e-168  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.210101  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2586  CTP synthetase  53.86 
 
 
538 aa  594  1e-168  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0528943 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>