More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0433 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  56.93 
 
 		 534 aa  652    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  59.59 
 
 		 555 aa  672    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  61.3 
 
 		 536 aa  685    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  58.85 
 
 		 542 aa  658    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1000  CTP synthetase  58.38 
 
 		 552 aa  635    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  57.06 
 
 		 535 aa  636    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2513  CTP synthetase  58.38 
 
 		 552 aa  661    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294945  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  57.62 
 
 		 535 aa  643    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  57.43 
 
 		 535 aa  637    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2785  CTP synthetase  57.33 
 
 		 538 aa  645    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963897  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3128  CTP synthetase  58.44 
 
 		 545 aa  635    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000112535  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  60.52 
 
 		 540 aa  676    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2979  CTP synthetase  62.78 
 
 		 534 aa  672    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.535852  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3441  CTP synthetase  58.44 
 
 		 546 aa  638    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1552  CTP synthase  58.1 
 
 		 543 aa  639    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.873983  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  57.43 
 
 		 535 aa  637    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  57.43 
 
 		 535 aa  637    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  57.25 
 
 		 535 aa  636    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  56.01 
 
 		 536 aa  637    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1184  CTP synthetase  58.18 
 
 		 545 aa  637    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1190  CTP synthetase  58.36 
 
 		 545 aa  640    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1361  CTP synthetase  58.1 
 
 		 543 aa  641    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0802006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4327  CTP synthetase  60.11 
 
 		 555 aa  664    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2366  CTP synthetase  58.07 
 
 		 546 aa  637    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.863535  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2765  CTP synthetase  59.67 
 
 		 550 aa  640    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000226127 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  58.15 
 
 		 533 aa  651    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0433  CTP synthetase  100 
 
 		 550 aa  1133    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589327 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0619  CTP synthetase  59.18 
 
 		 546 aa  657    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.626167  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0915  CTP synthetase  58.75 
 
 		 552 aa  639    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  57.01 
 
 		 545 aa  639    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3280  CTP synthetase  58.44 
 
 		 545 aa  635    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000222232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0850  CTP synthetase  59.18 
 
 		 550 aa  660    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1119  CTP synthetase  58.47 
 
 		 543 aa  654    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  58.66 
 
 		 542 aa  657    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  62.85 
 
 		 534 aa  703    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3137  CTP synthetase  58.44 
 
 		 545 aa  635    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000110473  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2758  CTP synthetase  58.44 
 
 		 545 aa  635    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000221418  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1439  CTP synthetase  60.89 
 
 		 551 aa  672    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0767506  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  57.77 
 
 		 542 aa  655    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  59.74 
 
 		 535 aa  660    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  62.59 
 
 		 538 aa  687    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  81.02 
 
 		 548 aa  940    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1262  CTP synthetase  57.33 
 
 		 543 aa  653    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  57.43 
 
 		 535 aa  637    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4305  CTP synthetase  60.11 
 
 		 555 aa  664    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  58.29 
 
 		 543 aa  650    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  60.67 
 
 		 541 aa  662    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  60.15 
 
 		 537 aa  674    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  57.25 
 
 		 535 aa  636    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  60.11 
 
 		 555 aa  664    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  57.96 
 
 		 534 aa  647    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  59.59 
 
 		 533 aa  660    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  57.43 
 
 		 545 aa  643    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  58.85 
 
 		 542 aa  658    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00174  CTP synthetase  57.87 
 
 		 554 aa  639    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142517  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1243  CTP synthetase  57.22 
 
 		 543 aa  636    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1600  CTP synthetase  62.29 
 
 		 533 aa  670    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1911  CTP synthetase  59 
 
 		 542 aa  653    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.884152  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  55.58 
 
 		 558 aa  634    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  57.25 
 
 		 535 aa  636    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  61.06 
 
 		 547 aa  686    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  58.6 
 
 		 531 aa  659    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0617  CTP synthetase  59.81 
 
 		 548 aa  659    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1093  CTP synthetase  57.27 
 
 		 533 aa  646    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1563  CTP synthetase  57.54 
 
 		 534 aa  637    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  57.88 
 
 		 542 aa  645    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1727  CTP synthetase  61.67 
 
 		 535 aa  665    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  60.04 
 
 		 558 aa  674    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  58.52 
 
 		 542 aa  657    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  57.25 
 
 		 535 aa  636    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  58.36 
 
 		 532 aa  654    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  57.25 
 
 		 535 aa  635    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38810  CTP synthetase  57.36 
 
 		 543 aa  641    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1634  CTP synthetase  56.64 
 
 		 545 aa  638    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.883771  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2536  CTP synthetase  55.94 
 
 		 539 aa  635    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  56.96 
 
 		 535 aa  635    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  56.96 
 
 		 535 aa  635    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0156  CTP synthetase  74.95 
 
 		 546 aa  832    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  56.01 
 
 		 536 aa  637    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1114  CTP synthetase  58.26 
 
 		 546 aa  635    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000131384  normal  0.869869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1185  CTP synthetase  58.26 
 
 		 546 aa  635    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000285694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  61.27 
 
 		 540 aa  678    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0975  CTP synthetase  76.88 
 
 		 547 aa  876    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  57.06 
 
 		 542 aa  643    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1408  CTP synthetase  59.15 
 
 		 542 aa  644    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0617949  hitchhiker  0.0000124662 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  59.03 
 
 		 536 aa  657    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  57.88 
 
 		 542 aa  645    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09600  CTP synthetase  57.25 
 
 		 532 aa  640    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0671161 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2613  CTP synthetase  62.29 
 
 		 533 aa  675    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1511  CTP synthetase  87.2 
 
 		 547 aa  1009    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174656  decreased coverage  0.000112124 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2653  CTP synthetase  56.78 
 
 		 554 aa  636    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.476334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1236  CTP synthetase  58.44 
 
 		 545 aa  635    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000161678  hitchhiker  0.00000000200253 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  64.05 
 
 		 557 aa  744    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1557  CTP synthetase  60.85 
 
 		 547 aa  675    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.591143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1115  CTP synthetase  58.07 
 
 		 546 aa  635    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000891455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1607  CTP synthetase  72.51 
 
 		 546 aa  823    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.353292 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1614  CTP synthetase  61.3 
 
 		 535 aa  657    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.23037  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1182  CTP synthetase  60.56 
 
 		 547 aa  675    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  57.91 
 
 		 542 aa  648    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300969 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1035  CTP synthetase  59.26 
 
 		 545 aa  652    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.946581  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>