More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1600 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  58.33 
 
 		 542 aa  640    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0230  CTP synthetase  57.2 
 
 		 534 aa  635    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181921  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1093  CTP synthetase  57.06 
 
 		 533 aa  645    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  82.52 
 
 		 536 aa  929    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  58.33 
 
 		 542 aa  640    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  59.85 
 
 		 535 aa  659    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  58.33 
 
 		 535 aa  643    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2513  CTP synthetase  60.3 
 
 		 552 aa  659    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294945  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38810  CTP synthetase  57.49 
 
 		 543 aa  637    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0320  CTP synthetase  60.37 
 
 		 555 aa  660    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  59.66 
 
 		 535 aa  657    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1151  CTP synthetase  56.74 
 
 		 554 aa  640    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.485284  normal  0.0237518 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  61.61 
 
 		 542 aa  680    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  58.32 
 
 		 542 aa  639    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1182  CTP synthetase  61.97 
 
 		 547 aa  687    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1600  CTP synthetase  100 
 
 		 533 aa  1099    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  59.85 
 
 		 535 aa  659    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  59.85 
 
 		 535 aa  660    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  59.85 
 
 		 535 aa  659    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1439  CTP synthetase  58.33 
 
 		 551 aa  653    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0767506  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1184  CTP synthetase  60.34 
 
 		 545 aa  637    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1190  CTP synthetase  59.78 
 
 		 545 aa  638    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  60.53 
 
 		 532 aa  667    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1641  CTP synthetase  58.63 
 
 		 544 aa  639    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.118223  hitchhiker  0.0000254043 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2366  CTP synthetase  62.55 
 
 		 546 aa  679    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.863535  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1298  CTP synthetase  61.27 
 
 		 544 aa  649    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  61.98 
 
 		 536 aa  675    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  61.63 
 
 		 534 aa  665    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0619  CTP synthetase  63.28 
 
 		 546 aa  694    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.626167  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  59.85 
 
 		 535 aa  659    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  59.13 
 
 		 545 aa  641    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  61.77 
 
 		 535 aa  667    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0850  CTP synthetase  58.52 
 
 		 550 aa  643    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1119  CTP synthetase  58.63 
 
 		 543 aa  635    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  71.86 
 
 		 534 aa  828    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  58.6 
 
 		 543 aa  642    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  59.2 
 
 		 547 aa  654    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0433  CTP synthetase  62.29 
 
 		 550 aa  691    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589327 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  65.73 
 
 		 555 aa  729    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2598  CTP synthetase  58 
 
 		 549 aa  637    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0553655  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  84.24 
 
 		 538 aa  943    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  63.02 
 
 		 548 aa  702    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1262  CTP synthetase  61.12 
 
 		 543 aa  659    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  59.85 
 
 		 535 aa  659    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  59.85 
 
 		 535 aa  659    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  58.52 
 
 		 546 aa  640    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2613  CTP synthetase  98.5 
 
 		 533 aa  1082    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  63.65 
 
 		 553 aa  713    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  61.68 
 
 		 537 aa  671    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  61.54 
 
 		 541 aa  678    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  66.48 
 
 		 555 aa  727    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  61.61 
 
 		 540 aa  677    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  57.01 
 
 		 534 aa  642    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0156  CTP synthetase  64.34 
 
 		 546 aa  699    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  61.17 
 
 		 533 aa  679    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  58.6 
 
 		 536 aa  651    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1243  CTP synthetase  59.25 
 
 		 543 aa  640    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1727  CTP synthetase  78.57 
 
 		 535 aa  863    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1911  CTP synthetase  61.14 
 
 		 542 aa  671    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.884152  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  61.55 
 
 		 531 aa  679    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  59.58 
 
 		 545 aa  645    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1563  CTP synthetase  60.8 
 
 		 534 aa  676    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4305  CTP synthetase  66.48 
 
 		 555 aa  726    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0617  CTP synthetase  60.6 
 
 		 548 aa  659    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1661  CTP synthetase  62.06 
 
 		 550 aa  664    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1875  CTP synthetase  58.26 
 
 		 544 aa  639    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000103989 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  59.66 
 
 		 535 aa  659    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0222  CTP synthetase  58.35 
 
 		 543 aa  654    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.555048  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  60.82 
 
 		 558 aa  682    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  59.39 
 
 		 547 aa  656    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0975  CTP synthetase  62.06 
 
 		 547 aa  668    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  59.66 
 
 		 535 aa  657    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1872  CTP synthetase  60.56 
 
 		 555 aa  664    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1634  CTP synthetase  58.21 
 
 		 545 aa  635    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.883771  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2536  CTP synthetase  58.33 
 
 		 539 aa  638    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  59.47 
 
 		 535 aa  656    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  59.47 
 
 		 535 aa  656    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  58.33 
 
 		 558 aa  646    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2872  CTP synthetase  56.62 
 
 		 571 aa  639    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0052  CTP synthetase  60.34 
 
 		 554 aa  664    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  59.85 
 
 		 535 aa  659    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  59.89 
 
 		 540 aa  665    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  57.96 
 
 		 542 aa  636    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300969 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  60.38 
 
 		 542 aa  675    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1408  CTP synthetase  59.36 
 
 		 542 aa  641    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0617949  hitchhiker  0.0000124662 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2785  CTP synthetase  58.41 
 
 		 538 aa  648    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963897  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  58.32 
 
 		 542 aa  639    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1511  CTP synthetase  61.99 
 
 		 547 aa  691    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174656  decreased coverage  0.000112124 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  58.6 
 
 		 536 aa  651    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  58.15 
 
 		 542 aa  639    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  59.47 
 
 		 533 aa  660    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  65.61 
 
 		 557 aa  736    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1557  CTP synthetase  60.11 
 
 		 547 aa  649    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.591143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0170  CTP synthetase  57.58 
 
 		 535 aa  639    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.357981 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1607  CTP synthetase  63.37 
 
 		 546 aa  709    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.353292 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1614  CTP synthetase  77.26 
 
 		 535 aa  852    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.23037  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2979  CTP synthetase  84.66 
 
 		 534 aa  918    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.535852  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4327  CTP synthetase  66.48 
 
 		 555 aa  727    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1035  CTP synthetase  58.49 
 
 		 545 aa  637    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.946581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0668  CTP synthetase  60.37 
 
 		 545 aa  654    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00226842  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>