More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1185 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02625  CTP synthetase  77.98 
 
 		 545 aa  858    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000505271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0908  CTP synthase  77.98 
 
 		 545 aa  858    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000342907  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  56.69 
 
 		 536 aa  638    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  71.11 
 
 		 542 aa  795    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1327  CTP synthetase  62.96 
 
 		 559 aa  716    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  69.48 
 
 		 542 aa  781    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2513  CTP synthetase  66.23 
 
 		 552 aa  740    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2633  CTP synthetase  64.1 
 
 		 553 aa  689    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.267072  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1126  CTP synthetase  63.16 
 
 		 554 aa  704    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.116547 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0320  CTP synthetase  64.38 
 
 		 555 aa  736    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4108  CTP synthetase  78.19 
 
 		 542 aa  879    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0218  CTP synthetase  61 
 
 		 557 aa  671    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.682216 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  71.11 
 
 		 542 aa  795    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3317  CTP synthetase  78.35 
 
 		 545 aa  867    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00384789  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3441  CTP synthetase  98.72 
 
 		 546 aa  1108    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1552  CTP synthase  70.19 
 
 		 543 aa  776    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.873983  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3156  CTP synthetase  59.51 
 
 		 542 aa  637    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.11737  normal  0.0821196 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1670  CTP synthetase  64.76 
 
 		 543 aa  741    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0004808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5105  CTP synthetase  60.33 
 
 		 552 aa  687    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1691  CTP synthetase  64.1 
 
 		 553 aa  689    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.202871  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1184  CTP synthetase  65.81 
 
 		 545 aa  738    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1190  CTP synthetase  65.81 
 
 		 545 aa  741    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1361  CTP synthetase  70.19 
 
 		 543 aa  776    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0802006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1641  CTP synthetase  65.56 
 
 		 544 aa  749    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.118223  hitchhiker  0.0000254043 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2366  CTP synthetase  63.96 
 
 		 546 aa  731    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.863535  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1204  CTP synthetase  91.54 
 
 		 545 aa  1015    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000204322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1088  CTP synthetase  65.27 
 
 		 550 aa  711    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1511  CTP synthetase  58.3 
 
 		 547 aa  654    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174656  decreased coverage  0.000112124 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0619  CTP synthetase  63.54 
 
 		 546 aa  721    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.626167  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0794  CTP synthetase  77.43 
 
 		 545 aa  860    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0895398  normal  0.701374 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2713  CTP synthetase  64.1 
 
 		 553 aa  689    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0850  CTP synthetase  65.93 
 
 		 550 aa  737    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1119  CTP synthetase  71.35 
 
 		 543 aa  791    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1000  CTP synthetase  61.43 
 
 		 552 aa  699    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  56.38 
 
 		 534 aa  659    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5415  CTP synthetase  63.19 
 
 		 550 aa  687    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.295707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2195  CTP synthetase  64.1 
 
 		 553 aa  689    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.136999  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1184  CTP synthetase  91.01 
 
 		 546 aa  1005    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0154566  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  56.62 
 
 		 538 aa  640    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  59.37 
 
 		 548 aa  674    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1262  CTP synthetase  64.19 
 
 		 543 aa  739    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2924  CTP synthetase  77.98 
 
 		 545 aa  858    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000016445  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2758  CTP synthetase  98.72 
 
 		 545 aa  1109    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000221418  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  70.19 
 
 		 543 aa  788    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1227  CTP synthetase  64.99 
 
 		 566 aa  710    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1298  CTP synthetase  70.34 
 
 		 544 aa  758    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  57.33 
 
 		 537 aa  636    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1892  CTP synthetase  64.29 
 
 		 553 aa  691    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1161  CTP synthetase  63.74 
 
 		 553 aa  691    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650114 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2845  CTP synthetase  61.48 
 
 		 555 aa  695    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2348  CTP synthetase  60.52 
 
 		 544 aa  636    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2017  CTP synthetase  59.78 
 
 		 543 aa  642    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0404569  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  70.5 
 
 		 542 aa  795    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2026  CTP synthetase  79.63 
 
 		 545 aa  889    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000406175  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2648  CTP synthetase  61.47 
 
 		 555 aa  698    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1243  CTP synthetase  67.22 
 
 		 543 aa  776    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3084  CTP synthetase  77.98 
 
 		 545 aa  858    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000646787  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1911  CTP synthetase  64.88 
 
 		 542 aa  731    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.884152  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3181  CTP synthetase  61.9 
 
 		 563 aa  700    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1571  CTP synthetase  64.1 
 
 		 557 aa  701    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.465584  normal  0.494207 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1195  CTP synthetase  92.46 
 
 		 545 aa  1026    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.111429  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1289  CTP synthetase  90.81 
 
 		 545 aa  1002    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.934915  hitchhiker  0.00000000280114 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0617  CTP synthetase  70.24 
 
 		 548 aa  774    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1738  CTP synthetase  58.86 
 
 		 545 aa  637    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1875  CTP synthetase  65.75 
 
 		 544 aa  754    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000103989 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1052  CTP synthetase  64.72 
 
 		 549 aa  709    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0222  CTP synthetase  73.26 
 
 		 543 aa  834    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.555048  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  56.49 
 
 		 558 aa  646    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2579  CTP synthetase  64.1 
 
 		 570 aa  688    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1170  CTP synthetase  59.04 
 
 		 543 aa  638    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.251518  normal  0.0605368 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5968  CTP synthetase  63.19 
 
 		 552 aa  688    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0945  CTP synthetase  64.61 
 
 		 553 aa  714    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3265  CTP synthetase  75.42 
 
 		 543 aa  859    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1634  CTP synthetase  60.89 
 
 		 545 aa  648    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.883771  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3234  CTP synthetase  77.8 
 
 		 545 aa  860    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  0.167491 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  57.41 
 
 		 553 aa  648    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3280  CTP synthetase  98.17 
 
 		 545 aa  1108    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000222232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0552  CTP synthetase  77.12 
 
 		 542 aa  855    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1185  CTP synthetase  61.67 
 
 		 566 aa  696    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.279088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1114  CTP synthetase  99.08 
 
 		 546 aa  1111    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000131384  normal  0.869869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1185  CTP synthetase  100 
 
 		 546 aa  1121    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000285694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  68.77 
 
 		 540 aa  780    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1051  CTP synthetase  90.81 
 
 		 545 aa  1004    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.333074  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  57.73 
 
 		 542 aa  653    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03526  CTP synthetase  79.85 
 
 		 546 aa  893    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2146  CTP synthetase  63.55 
 
 		 552 aa  691    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  69.48 
 
 		 542 aa  781    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  57.49 
 
 		 533 aa  647    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3128  CTP synthetase  98.17 
 
 		 545 aa  1108    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000112535  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1439  CTP synthetase  66.36 
 
 		 551 aa  763    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0767506  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2109  CTP synthetase  63.19 
 
 		 552 aa  688    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0532575  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  57.54 
 
 		 557 aa  655    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1557  CTP synthetase  60.37 
 
 		 547 aa  671    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.591143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1115  CTP synthetase  98.72 
 
 		 546 aa  1108    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000891455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0668  CTP synthetase  74.12 
 
 		 545 aa  856    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00226842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3137  CTP synthetase  98.17 
 
 		 545 aa  1108    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000110473  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3123  CTP synthetase  63.92 
 
 		 553 aa  687    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.839664  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1468  CTP synthetase  64.1 
 
 		 553 aa  689    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.915674  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2653  CTP synthetase  61.93 
 
 		 554 aa  705    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.476334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1035  CTP synthetase  91.73 
 
 		 545 aa  1013    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.946581  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>