More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3181 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02625  CTP synthetase  59.82 
 
 
545 aa  673    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000505271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0908  CTP synthase  59.82 
 
 
545 aa  673    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000342907  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2562  CTP synthetase  70.59 
 
 
557 aa  788    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.542571  normal  0.0982923 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  63.21 
 
 
542 aa  705    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1204  CTP synthetase  60.92 
 
 
545 aa  671    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000204322  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2513  CTP synthetase  61.37 
 
 
552 aa  693    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294945  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1126  CTP synthetase  69.09 
 
 
554 aa  784    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.116547 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1184  CTP synthetase  60.62 
 
 
546 aa  672    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0154566  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4108  CTP synthetase  60 
 
 
542 aa  674    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  63.21 
 
 
542 aa  705    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3234  CTP synthetase  61.65 
 
 
545 aa  685    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  0.167491 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3441  CTP synthetase  61.83 
 
 
546 aa  682    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1552  CTP synthase  61.86 
 
 
543 aa  686    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.873983  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3093  CTP synthetase  59.82 
 
 
545 aa  673    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.106381  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0320  CTP synthetase  59.79 
 
 
555 aa  691    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  61.2 
 
 
542 aa  691    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1691  CTP synthetase  69.35 
 
 
553 aa  778    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.202871  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1184  CTP synthetase  60.11 
 
 
545 aa  658    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1190  CTP synthetase  60.29 
 
 
545 aa  661    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1361  CTP synthetase  61.86 
 
 
543 aa  687    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0802006  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1641  CTP synthetase  58.9 
 
 
544 aa  669    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.118223  hitchhiker  0.0000254043 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2366  CTP synthetase  64.25 
 
 
546 aa  724    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.863535  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  63.21 
 
 
542 aa  704    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2195  CTP synthetase  69.35 
 
 
553 aa  778    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.136999  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1088  CTP synthetase  69.03 
 
 
550 aa  773    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0619  CTP synthetase  65.33 
 
 
546 aa  736    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.626167  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0932  CTP synthetase  59.82 
 
 
545 aa  673    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000109112  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1468  CTP synthetase  69.35 
 
 
553 aa  778    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.915674  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2713  CTP synthetase  69.35 
 
 
553 aa  778    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0850  CTP synthetase  60.26 
 
 
550 aa  678    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1119  CTP synthetase  62 
 
 
543 aa  692    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3128  CTP synthetase  61.28 
 
 
545 aa  676    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000112535  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0899  CTP synthetase  68.62 
 
 
558 aa  763    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.995561  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5415  CTP synthetase  68.85 
 
 
550 aa  775    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.295707  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2918  CTP synthetase  59.82 
 
 
545 aa  673    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000134002  normal  0.938704 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2127  CTP synthetase  68.67 
 
 
552 aa  775    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0913295  normal  0.042023 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0969  CTP synthetase  68.81 
 
 
553 aa  773    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.471871  normal  0.0231208 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2019  CTP synthetase  68.85 
 
 
552 aa  777    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0440235 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1262  CTP synthetase  60.62 
 
 
543 aa  699    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0794  CTP synthetase  60.73 
 
 
545 aa  677    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0895398  normal  0.701374 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3123  CTP synthetase  69.18 
 
 
553 aa  776    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.839664  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0614  CTP synthetase  57.95 
 
 
554 aa  675    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1227  CTP synthetase  65.25 
 
 
566 aa  711    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3280  CTP synthetase  61.28 
 
 
545 aa  676    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000222232  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  62.48 
 
 
542 aa  696    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000300969 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1892  CTP synthetase  69.18 
 
 
553 aa  780    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1176  CTP synthetase  78.83 
 
 
563 aa  886    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.413679 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1670  CTP synthetase  57.74 
 
 
543 aa  670    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0004808  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3317  CTP synthetase  60.74 
 
 
545 aa  671    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00384789  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0980  CTP synthetase  60.74 
 
 
545 aa  671    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0184119  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2653  CTP synthetase  83.42 
 
 
554 aa  973    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.476334  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0945  CTP synthetase  68.99 
 
 
553 aa  764    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2648  CTP synthetase  88.28 
 
 
555 aa  1044    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1243  CTP synthetase  60.66 
 
 
543 aa  688    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.381709  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2026  CTP synthetase  60.93 
 
 
545 aa  676    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000406175  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1911  CTP synthetase  67.89 
 
 
542 aa  778    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.884152  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3181  CTP synthetase  100 
 
 
563 aa  1164    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1571  CTP synthetase  70.46 
 
 
557 aa  788    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.465584  normal  0.494207 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1195  CTP synthetase  62.39 
 
 
545 aa  693    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.111429  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03526  CTP synthetase  59.93 
 
 
546 aa  676    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0617  CTP synthetase  62.89 
 
 
548 aa  704    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1298  CTP synthetase  59.93 
 
 
544 aa  661    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1875  CTP synthetase  58.9 
 
 
544 aa  671    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.000103989 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1052  CTP synthetase  69.19 
 
 
549 aa  770    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0222  CTP synthetase  59.12 
 
 
543 aa  669    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.555048  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1441  CTP synthetase  69.85 
 
 
553 aa  778    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2845  CTP synthetase  80.15 
 
 
555 aa  921    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2924  CTP synthetase  59.82 
 
 
545 aa  673    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000016445  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5968  CTP synthetase  68.67 
 
 
552 aa  774    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3084  CTP synthetase  59.82 
 
 
545 aa  673    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000646787  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3265  CTP synthetase  60.55 
 
 
543 aa  672    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3351  CTP synthetase  60.92 
 
 
545 aa  666    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000138422  hitchhiker  0.0000252338 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2579  CTP synthetase  69.35 
 
 
570 aa  778    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3137  CTP synthetase  61.28 
 
 
545 aa  676    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000110473  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3447  CTP synthetase  60.74 
 
 
545 aa  671    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.125216  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0552  CTP synthetase  62.23 
 
 
542 aa  689    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1439  CTP synthetase  60.5 
 
 
551 aa  690    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0767506  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1114  CTP synthetase  61.65 
 
 
546 aa  679    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000131384  normal  0.869869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1185  CTP synthetase  61.65 
 
 
546 aa  677    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000285694  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  61.36 
 
 
540 aa  702    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1051  CTP synthetase  62.41 
 
 
545 aa  681    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.333074  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  61.86 
 
 
543 aa  694    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1289  CTP synthetase  61.48 
 
 
545 aa  675    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.934915  hitchhiker  0.00000000280114 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2146  CTP synthetase  68.49 
 
 
552 aa  772    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  61.2 
 
 
542 aa  691    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2758  CTP synthetase  61.83 
 
 
545 aa  680    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000221418  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1000  CTP synthetase  84.21 
 
 
552 aa  982    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2109  CTP synthetase  68.67 
 
 
552 aa  774    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0532575  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1161  CTP synthetase  69.91 
 
 
553 aa  778    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650114 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1115  CTP synthetase  61.65 
 
 
546 aa  679    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000891455  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2633  CTP synthetase  69.35 
 
 
553 aa  778    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.267072  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1872  CTP synthetase  59.43 
 
 
555 aa  687    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1185  CTP synthetase  91.67 
 
 
566 aa  1071    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.279088  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5105  CTP synthetase  82.97 
 
 
552 aa  967    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1035  CTP synthetase  61.31 
 
 
545 aa  689    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.946581  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0668  CTP synthetase  60 
 
 
545 aa  679    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00226842  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0218  CTP synthetase  79.4 
 
 
557 aa  920    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.682216 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  61.36 
 
 
542 aa  684    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0566  CTP synthetase  57.77 
 
 
554 aa  673    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.796665  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1327  CTP synthetase  85.71 
 
 
559 aa  993    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>