More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3265 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02625  CTP synthetase  73.28 
 
 		 545 aa  826    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000505271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0908  CTP synthase  73.28 
 
 		 545 aa  826    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000342907  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  60.07 
 
 		 536 aa  659    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  74.02 
 
 		 542 aa  824    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0794  CTP synthetase  74.58 
 
 		 545 aa  837    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0895398  normal  0.701374 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2513  CTP synthetase  67.1 
 
 		 552 aa  753    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294945  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1184  CTP synthetase  74.86 
 
 		 546 aa  852    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0154566  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1126  CTP synthetase  62.55 
 
 		 554 aa  689    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.116547 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  57.43 
 
 		 535 aa  635    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4108  CTP synthetase  77.59 
 
 		 542 aa  875    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0218  CTP synthetase  59.59 
 
 		 557 aa  671    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.682216 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0320  CTP synthetase  66.48 
 
 		 555 aa  748    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3441  CTP synthetase  74.86 
 
 		 546 aa  852    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1552  CTP synthase  72.19 
 
 		 543 aa  810    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.873983  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  57.81 
 
 		 535 aa  637    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  57.81 
 
 		 535 aa  636    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  57.62 
 
 		 535 aa  635    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1691  CTP synthetase  63.65 
 
 		 553 aa  690    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.202871  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1184  CTP synthetase  67.77 
 
 		 545 aa  750    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1190  CTP synthetase  67.77 
 
 		 545 aa  753    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1361  CTP synthetase  72.19 
 
 		 543 aa  811    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0802006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1641  CTP synthetase  65.62 
 
 		 544 aa  752    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.118223  hitchhiker  0.0000254043 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2366  CTP synthetase  66.48 
 
 		 546 aa  742    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.863535  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2845  CTP synthetase  60.34 
 
 		 555 aa  694    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  74.02 
 
 		 542 aa  824    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1088  CTP synthetase  62.55 
 
 		 550 aa  682    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2195  CTP synthetase  63.65 
 
 		 553 aa  690    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.136999  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0619  CTP synthetase  64.4 
 
 		 546 aa  728    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.626167  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1670  CTP synthetase  63.57 
 
 		 543 aa  731    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0004808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1289  CTP synthetase  74.86 
 
 		 545 aa  846    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.934915  hitchhiker  0.00000000280114 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2713  CTP synthetase  63.65 
 
 		 553 aa  690    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0850  CTP synthetase  65.74 
 
 		 550 aa  741    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1119  CTP synthetase  74.39 
 
 		 543 aa  827    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  58.55 
 
 		 533 aa  654    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  55.84 
 
 		 534 aa  647    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5415  CTP synthetase  64.21 
 
 		 550 aa  697    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.295707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2579  CTP synthetase  63.65 
 
 		 570 aa  691    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1204  CTP synthetase  75.05 
 
 		 545 aa  847    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000204322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  59 
 
 		 538 aa  653    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  59 
 
 		 548 aa  665    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1262  CTP synthetase  67.4 
 
 		 543 aa  776    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  57.81 
 
 		 535 aa  637    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2633  CTP synthetase  63.65 
 
 		 553 aa  690    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.267072  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1227  CTP synthetase  62.78 
 
 		 566 aa  693    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3234  CTP synthetase  74.95 
 
 		 545 aa  842    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  0.167491 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  59.07 
 
 		 537 aa  657    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1892  CTP synthetase  63.65 
 
 		 553 aa  692    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3280  CTP synthetase  75.05 
 
 		 545 aa  858    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000222232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0945  CTP synthetase  64.02 
 
 		 553 aa  699    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  74.58 
 
 		 543 aa  825    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3084  CTP synthetase  73.28 
 
 		 545 aa  826    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000646787  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1439  CTP synthetase  66.36 
 
 		 551 aa  762    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0767506  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  59.59 
 
 		 542 aa  652    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2648  CTP synthetase  60.73 
 
 		 555 aa  702    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1243  CTP synthetase  68.72 
 
 		 543 aa  794    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  57.09 
 
 		 553 aa  650    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1911  CTP synthetase  66.67 
 
 		 542 aa  754    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.884152  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3181  CTP synthetase  60.55 
 
 		 563 aa  694    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1571  CTP synthetase  63.28 
 
 		 557 aa  692    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.465584  normal  0.494207 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1195  CTP synthetase  75.32 
 
 		 545 aa  855    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.111429  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2026  CTP synthetase  78.48 
 
 		 545 aa  879    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000406175  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0617  CTP synthetase  69.74 
 
 		 548 aa  780    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2924  CTP synthetase  73.28 
 
 		 545 aa  826    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000016445  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1875  CTP synthetase  65.62 
 
 		 544 aa  751    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000103989 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1052  CTP synthetase  62.55 
 
 		 549 aa  687    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0222  CTP synthetase  71.9 
 
 		 543 aa  826    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.555048  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  57.67 
 
 		 558 aa  649    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1298  CTP synthetase  69.46 
 
 		 544 aa  758    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1170  CTP synthetase  59.29 
 
 		 543 aa  635    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.251518  normal  0.0605368 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5968  CTP synthetase  63.47 
 
 		 552 aa  692    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3128  CTP synthetase  75.05 
 
 		 545 aa  858    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000112535  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3265  CTP synthetase  100 
 
 		 543 aa  1117    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1634  CTP synthetase  59.55 
 
 		 545 aa  647    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.883771  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2653  CTP synthetase  60.96 
 
 		 554 aa  696    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.476334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3137  CTP synthetase  75.05 
 
 		 545 aa  858    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000110473  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  71.75 
 
 		 542 aa  815    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0552  CTP synthetase  75.88 
 
 		 542 aa  843    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3123  CTP synthetase  63.47 
 
 		 553 aa  689    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.839664  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1114  CTP synthetase  75.6 
 
 		 546 aa  859    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000131384  normal  0.869869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1185  CTP synthetase  75.42 
 
 		 546 aa  859    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000285694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  67.48 
 
 		 540 aa  776    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1051  CTP synthetase  74.49 
 
 		 545 aa  847    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.333074  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  57.86 
 
 		 542 aa  657    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3317  CTP synthetase  76.25 
 
 		 545 aa  851    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00384789  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2146  CTP synthetase  63.84 
 
 		 552 aa  694    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  71.75 
 
 		 542 aa  815    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1000  CTP synthetase  62.04 
 
 		 552 aa  716    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1468  CTP synthetase  63.65 
 
 		 553 aa  690    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.915674  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2109  CTP synthetase  63.47 
 
 		 552 aa  692    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0532575  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  58.91 
 
 		 557 aa  660    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1557  CTP synthetase  60.63 
 
 		 547 aa  657    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.591143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1115  CTP synthetase  75.6 
 
 		 546 aa  860    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000891455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1185  CTP synthetase  61.21 
 
 		 566 aa  702    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.279088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2758  CTP synthetase  75.05 
 
 		 545 aa  859    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000221418  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03526  CTP synthetase  78.73 
 
 		 546 aa  874    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1327  CTP synthetase  62.07 
 
 		 559 aa  720    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1035  CTP synthetase  75.6 
 
 		 545 aa  853    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.946581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0668  CTP synthetase  77.15 
 
 		 545 aa  870    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00226842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  71.21 
 
 		 542 aa  801    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1511  CTP synthetase  57.17 
 
 		 547 aa  641    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174656  decreased coverage  0.000112124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>