More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3181 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  69.79 
 
 
535 aa  795    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2383  CTP synthetase  55.35 
 
 
537 aa  635    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.508995  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1410  CTP synthetase  62.5 
 
 
544 aa  679    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0373811  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  61.25 
 
 
536 aa  689    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  57.51 
 
 
542 aa  653    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2692  CTP synthetase  58.27 
 
 
536 aa  662    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  65.36 
 
 
535 aa  732    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2513  CTP synthetase  58.07 
 
 
552 aa  645    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294945  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1439  CTP synthetase  57.33 
 
 
551 aa  638    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0767506  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  65.17 
 
 
536 aa  736    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  70.54 
 
 
535 aa  800    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1727  CTP synthetase  59.25 
 
 
535 aa  643    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2979  CTP synthetase  61.54 
 
 
534 aa  664    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.535852  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0107  CTP synthetase  59.74 
 
 
534 aa  695    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0171408  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  57.51 
 
 
542 aa  652    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1552  CTP synthase  56.91 
 
 
543 aa  639    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.873983  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  70.36 
 
 
535 aa  800    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  69.98 
 
 
535 aa  796    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1600  CTP synthetase  61.17 
 
 
533 aa  659    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  70.17 
 
 
535 aa  798    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  60.23 
 
 
533 aa  678    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1184  CTP synthetase  58.46 
 
 
545 aa  638    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1190  CTP synthetase  58.46 
 
 
545 aa  639    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1361  CTP synthetase  56.91 
 
 
543 aa  640    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0802006  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0230  CTP synthetase  62.17 
 
 
534 aa  713    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181921  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  57.51 
 
 
542 aa  654    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1199  CTP synthetase  59.33 
 
 
581 aa  645    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.129574  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1291  CTP synthetase  60.98 
 
 
555 aa  703    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18801  CTP synthetase  59.66 
 
 
536 aa  679    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  65.17 
 
 
536 aa  736    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  62.57 
 
 
545 aa  708    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18801  CTP synthetase  59.09 
 
 
536 aa  671    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.061143  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  70.49 
 
 
540 aa  785    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1119  CTP synthetase  57.06 
 
 
543 aa  645    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  59.32 
 
 
534 aa  671    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  60.41 
 
 
533 aa  680    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0100  CTP synthetase  58.11 
 
 
597 aa  643    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000644202  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2235  CTP synthetase  60.23 
 
 
549 aa  682    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0028  CTP synthetase  59.29 
 
 
534 aa  668    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.23296  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2598  CTP synthetase  60.23 
 
 
549 aa  684    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0553655  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  61.39 
 
 
538 aa  688    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  59.11 
 
 
548 aa  655    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1262  CTP synthetase  57.27 
 
 
543 aa  636    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  70.36 
 
 
535 aa  800    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1782  CTP synthetase  59.51 
 
 
536 aa  679    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  62.76 
 
 
546 aa  701    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  70.36 
 
 
535 aa  802    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  74.76 
 
 
537 aa  832    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21631  CTP synthetase  60.98 
 
 
555 aa  704    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.397558 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0174  CTP synthetase  57.96 
 
 
542 aa  661    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.472124  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3157  CTP synthetase  58.96 
 
 
608 aa  669    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0522365  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3115  CTP synthetase  63.89 
 
 
557 aa  720    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000124409  hitchhiker  0.00148298 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1563  CTP synthetase  57.44 
 
 
534 aa  658    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18991  CTP synthetase  59.47 
 
 
536 aa  680    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.433411  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1195  CTP synthetase  58.12 
 
 
545 aa  634    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.111429  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1217  CTP synthetase  62.69 
 
 
544 aa  681    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0325  CTP synthetase  61.58 
 
 
534 aa  700    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000736967  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18211  CTP synthetase  59.09 
 
 
555 aa  679    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  57.88 
 
 
543 aa  654    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0222  CTP synthetase  56.9 
 
 
543 aa  639    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.555048  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  58.32 
 
 
558 aa  651    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  100 
 
 
533 aa  1105    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1511  CTP synthetase  59.67 
 
 
547 aa  661    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174656  decreased coverage  0.000112124 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29581  CTP synthetase  60.61 
 
 
558 aa  690    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  60.85 
 
 
553 aa  668    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  61.74 
 
 
551 aa  698    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3265  CTP synthetase  58.55 
 
 
543 aa  639    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  65.35 
 
 
534 aa  742    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  57.7 
 
 
542 aa  651    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000300969 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  66.29 
 
 
535 aa  764    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  66.29 
 
 
535 aa  764    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3141  CTP synthetase  58.18 
 
 
572 aa  650    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151944  normal  0.766797 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2872  CTP synthetase  59.05 
 
 
571 aa  677    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2887  CTP synthetase  65.6 
 
 
537 aa  733    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1325  CTP synthetase  59.54 
 
 
536 aa  656    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00186219  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  57.14 
 
 
540 aa  636    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  70.17 
 
 
535 aa  798    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  63.71 
 
 
542 aa  738    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  68.74 
 
 
542 aa  777    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1754  CTP synthetase  58.6 
 
 
652 aa  657    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206256  hitchhiker  0.00103098 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  57.51 
 
 
542 aa  654    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0497  CTP synthetase  57.14 
 
 
535 aa  670    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0144764  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1786  CTP synthetase  58.11 
 
 
544 aa  665    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0226  CTP synthetase  58.76 
 
 
540 aa  670    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000246238  hitchhiker  4.1491499999999996e-20 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0519  CTP synthetase  59.62 
 
 
537 aa  692    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.354414  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0193  CTP synthetase  62.17 
 
 
534 aa  713    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0420117  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1093  CTP synthetase  55.91 
 
 
533 aa  645    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  70.36 
 
 
535 aa  800    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  59.93 
 
 
557 aa  660    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  68.24 
 
 
533 aa  777    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  63.71 
 
 
547 aa  720    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  61.44 
 
 
558 aa  701    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  57.51 
 
 
542 aa  653    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1614  CTP synthetase  60.11 
 
 
535 aa  637    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.23037  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  60.23 
 
 
533 aa  681    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2485  CTP synthetase  57.93 
 
 
569 aa  649    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.996454  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0433  CTP synthetase  59.59 
 
 
550 aa  660    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589327 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  64.84 
 
 
545 aa  724    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  69.79 
 
 
535 aa  794    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  63.52 
 
 
555 aa  714    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>