More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1291 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1743  CTP synthetase  61.17 
 
 
547 aa  675    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0432346  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0325  CTP synthetase  57.03 
 
 
534 aa  658    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000736967  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  58.19 
 
 
536 aa  640    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  61.74 
 
 
547 aa  677    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2035  CTP synthase  56.57 
 
 
533 aa  656    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00063614  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  57.47 
 
 
535 aa  653    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2513  CTP synthetase  57.94 
 
 
552 aa  639    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294945  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  60.42 
 
 
535 aa  706    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18991  CTP synthetase  80.19 
 
 
536 aa  909    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.433411  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0107  CTP synthetase  55.58 
 
 
534 aa  640    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0171408  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  60.49 
 
 
555 aa  666    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08750  CTP synthetase  58.95 
 
 
535 aa  663    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  unclonable  0.00000000194145 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  60.61 
 
 
535 aa  707    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  60.61 
 
 
535 aa  706    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  60.61 
 
 
535 aa  707    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  71.21 
 
 
547 aa  798    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1250  CTP synthase  58.27 
 
 
530 aa  638    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  60.26 
 
 
536 aa  684    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29581  CTP synthetase  84.04 
 
 
558 aa  962    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  69.7 
 
 
545 aa  785    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1387  CTP synthetase  70.51 
 
 
549 aa  763    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1291  CTP synthetase  100 
 
 
555 aa  1143    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21631  CTP synthetase  99.46 
 
 
555 aa  1137    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.397558 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  60.61 
 
 
535 aa  706    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18801  CTP synthetase  80 
 
 
536 aa  909    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.061143  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  68.5 
 
 
545 aa  791    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  56.95 
 
 
533 aa  644    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  60.61 
 
 
535 aa  707    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  60.61 
 
 
535 aa  707    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  71.02 
 
 
547 aa  798    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2235  CTP synthetase  81.87 
 
 
549 aa  942    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  62.43 
 
 
533 aa  705    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2598  CTP synthetase  82.78 
 
 
549 aa  944    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0553655  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  58.9 
 
 
538 aa  641    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  59.32 
 
 
535 aa  683    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  60.61 
 
 
535 aa  707    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1782  CTP synthetase  80.19 
 
 
536 aa  908    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  71.4 
 
 
546 aa  804    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  58.08 
 
 
533 aa  654    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  63.02 
 
 
537 aa  704    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  58.03 
 
 
536 aa  661    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  60.19 
 
 
540 aa  672    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  58.03 
 
 
536 aa  661    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2887  CTP synthetase  57.66 
 
 
537 aa  652    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2106  CTP synthetase  57.82 
 
 
533 aa  647    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0473416  normal  0.014711 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0174  CTP synthetase  56.53 
 
 
542 aa  646    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.472124  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18801  CTP synthetase  80.19 
 
 
536 aa  907    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  57.52 
 
 
533 aa  651    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  59.89 
 
 
551 aa  648    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  60.42 
 
 
535 aa  705    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  60.98 
 
 
533 aa  703    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1325  CTP synthetase  56.19 
 
 
536 aa  634    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00186219  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  62.62 
 
 
535 aa  712    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  62.62 
 
 
535 aa  712    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  63.07 
 
 
531 aa  725    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2872  CTP synthetase  68.45 
 
 
571 aa  782    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  59.66 
 
 
534 aa  678    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2785  CTP synthetase  57.12 
 
 
538 aa  648    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963897  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  63.07 
 
 
531 aa  720    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  59.28 
 
 
542 aa  677    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  59.25 
 
 
542 aa  678    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  60.34 
 
 
534 aa  689    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  59.85 
 
 
532 aa  680    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0193  CTP synthetase  55.95 
 
 
534 aa  647    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0420117  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  60.15 
 
 
541 aa  689    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1557  CTP synthetase  58.1 
 
 
547 aa  640    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.591143  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18211  CTP synthetase  84.62 
 
 
555 aa  964    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3115  CTP synthetase  60.49 
 
 
557 aa  672    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000124409  hitchhiker  0.00148298 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  70.83 
 
 
558 aa  793    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  59.85 
 
 
535 aa  702    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  60.61 
 
 
535 aa  706    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09600  CTP synthetase  57.14 
 
 
532 aa  649    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0671161 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1135  CTP synthetase  58.71 
 
 
535 aa  648    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0071  CTP synthase  58.79 
 
 
559 aa  655    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0028  CTP synthetase  57.52 
 
 
534 aa  642    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.23296  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0230  CTP synthetase  55.66 
 
 
534 aa  634  1e-180  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181921  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1410  CTP synthetase  57.35 
 
 
544 aa  628  1e-179  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0373811  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3141  CTP synthetase  57.46 
 
 
572 aa  630  1e-179  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151944  normal  0.766797 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1487  CTP synthase  59.47 
 
 
558 aa  629  1e-179  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.883119  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1217  CTP synthetase  57.35 
 
 
544 aa  629  1e-179  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1191  CTP synthetase  56.99 
 
 
544 aa  629  1e-179  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  55.22 
 
 
534 aa  626  1e-178  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1754  CTP synthetase  57.63 
 
 
652 aa  622  1e-177  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206256  hitchhiker  0.00103098 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1262  CTP synthetase  56.88 
 
 
543 aa  624  1e-177  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3157  CTP synthetase  56.26 
 
 
608 aa  623  1e-177  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0522365  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22080  CTP synthase  56.72 
 
 
554 aa  623  1e-177  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202828  normal  0.968992 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  55.14 
 
 
557 aa  624  1e-177  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1347  CTP synthase  57.22 
 
 
560 aa  622  1e-177  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543908  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1911  CTP synthetase  57.41 
 
 
542 aa  620  1e-176  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.884152  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2751  CTP synthase  54.94 
 
 
555 aa  618  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0184273 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1607  CTP synthetase  54.43 
 
 
546 aa  618  1e-176  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.353292 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0519  CTP synthetase  54.27 
 
 
537 aa  619  1e-176  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.354414  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  55.95 
 
 
542 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000300969 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  56.52 
 
 
555 aa  618  1e-176  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1439  CTP synthetase  56.44 
 
 
551 aa  615  1e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0767506  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  56.3 
 
 
555 aa  616  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4327  CTP synthetase  56.93 
 
 
555 aa  615  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  53.99 
 
 
553 aa  615  1e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1182  CTP synthetase  55.82 
 
 
547 aa  615  1e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0662  CTP synthetase  57.81 
 
 
549 aa  615  1e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>