More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2963 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  63.52 
 
 		 533 aa  714    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  62.19 
 
 		 534 aa  696    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18801  CTP synthetase  57.09 
 
 		 536 aa  645    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.061143  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1410  CTP synthetase  65.75 
 
 		 544 aa  707    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0373811  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  59.62 
 
 		 535 aa  674    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  65.97 
 
 		 547 aa  723    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  61.63 
 
 		 535 aa  702    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  72.34 
 
 		 534 aa  810    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0107  CTP synthetase  55.51 
 
 		 534 aa  635    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0171408  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  61.81 
 
 		 535 aa  703    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  61.81 
 
 		 535 aa  703    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  61.63 
 
 		 535 aa  702    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1217  CTP synthetase  65.93 
 
 		 544 aa  709    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  61.81 
 
 		 535 aa  703    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  57.76 
 
 		 533 aa  655    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  64.41 
 
 		 531 aa  728    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  61.81 
 
 		 535 aa  703    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2887  CTP synthetase  61.35 
 
 		 537 aa  671    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1135  CTP synthetase  61.44 
 
 		 535 aa  652    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3115  CTP synthetase  93.99 
 
 		 557 aa  1054    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000124409  hitchhiker  0.00148298 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2785  CTP synthetase  61.93 
 
 		 538 aa  684    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963897  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1291  CTP synthetase  60.49 
 
 		 555 aa  666    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18991  CTP synthetase  56.61 
 
 		 536 aa  645    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.433411  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  61.63 
 
 		 545 aa  682    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  63.96 
 
 		 541 aa  719    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  62.92 
 
 		 535 aa  707    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  60.87 
 
 		 558 aa  681    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2235  CTP synthetase  61.96 
 
 		 549 aa  665    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0320  CTP synthetase  59.11 
 
 		 555 aa  635    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2598  CTP synthetase  60.11 
 
 		 549 aa  671    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0553655  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  61.25 
 
 		 532 aa  686    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  61.81 
 
 		 535 aa  703    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1782  CTP synthetase  56.8 
 
 		 536 aa  646    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  58.9 
 
 		 546 aa  650    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09600  CTP synthetase  59.7 
 
 		 532 aa  641    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0671161 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  67.55 
 
 		 537 aa  752    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  57.88 
 
 		 553 aa  643    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0071  CTP synthase  68.07 
 
 		 559 aa  776    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1607  CTP synthetase  56.54 
 
 		 546 aa  634    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.353292 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0230  CTP synthetase  60.04 
 
 		 534 aa  655    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181921  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  59.02 
 
 		 536 aa  676    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18801  CTP synthetase  56.8 
 
 		 536 aa  644    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  62 
 
 		 535 aa  705    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  63.47 
 
 		 536 aa  708    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  61.81 
 
 		 535 aa  709    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1743  CTP synthetase  77.55 
 
 		 547 aa  861    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0432346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  61.73 
 
 		 547 aa  693    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2035  CTP synthase  56.47 
 
 		 533 aa  651    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00063614  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  65.91 
 
 		 533 aa  732    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29581  CTP synthetase  61.06 
 
 		 558 aa  661    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  63.64 
 
 		 551 aa  680    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21631  CTP synthetase  60.87 
 
 		 555 aa  671    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.397558 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  60.23 
 
 		 535 aa  675    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  60.23 
 
 		 535 aa  675    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18211  CTP synthetase  59.45 
 
 		 555 aa  667    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2872  CTP synthetase  58.75 
 
 		 571 aa  658    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  61.63 
 
 		 535 aa  701    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  64.78 
 
 		 531 aa  732    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2106  CTP synthetase  59.62 
 
 		 533 aa  636    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0473416  normal  0.014711 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  57.38 
 
 		 533 aa  652    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  61.08 
 
 		 542 aa  708    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  63.89 
 
 		 542 aa  728    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  63.31 
 
 		 540 aa  685    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  100 
 
 		 555 aa  1121    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0193  CTP synthetase  57.01 
 
 		 534 aa  642    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0420117  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1387  CTP synthetase  61.63 
 
 		 549 aa  657    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0325  CTP synthetase  57.66 
 
 		 534 aa  638    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000736967  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  61.91 
 
 		 547 aa  693    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1250  CTP synthase  62.26 
 
 		 530 aa  663    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  59.02 
 
 		 536 aa  676    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1325  CTP synthetase  59.43 
 
 		 536 aa  655    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00186219  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1191  CTP synthetase  65.56 
 
 		 544 aa  704    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  60.48 
 
 		 545 aa  676    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  57.38 
 
 		 533 aa  648    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  61.44 
 
 		 535 aa  700    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25420  CTP synthetase  57.58 
 
 		 566 aa  631  1e-180  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.199429 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1182  CTP synthetase  57.88 
 
 		 547 aa  632  1e-180  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3157  CTP synthetase  58.77 
 
 		 608 aa  632  1e-180  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0522365  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2692  CTP synthetase  54.82 
 
 		 536 aa  630  1e-179  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  58.44 
 
 		 555 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1872  CTP synthetase  58.74 
 
 		 555 aa  629  1e-179  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  57.55 
 
 		 534 aa  630  1e-179  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0028  CTP synthetase  56.26 
 
 		 534 aa  629  1e-179  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.23296  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0475  CTP synthetase  59.93 
 
 		 549 aa  630  1e-179  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.984094 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2751  CTP synthase  57.95 
 
 		 555 aa  630  1e-179  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0184273 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0519  CTP synthetase  55.56 
 
 		 537 aa  629  1e-179  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.354414  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0156  CTP synthetase  57.33 
 
 		 546 aa  627  1e-178  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3086  CTP synthase  61.32 
 
 		 571 aa  627  1e-178  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08750  CTP synthetase  58.03 
 
 		 535 aa  627  1e-178  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  unclonable  0.00000000194145 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0497  CTP synthetase  55.53 
 
 		 535 aa  625  1e-178  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0144764  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0040  CTP synthase  56.25 
 
 		 531 aa  625  1e-178  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  57.55 
 
 		 538 aa  623  1e-177  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  55.64 
 
 		 548 aa  624  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0433  CTP synthetase  56.01 
 
 		 550 aa  622  1e-177  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589327 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  56.9 
 
 		 536 aa  620  1e-176  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1511  CTP synthetase  56.03 
 
 		 547 aa  619  1e-176  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174656  decreased coverage  0.000112124 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0174  CTP synthetase  55.12 
 
 		 542 aa  620  1e-176  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.472124  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  55.27 
 
 		 557 aa  620  1e-176  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3141  CTP synthetase  56.37 
 
 		 572 aa  619  1e-176  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151944  normal  0.766797 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4327  CTP synthetase  58.75 
 
 		 555 aa  617  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>