More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_18060 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1410  CTP synthetase  59.51 
 
 
544 aa  652    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0373811  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  61.12 
 
 
536 aa  671    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  56.51 
 
 
542 aa  638    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0230  CTP synthetase  62.94 
 
 
534 aa  714    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181921  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2692  CTP synthetase  55.43 
 
 
536 aa  639    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  63.91 
 
 
535 aa  724    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1727  CTP synthetase  61.68 
 
 
535 aa  661    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2979  CTP synthetase  62.22 
 
 
534 aa  650    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.535852  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18801  CTP synthetase  58.57 
 
 
536 aa  675    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  66.92 
 
 
535 aa  765    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  70.6 
 
 
542 aa  793    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3115  CTP synthetase  62.78 
 
 
557 aa  709    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000124409  hitchhiker  0.00148298 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0107  CTP synthetase  58.99 
 
 
534 aa  691    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0171408  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3141  CTP synthetase  57.22 
 
 
572 aa  646    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151944  normal  0.766797 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  62.85 
 
 
536 aa  721    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0139  CTP synthetase  59.36 
 
 
564 aa  639    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  66.92 
 
 
535 aa  765    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  66.73 
 
 
535 aa  765    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  61.08 
 
 
533 aa  684    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  66.92 
 
 
535 aa  765    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  62.92 
 
 
555 aa  707    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4305  CTP synthetase  60.63 
 
 
555 aa  658    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1563  CTP synthetase  59.25 
 
 
534 aa  666    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  61.71 
 
 
533 aa  689    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0052  CTP synthetase  58.65 
 
 
554 aa  636    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1199  CTP synthetase  58.44 
 
 
581 aa  653    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.129574  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1291  CTP synthetase  59.32 
 
 
555 aa  683    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29581  CTP synthetase  60.45 
 
 
558 aa  689    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0127  CTP synthetase  59.32 
 
 
565 aa  637    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00118527  decreased coverage  0.00108847 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  62.43 
 
 
545 aa  716    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0325  CTP synthetase  60.26 
 
 
534 aa  675    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000736967  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1119  CTP synthetase  56.62 
 
 
543 aa  637    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18801  CTP synthetase  59.74 
 
 
536 aa  683    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.061143  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  60.9 
 
 
534 aa  667    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0100  CTP synthetase  59.21 
 
 
597 aa  649    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000644202  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2235  CTP synthetase  58.95 
 
 
549 aa  668    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0090  CTP synthetase  58.35 
 
 
569 aa  641    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2598  CTP synthetase  60.45 
 
 
549 aa  687    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0553655  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  62.06 
 
 
538 aa  677    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  61.74 
 
 
548 aa  671    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  56.33 
 
 
542 aa  637    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  66.92 
 
 
535 aa  765    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1782  CTP synthetase  58.72 
 
 
536 aa  675    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  63.72 
 
 
546 aa  716    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1754  CTP synthetase  57.41 
 
 
652 aa  652    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206256  hitchhiker  0.00103098 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2383  CTP synthetase  58.76 
 
 
537 aa  653    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.508995  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  68.87 
 
 
537 aa  775    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  60.26 
 
 
555 aa  656    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3157  CTP synthetase  57.25 
 
 
608 aa  656    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0522365  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1217  CTP synthetase  59.7 
 
 
544 aa  650    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  67.29 
 
 
533 aa  758    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18211  CTP synthetase  61.02 
 
 
555 aa  689    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21631  CTP synthetase  59.32 
 
 
555 aa  685    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.397558 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  66.73 
 
 
535 aa  766    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1439  CTP synthetase  57.61 
 
 
551 aa  642    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0767506  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0433  CTP synthetase  59.74 
 
 
550 aa  660    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589327 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  61.08 
 
 
533 aa  688    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1600  CTP synthetase  61.77 
 
 
533 aa  649    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18991  CTP synthetase  58.57 
 
 
536 aa  676    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.433411  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  66.92 
 
 
535 aa  765    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  56.51 
 
 
542 aa  639    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000300969 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  60.6 
 
 
558 aa  719    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  67.29 
 
 
535 aa  769    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  59.03 
 
 
558 aa  640    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0827  CTP synthetase  58.52 
 
 
553 aa  636    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.471877  normal  0.577462 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  62.85 
 
 
536 aa  721    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  62.85 
 
 
547 aa  721    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  61.02 
 
 
551 aa  678    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  68.22 
 
 
533 aa  765    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  59.07 
 
 
555 aa  649    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2536  CTP synthetase  58.11 
 
 
539 aa  656    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  69.1 
 
 
535 aa  770    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  69.1 
 
 
535 aa  770    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0170  CTP synthetase  56.74 
 
 
535 aa  637    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.357981 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2872  CTP synthetase  59.63 
 
 
571 aa  688    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0028  CTP synthetase  60.97 
 
 
534 aa  672    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.23296  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0174  CTP synthetase  58.23 
 
 
542 aa  671    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.472124  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  57.25 
 
 
540 aa  656    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  56.51 
 
 
542 aa  638    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  64.86 
 
 
542 aa  743    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1325  CTP synthetase  62.64 
 
 
536 aa  686    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00186219  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0097  CTP synthetase  59.55 
 
 
565 aa  649    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000852269  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0497  CTP synthetase  57.6 
 
 
535 aa  664    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0144764  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1786  CTP synthetase  58.1 
 
 
544 aa  663    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0226  CTP synthetase  57.33 
 
 
540 aa  646    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000246238  hitchhiker  4.1491499999999996e-20 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0519  CTP synthetase  56.64 
 
 
537 aa  650    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.354414  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0193  CTP synthetase  59.93 
 
 
534 aa  691    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0420117  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2887  CTP synthetase  65.29 
 
 
537 aa  726    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  59.56 
 
 
557 aa  657    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1557  CTP synthetase  58.82 
 
 
547 aa  648    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.591143  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  66.73 
 
 
535 aa  764    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1093  CTP synthetase  57.01 
 
 
533 aa  645    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1614  CTP synthetase  60.75 
 
 
535 aa  642    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.23037  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2661  CTP synthetase  60.41 
 
 
565 aa  662    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00871872  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2485  CTP synthetase  57.17 
 
 
569 aa  651    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.996454  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  63.3 
 
 
534 aa  714    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  62.97 
 
 
545 aa  712    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  59.82 
 
 
553 aa  658    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0105  CTP synthetase  59.74 
 
 
569 aa  657    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000148991  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  65.73 
 
 
540 aa  726    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>