More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0827 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  58.52 
 
 		 535 aa  636    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1730  CTP synthase  67.45 
 
 		 555 aa  769    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0827  CTP synthetase  100 
 
 		 553 aa  1120    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.471877  normal  0.577462 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1439  CTP synthase  69.14 
 
 		 545 aa  757    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  59.25 
 
 		 547 aa  629  1e-179  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  56.8 
 
 		 542 aa  621  1e-177  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  56.16 
 
 		 531 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  56.25 
 
 		 533 aa  612  9.999999999999999e-175  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  56.05 
 
 		 534 aa  608  1e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  56.16 
 
 		 533 aa  609  1e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  56.13 
 
 		 541 aa  610  1e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  55.27 
 
 		 536 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  55.88 
 
 		 533 aa  607  9.999999999999999e-173  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  56.18 
 
 		 540 aa  607  9.999999999999999e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  54.75 
 
 		 535 aa  607  9.999999999999999e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  54.75 
 
 		 535 aa  607  9.999999999999999e-173  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0071  CTP synthase  54.39 
 
 		 559 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  55.78 
 
 		 537 aa  602  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  55.15 
 
 		 533 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  55.12 
 
 		 531 aa  601  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0174  CTP synthetase  53.48 
 
 		 542 aa  598  1e-170  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.472124  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2785  CTP synthetase  55.51 
 
 		 538 aa  601  1e-170  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963897  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  54 
 
 		 533 aa  597  1e-169  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  53.27 
 
 		 558 aa  595  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0230  CTP synthetase  55.95 
 
 		 534 aa  597  1e-169  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181921  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1093  CTP synthetase  53.63 
 
 		 533 aa  596  1e-169  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  57.43 
 
 		 538 aa  596  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0028  CTP synthetase  54.23 
 
 		 534 aa  595  1e-169  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.23296  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  56.13 
 
 		 555 aa  597  1e-169  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3115  CTP synthetase  55.02 
 
 		 557 aa  595  1e-169  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000124409  hitchhiker  0.00148298 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  54 
 
 		 546 aa  594  1e-168  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2887  CTP synthetase  56.27 
 
 		 537 aa  593  1e-168  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  55.87 
 
 		 536 aa  590  1e-167  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  53.23 
 
 		 535 aa  589  1e-167  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  52.89 
 
 		 535 aa  589  1e-167  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  53.6 
 
 		 535 aa  590  1e-167  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  53.42 
 
 		 535 aa  589  1e-167  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  53.87 
 
 		 545 aa  589  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  53.6 
 
 		 535 aa  590  1e-167  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  53.42 
 
 		 535 aa  588  1e-167  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  55.68 
 
 		 555 aa  588  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  53.64 
 
 		 547 aa  590  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  53.46 
 
 		 547 aa  590  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  53.42 
 
 		 535 aa  589  1e-167  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4305  CTP synthetase  55.87 
 
 		 555 aa  588  1e-167  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2106  CTP synthetase  55.24 
 
 		 533 aa  588  1e-167  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0473416  normal  0.014711 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  53.42 
 
 		 535 aa  589  1e-167  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  53.83 
 
 		 545 aa  588  1e-167  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  53.23 
 
 		 535 aa  588  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0107  CTP synthetase  51.77 
 
 		 534 aa  586  1e-166  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0171408  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  53.23 
 
 		 535 aa  587  1e-166  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  53.23 
 
 		 535 aa  587  1e-166  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4327  CTP synthetase  55.68 
 
 		 555 aa  587  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  53.42 
 
 		 535 aa  587  1e-166  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  54.48 
 
 		 534 aa  587  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  54.14 
 
 		 555 aa  587  1e-166  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1135  CTP synthetase  54.24 
 
 		 535 aa  586  1e-166  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  54.77 
 
 		 532 aa  587  1e-166  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  55.04 
 
 		 534 aa  584  1.0000000000000001e-165  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  56.72 
 
 		 551 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21631  CTP synthetase  52.53 
 
 		 555 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.397558 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  53.03 
 
 		 542 aa  583  1.0000000000000001e-165  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3086  CTP synthase  55.04 
 
 		 571 aa  582  1.0000000000000001e-165  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0193  CTP synthetase  52.04 
 
 		 534 aa  582  1.0000000000000001e-165  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0420117  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  55.35 
 
 		 542 aa  582  1.0000000000000001e-165  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1183  CTP synthase  54.65 
 
 		 535 aa  578  1e-164  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0724747  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1727  CTP synthetase  55.87 
 
 		 535 aa  580  1e-164  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0170  CTP synthetase  53.04 
 
 		 535 aa  580  1e-164  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.357981 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1291  CTP synthetase  52.85 
 
 		 555 aa  580  1e-164  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08750  CTP synthetase  54.95 
 
 		 535 aa  580  1e-164  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  unclonable  0.00000000194145 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2598  CTP synthetase  52.85 
 
 		 549 aa  578  1e-164  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0553655  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0320  CTP synthetase  54.43 
 
 		 555 aa  580  1e-164  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0433  CTP synthetase  52.84 
 
 		 550 aa  579  1e-164  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589327 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  51.77 
 
 		 536 aa  581  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1563  CTP synthetase  52.81 
 
 		 534 aa  578  1e-164  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0325  CTP synthetase  53.82 
 
 		 534 aa  580  1e-164  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000736967  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  51.77 
 
 		 536 aa  581  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  54.95 
 
 		 553 aa  580  1e-164  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1387  CTP synthetase  53.75 
 
 		 549 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0157  CTP synthetase  52.79 
 
 		 539 aa  578  1.0000000000000001e-163  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.337203  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1472  CTP synthase  55.21 
 
 		 555 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2586  CTP synthetase  52.14 
 
 		 538 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0528943 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1872  CTP synthetase  54.07 
 
 		 555 aa  576  1.0000000000000001e-163  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1325  CTP synthetase  53.54 
 
 		 536 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00186219  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1607  CTP synthetase  54.95 
 
 		 546 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.353292 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09600  CTP synthetase  54.66 
 
 		 532 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0671161 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18211  CTP synthetase  53.23 
 
 		 555 aa  577  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2485  CTP synthetase  53.56 
 
 		 569 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.996454  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0878  CTP synthetase  55.58 
 
 		 528 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  53.85 
 
 		 542 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1743  CTP synthetase  53.45 
 
 		 547 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0432346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0228  CTP synthetase  54.66 
 
 		 531 aa  573  1.0000000000000001e-162  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0116565 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  54.03 
 
 		 542 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  53.66 
 
 		 542 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300969 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2751  CTP synthase  53.44 
 
 		 555 aa  573  1.0000000000000001e-162  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0184273 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  53.85 
 
 		 542 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1557  CTP synthetase  54.4 
 
 		 547 aa  574  1.0000000000000001e-162  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.591143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  54.36 
 
 		 543 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0052  CTP synthetase  54.28 
 
 		 554 aa  573  1.0000000000000001e-162  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0427  CTP synthetase  52.85 
 
 		 552 aa  569  1e-161  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.441516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>