More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1727 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  57.3 
 
 		 542 aa  649    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  79.63 
 
 		 536 aa  908    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2513  CTP synthetase  58.96 
 
 		 552 aa  648    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294945  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2979  CTP synthetase  81.29 
 
 		 534 aa  895    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.535852  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  57.2 
 
 		 535 aa  646    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  57.01 
 
 		 535 aa  645    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0052  CTP synthetase  58.57 
 
 		 554 aa  645    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4305  CTP synthetase  64.61 
 
 		 555 aa  725    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2613  CTP synthetase  78.57 
 
 		 533 aa  863    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2887  CTP synthetase  57.36 
 
 		 537 aa  636    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  57.01 
 
 		 535 aa  645    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  57.38 
 
 		 535 aa  648    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  57.2 
 
 		 535 aa  648    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  57.2 
 
 		 535 aa  647    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1250  CTP synthase  58.71 
 
 		 530 aa  648    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  61.68 
 
 		 535 aa  681    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0071  CTP synthase  59.01 
 
 		 559 aa  660    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1716  CTP synthase  57.76 
 
 		 545 aa  643    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0975  CTP synthetase  59.45 
 
 		 547 aa  651    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2366  CTP synthetase  60.55 
 
 		 546 aa  672    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.863535  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1727  CTP synthetase  100 
 
 		 535 aa  1113    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  57.2 
 
 		 535 aa  647    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1872  CTP synthetase  59.3 
 
 		 555 aa  642    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0619  CTP synthetase  62.13 
 
 		 546 aa  691    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.626167  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2785  CTP synthetase  56.16 
 
 		 538 aa  637    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963897  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  59.29 
 
 		 545 aa  649    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  58.98 
 
 		 531 aa  659    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0850  CTP synthetase  57.93 
 
 		 550 aa  649    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  71.35 
 
 		 534 aa  808    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  61.25 
 
 		 533 aa  680    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4327  CTP synthetase  64.04 
 
 		 555 aa  721    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  62.73 
 
 		 553 aa  699    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  80.56 
 
 		 538 aa  922    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  61.67 
 
 		 548 aa  689    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1262  CTP synthetase  58.6 
 
 		 543 aa  650    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  57.38 
 
 		 535 aa  648    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0662  CTP synthetase  60.93 
 
 		 549 aa  665    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  60.87 
 
 		 546 aa  651    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  59.55 
 
 		 545 aa  649    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  59.25 
 
 		 533 aa  662    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  59.43 
 
 		 537 aa  657    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  64.23 
 
 		 555 aa  722    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1607  CTP synthetase  61.18 
 
 		 546 aa  681    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.353292 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  57.71 
 
 		 532 aa  642    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0320  CTP synthetase  59.12 
 
 		 555 aa  638    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0668  CTP synthetase  57.25 
 
 		 545 aa  642    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00226842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  63.3 
 
 		 555 aa  719    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1243  CTP synthetase  56.72 
 
 		 543 aa  635    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1182  CTP synthetase  61.19 
 
 		 547 aa  672    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1911  CTP synthetase  61.62 
 
 		 542 aa  686    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.884152  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1093  CTP synthetase  56.52 
 
 		 533 aa  644    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  62.45 
 
 		 547 aa  687    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  59.92 
 
 		 536 aa  667    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1439  CTP synthetase  57.49 
 
 		 551 aa  635    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0767506  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  59.13 
 
 		 547 aa  646    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  57.01 
 
 		 535 aa  644    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  60.3 
 
 		 558 aa  664    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  59.59 
 
 		 542 aa  677    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  61.01 
 
 		 541 aa  673    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1298  CTP synthetase  58.96 
 
 		 544 aa  637    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  62.08 
 
 		 540 aa  675    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1661  CTP synthetase  59.81 
 
 		 550 aa  652    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2751  CTP synthase  61.42 
 
 		 555 aa  696    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0184273 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  57.97 
 
 		 535 aa  647    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  57.97 
 
 		 535 aa  647    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  59.55 
 
 		 531 aa  664    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  58.58 
 
 		 534 aa  655    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1563  CTP synthetase  58.91 
 
 		 534 aa  675    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  59.07 
 
 		 540 aa  659    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0156  CTP synthetase  61.76 
 
 		 546 aa  684    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  58.24 
 
 		 542 aa  664    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1600  CTP synthetase  78.57 
 
 		 533 aa  862    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  58.54 
 
 		 558 aa  651    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1472  CTP synthase  58.72 
 
 		 555 aa  672    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  56.64 
 
 		 542 aa  637    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300969 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0170  CTP synthetase  55.81 
 
 		 535 aa  635    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.357981 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1511  CTP synthetase  62.43 
 
 		 547 aa  699    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174656  decreased coverage  0.000112124 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0433  CTP synthetase  61.67 
 
 		 550 aa  687    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589327 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  64.56 
 
 		 557 aa  724    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1557  CTP synthetase  59.96 
 
 		 547 aa  660    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.591143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  56.82 
 
 		 535 aa  643    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1614  CTP synthetase  83.36 
 
 		 535 aa  917    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.23037  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  59.32 
 
 		 547 aa  649    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  57.2 
 
 		 535 aa  649    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  56.46 
 
 		 542 aa  634  1e-180  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  56.46 
 
 		 542 aa  634  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1119  CTP synthetase  56.54 
 
 		 543 aa  632  1e-180  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  56.46 
 
 		 542 aa  634  1e-180  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2598  CTP synthetase  58.33 
 
 		 549 aa  632  1e-180  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0553655  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1387  CTP synthetase  60 
 
 		 549 aa  634  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0617  CTP synthetase  57.6 
 
 		 548 aa  634  1e-180  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  57.46 
 
 		 543 aa  633  1e-180  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1634  CTP synthetase  56.8 
 
 		 545 aa  632  1e-180  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.883771  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2872  CTP synthetase  57.86 
 
 		 571 aa  632  1e-180  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  55.7 
 
 		 535 aa  631  1e-179  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2845  CTP synthetase  57.06 
 
 		 555 aa  630  1e-179  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0222  CTP synthetase  55.08 
 
 		 543 aa  629  1e-179  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.555048  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0139  CTP synthetase  58.19 
 
 		 564 aa  630  1e-179  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1151  CTP synthetase  55.41 
 
 		 554 aa  628  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.485284  normal  0.0237518 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1552  CTP synthase  56.46 
 
 		 543 aa  625  1e-178  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.873983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>