More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1093 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  55.91 
 
 		 533 aa  645    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  57.28 
 
 		 536 aa  644    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2513  CTP synthetase  56.83 
 
 		 552 aa  641    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294945  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1093  CTP synthetase  100 
 
 		 533 aa  1088    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1607  CTP synthetase  57.12 
 
 		 546 aa  640    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.353292 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1563  CTP synthetase  64.38 
 
 		 534 aa  709    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4327  CTP synthetase  57.28 
 
 		 555 aa  637    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0433  CTP synthetase  57.27 
 
 		 550 aa  646    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589327 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0619  CTP synthetase  56.35 
 
 		 546 aa  639    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.626167  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1872  CTP synthetase  57.56 
 
 		 555 aa  648    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1511  CTP synthetase  57.38 
 
 		 547 aa  649    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174656  decreased coverage  0.000112124 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  55.98 
 
 		 534 aa  647    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  55.66 
 
 		 531 aa  648    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  57.2 
 
 		 553 aa  640    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  56.52 
 
 		 538 aa  642    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  58.26 
 
 		 548 aa  652    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4305  CTP synthetase  57.66 
 
 		 555 aa  640    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  57.2 
 
 		 547 aa  642    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  56.66 
 
 		 537 aa  654    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  57.28 
 
 		 555 aa  637    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0320  CTP synthetase  57.56 
 
 		 555 aa  647    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  58.03 
 
 		 555 aa  637    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0156  CTP synthetase  57.86 
 
 		 546 aa  638    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1911  CTP synthetase  56.62 
 
 		 542 aa  638    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.884152  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1182  CTP synthetase  58.02 
 
 		 547 aa  649    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0662  CTP synthetase  55.43 
 
 		 549 aa  638    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  57.74 
 
 		 534 aa  647    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  58.11 
 
 		 542 aa  663    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  55.56 
 
 		 531 aa  647    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1472  CTP synthase  55.76 
 
 		 555 aa  640    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  58.65 
 
 		 533 aa  665    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  56.23 
 
 		 535 aa  637    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  56.23 
 
 		 535 aa  637    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  58.76 
 
 		 541 aa  660    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  55.56 
 
 		 540 aa  640    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  56.47 
 
 		 542 aa  644    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  57.01 
 
 		 535 aa  645    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  57.76 
 
 		 536 aa  650    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  55.96 
 
 		 557 aa  637    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0028  CTP synthetase  56.77 
 
 		 534 aa  634    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.23296  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2785  CTP synthetase  56 
 
 		 538 aa  657    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963897  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0850  CTP synthetase  54.9 
 
 		 550 aa  633  1e-180  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  55.2 
 
 		 542 aa  632  1e-180  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  56.98 
 
 		 533 aa  632  1e-180  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  55.74 
 
 		 540 aa  633  1e-180  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  55.2 
 
 		 542 aa  632  1e-180  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  54.12 
 
 		 536 aa  629  1e-179  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1035  CTP synthetase  56.59 
 
 		 545 aa  628  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.946581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  53.47 
 
 		 535 aa  628  1e-179  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  53.47 
 
 		 535 aa  630  1e-179  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1727  CTP synthetase  56.52 
 
 		 535 aa  628  1e-179  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  53.66 
 
 		 535 aa  630  1e-179  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  53.66 
 
 		 535 aa  630  1e-179  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  53.66 
 
 		 535 aa  630  1e-179  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2613  CTP synthetase  57.25 
 
 		 533 aa  630  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1600  CTP synthetase  57.06 
 
 		 533 aa  629  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  53.66 
 
 		 535 aa  631  1e-179  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  53.66 
 
 		 535 aa  630  1e-179  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  54.12 
 
 		 536 aa  629  1e-179  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  53.66 
 
 		 535 aa  630  1e-179  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  53.66 
 
 		 535 aa  630  1e-179  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0617  CTP synthetase  57.22 
 
 		 548 aa  630  1e-179  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0174  CTP synthetase  55.95 
 
 		 542 aa  628  1e-179  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.472124  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03082  CTP synthetase  56.51 
 
 		 543 aa  629  1e-179  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000772842  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0668  CTP synthetase  55 
 
 		 545 aa  629  1e-179  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00226842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  56.6 
 
 		 533 aa  625  1e-178  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0071  CTP synthase  55.37 
 
 		 559 aa  628  1e-178  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  55.83 
 
 		 532 aa  626  1e-178  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0230  CTP synthetase  55.43 
 
 		 534 aa  625  1e-178  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181921  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1184  CTP synthetase  56.93 
 
 		 546 aa  627  1e-178  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0154566  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  53.1 
 
 		 535 aa  626  1e-178  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1439  CTP synthetase  54.98 
 
 		 551 aa  624  1e-178  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0767506  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  55.83 
 
 		 558 aa  626  1e-178  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  56.95 
 
 		 551 aa  625  1e-178  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  53.28 
 
 		 535 aa  627  1e-178  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1051  CTP synthetase  56.64 
 
 		 545 aa  625  1e-178  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.333074  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1204  CTP synthetase  57.49 
 
 		 545 aa  625  1e-178  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000204322  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  54.88 
 
 		 542 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  54.87 
 
 		 535 aa  624  1e-177  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  54.88 
 
 		 542 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  54.55 
 
 		 547 aa  622  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2751  CTP synthase  55.53 
 
 		 555 aa  623  1e-177  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0184273 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1119  CTP synthetase  54.53 
 
 		 543 aa  622  1e-177  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2979  CTP synthetase  56.63 
 
 		 534 aa  622  1e-177  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.535852  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  54.7 
 
 		 542 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  56.04 
 
 		 533 aa  622  1e-177  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3351  CTP synthetase  57.25 
 
 		 545 aa  624  1e-177  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000138422  hitchhiker  0.0000252338 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3265  CTP synthetase  56.64 
 
 		 543 aa  624  1e-177  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1634  CTP synthetase  56.01 
 
 		 545 aa  621  1e-177  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.883771  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2586  CTP synthetase  56.33 
 
 		 538 aa  621  1e-177  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0528943 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1151  CTP synthetase  56.36 
 
 		 554 aa  621  1e-177  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.485284  normal  0.0237518 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  54.36 
 
 		 547 aa  621  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0052  CTP synthetase  55.83 
 
 		 554 aa  620  1e-176  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1298  CTP synthetase  57.09 
 
 		 544 aa  621  1e-176  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1262  CTP synthetase  54.34 
 
 		 543 aa  620  1e-176  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1227  CTP synthetase  55.58 
 
 		 566 aa  620  1e-176  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1325  CTP synthetase  57.25 
 
 		 536 aa  619  1e-176  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00186219  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1661  CTP synthetase  55.97 
 
 		 550 aa  620  1e-176  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1114  CTP synthetase  55.84 
 
 		 546 aa  618  1e-176  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000131384  normal  0.869869 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1115  CTP synthetase  55.84 
 
 		 546 aa  618  1e-176  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000891455  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>