More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0291 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  65.66 
 
 
535 aa  745    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18211  CTP synthetase  61.79 
 
 
555 aa  699    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1410  CTP synthetase  60.08 
 
 
544 aa  637    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0373811  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  61.19 
 
 
536 aa  684    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1563  CTP synthetase  59.06 
 
 
534 aa  657    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1511  CTP synthetase  58.89 
 
 
547 aa  654    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174656  decreased coverage  0.000112124 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2692  CTP synthetase  59.18 
 
 
536 aa  675    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  63.48 
 
 
535 aa  714    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4305  CTP synthetase  58.08 
 
 
555 aa  635    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1600  CTP synthetase  61.51 
 
 
533 aa  645    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3128  CTP synthetase  58.35 
 
 
545 aa  642    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000112535  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  66.35 
 
 
535 aa  750    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1727  CTP synthetase  58.58 
 
 
535 aa  635    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18801  CTP synthetase  60.9 
 
 
536 aa  696    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0107  CTP synthetase  58.03 
 
 
534 aa  665    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0171408  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  62.43 
 
 
533 aa  689    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3441  CTP synthetase  57.43 
 
 
546 aa  636    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  58.49 
 
 
553 aa  649    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  66.04 
 
 
535 aa  750    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  66.35 
 
 
535 aa  750    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18991  CTP synthetase  61.28 
 
 
536 aa  701    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.433411  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  66.54 
 
 
535 aa  751    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1093  CTP synthetase  57.74 
 
 
533 aa  647    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0105  CTP synthetase  60.82 
 
 
569 aa  654    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000148991  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  63.18 
 
 
533 aa  698    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3280  CTP synthetase  58.35 
 
 
545 aa  642    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000222232  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  62.24 
 
 
533 aa  687    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1199  CTP synthetase  58.04 
 
 
581 aa  644    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.129574  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1291  CTP synthetase  60.34 
 
 
555 aa  689    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18801  CTP synthetase  60.42 
 
 
536 aa  678    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.061143  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0230  CTP synthetase  60.41 
 
 
534 aa  671    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181921  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1184  CTP synthetase  58.17 
 
 
546 aa  635    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0154566  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  61.98 
 
 
545 aa  705    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  62.41 
 
 
536 aa  713    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1236  CTP synthetase  58.53 
 
 
545 aa  643    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000161678  hitchhiker  0.00000000200253 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  61.09 
 
 
534 aa  675    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  78.13 
 
 
542 aa  873    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0100  CTP synthetase  59.67 
 
 
597 aa  644    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000644202  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2235  CTP synthetase  60.49 
 
 
549 aa  692    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  71.51 
 
 
533 aa  799    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2598  CTP synthetase  61.44 
 
 
549 aa  704    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0553655  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  60.82 
 
 
538 aa  676    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  59.63 
 
 
548 aa  663    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  66.04 
 
 
535 aa  749    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  66.04 
 
 
535 aa  750    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1782  CTP synthetase  61.47 
 
 
536 aa  699    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  63.31 
 
 
546 aa  715    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21631  CTP synthetase  60.34 
 
 
555 aa  689    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.397558 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  67.67 
 
 
537 aa  757    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  63.45 
 
 
545 aa  706    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3157  CTP synthetase  57.14 
 
 
608 aa  653    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0522365  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2979  CTP synthetase  61.51 
 
 
534 aa  654    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.535852  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  62.41 
 
 
536 aa  713    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0325  CTP synthetase  65.04 
 
 
534 aa  745    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000736967  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0052  CTP synthetase  58.25 
 
 
554 aa  638    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2887  CTP synthetase  66.41 
 
 
537 aa  722    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29581  CTP synthetase  60.34 
 
 
558 aa  686    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1325  CTP synthetase  59.59 
 
 
536 aa  656    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00186219  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1195  CTP synthetase  57.61 
 
 
545 aa  637    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.111429  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2383  CTP synthetase  58.06 
 
 
537 aa  648    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.508995  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0097  CTP synthetase  59.11 
 
 
565 aa  640    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000852269  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0028  CTP synthetase  61.54 
 
 
534 aa  682    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.23296  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1872  CTP synthetase  56.19 
 
 
555 aa  635    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3115  CTP synthetase  62.5 
 
 
557 aa  701    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000124409  hitchhiker  0.00148298 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0222  CTP synthetase  56.01 
 
 
543 aa  635    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.555048  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  57.51 
 
 
558 aa  655    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1217  CTP synthetase  60.08 
 
 
544 aa  637    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  70.02 
 
 
533 aa  783    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3137  CTP synthetase  58.35 
 
 
545 aa  642    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000110473  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  60.46 
 
 
551 aa  668    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3265  CTP synthetase  59.93 
 
 
543 aa  644    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0174  CTP synthetase  58.56 
 
 
542 aa  667    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.472124  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2536  CTP synthetase  57.52 
 
 
539 aa  642    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  70.11 
 
 
535 aa  805    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  70.11 
 
 
535 aa  805    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  65.09 
 
 
535 aa  743    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2872  CTP synthetase  59.44 
 
 
571 aa  682    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1114  CTP synthetase  57.61 
 
 
546 aa  640    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000131384  normal  0.869869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1185  CTP synthetase  57.98 
 
 
546 aa  643    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000285694  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  56.56 
 
 
540 aa  637    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1051  CTP synthetase  58.35 
 
 
545 aa  640    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.333074  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  64.41 
 
 
542 aa  728    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2758  CTP synthetase  58.35 
 
 
545 aa  644    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000221418  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1439  CTP synthetase  57.3 
 
 
551 aa  638    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0767506  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  67.17 
 
 
540 aa  746    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0497  CTP synthetase  56.02 
 
 
535 aa  644    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0144764  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1786  CTP synthetase  57.01 
 
 
544 aa  648    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0226  CTP synthetase  57.17 
 
 
540 aa  638    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000246238  hitchhiker  4.1491499999999996e-20 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  62.95 
 
 
547 aa  713    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0193  CTP synthetase  59.55 
 
 
534 aa  671    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0420117  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  64.2 
 
 
534 aa  719    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  58.6 
 
 
557 aa  652    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1557  CTP synthetase  57.38 
 
 
547 aa  642    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.591143  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1115  CTP synthetase  57.61 
 
 
546 aa  640    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000891455  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  58.35 
 
 
555 aa  640    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1614  CTP synthetase  60 
 
 
535 aa  635    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.23037  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2661  CTP synthetase  60.45 
 
 
565 aa  654    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00871872  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  60.68 
 
 
558 aa  705    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1035  CTP synthetase  58.35 
 
 
545 aa  635    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.946581  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  62.19 
 
 
555 aa  696    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>