More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0107 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  71.99 
 
 
535 aa  824    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  72.18 
 
 
535 aa  826    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  65.16 
 
 
535 aa  755    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  61.32 
 
 
541 aa  715    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  72.37 
 
 
535 aa  827    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  55.66 
 
 
545 aa  639    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0107  CTP synthetase  100 
 
 
534 aa  1107    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0171408  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0230  CTP synthetase  69.61 
 
 
534 aa  798    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181921  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  72.18 
 
 
535 aa  827    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  71.99 
 
 
535 aa  825    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  72.18 
 
 
535 aa  827    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21631  CTP synthetase  55.77 
 
 
555 aa  641    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.397558 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  59.74 
 
 
533 aa  695    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  72.18 
 
 
535 aa  827    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  71.99 
 
 
535 aa  825    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1291  CTP synthetase  55.58 
 
 
555 aa  640    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  58.03 
 
 
534 aa  665    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  55.47 
 
 
545 aa  642    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2035  CTP synthase  58.83 
 
 
533 aa  685    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00063614  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2785  CTP synthetase  59.74 
 
 
538 aa  702    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963897  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  58.35 
 
 
540 aa  674    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  56.02 
 
 
547 aa  654    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  56.98 
 
 
547 aa  646    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  57.22 
 
 
534 aa  671    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  70.06 
 
 
531 aa  803    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  72.18 
 
 
535 aa  827    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1782  CTP synthetase  54.41 
 
 
536 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  55.66 
 
 
546 aa  645    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  61.05 
 
 
536 aa  703    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  61.63 
 
 
537 aa  710    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  72.37 
 
 
535 aa  830    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  60.11 
 
 
542 aa  688    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  72.18 
 
 
535 aa  827    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  55.51 
 
 
555 aa  635    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  64.66 
 
 
536 aa  749    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  60.26 
 
 
533 aa  689    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3115  CTP synthetase  56.45 
 
 
557 aa  645    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000124409  hitchhiker  0.00148298 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  56.42 
 
 
551 aa  641    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  60.45 
 
 
535 aa  706    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  60.45 
 
 
535 aa  706    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  64.66 
 
 
536 aa  749    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  58.99 
 
 
535 aa  691    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2887  CTP synthetase  59.1 
 
 
537 aa  672    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  57.06 
 
 
542 aa  669    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0497  CTP synthetase  78.99 
 
 
535 aa  907    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0144764  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1786  CTP synthetase  62.45 
 
 
544 aa  733    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0226  CTP synthetase  66.48 
 
 
540 aa  751    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000246238  hitchhiker  4.1491499999999996e-20 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0519  CTP synthetase  65.47 
 
 
537 aa  758    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.354414  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0193  CTP synthetase  90.45 
 
 
534 aa  1014    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0420117  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  69.55 
 
 
531 aa  798    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0040  CTP synthase  57.25 
 
 
531 aa  643    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  55.37 
 
 
558 aa  651    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  56.02 
 
 
547 aa  654    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  60.9 
 
 
532 aa  701    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2598  CTP synthetase  55.53 
 
 
549 aa  634  1e-180  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0553655  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18211  CTP synthetase  55.2 
 
 
555 aa  632  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0475  CTP synthetase  56.82 
 
 
549 aa  634  1e-180  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.984094 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  57.01 
 
 
533 aa  633  1e-180  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18801  CTP synthetase  53.93 
 
 
536 aa  628  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.061143  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18991  CTP synthetase  53.66 
 
 
536 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.433411  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2872  CTP synthetase  53.41 
 
 
571 aa  628  1e-179  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18801  CTP synthetase  53.47 
 
 
536 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1563  CTP synthetase  52.84 
 
 
534 aa  626  1e-178  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1607  CTP synthetase  54.98 
 
 
546 aa  625  1e-178  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.353292 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0174  CTP synthetase  54.92 
 
 
542 aa  625  1e-178  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.472124  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2235  CTP synthetase  55.16 
 
 
549 aa  627  1e-178  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1743  CTP synthetase  54.41 
 
 
547 aa  627  1e-178  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0432346  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0028  CTP synthetase  55.51 
 
 
534 aa  627  1e-178  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.23296  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0325  CTP synthetase  55.26 
 
 
534 aa  622  1e-177  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000736967  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08750  CTP synthetase  55.56 
 
 
535 aa  622  1e-177  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  unclonable  0.00000000194145 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2240  CTP synthase  55.26 
 
 
538 aa  621  1e-177  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.480031  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29581  CTP synthetase  54.82 
 
 
558 aa  624  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09600  CTP synthetase  54.61 
 
 
532 aa  624  1e-177  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0671161 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  55.14 
 
 
533 aa  623  1e-177  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  55.14 
 
 
533 aa  622  1e-177  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1387  CTP synthetase  56.52 
 
 
549 aa  624  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0071  CTP synthase  53.96 
 
 
559 aa  620  1e-176  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2586  CTP synthetase  54.39 
 
 
538 aa  621  1e-176  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0528943 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3157  CTP synthetase  53.99 
 
 
608 aa  615  1e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0522365  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4305  CTP synthetase  54.89 
 
 
555 aa  615  1e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1325  CTP synthetase  53.58 
 
 
536 aa  615  1e-175  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00186219  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1557  CTP synthetase  54.51 
 
 
547 aa  617  1e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.591143  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1135  CTP synthetase  53.56 
 
 
535 aa  617  1e-175  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1250  CTP synthase  54.43 
 
 
530 aa  617  1e-175  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  54.7 
 
 
555 aa  614  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4327  CTP synthetase  54.7 
 
 
555 aa  614  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2106  CTP synthetase  53.5 
 
 
533 aa  613  9.999999999999999e-175  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0473416  normal  0.014711 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  54.14 
 
 
536 aa  608  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3086  CTP synthase  54.87 
 
 
571 aa  608  1e-173  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716725  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0156  CTP synthetase  54.41 
 
 
546 aa  608  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1132  CTP synthetase  52.69 
 
 
558 aa  607  9.999999999999999e-173  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25420  CTP synthetase  55.82 
 
 
566 aa  608  9.999999999999999e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.199429 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08471  CTP synthetase  53.12 
 
 
539 aa  608  9.999999999999999e-173  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.859496  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  54.32 
 
 
538 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  53.43 
 
 
548 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1754  CTP synthetase  53.76 
 
 
652 aa  607  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206256  hitchhiker  0.00103098 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0969  CTP synthase  53.9 
 
 
546 aa  607  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.538068  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0157  CTP synthetase  52.44 
 
 
539 aa  603  1.0000000000000001e-171  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.337203  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  53.18 
 
 
558 aa  603  1.0000000000000001e-171  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2536  CTP synthetase  52.36 
 
 
539 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>