More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0497 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  59.96 
 
 		 541 aa  695    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2785  CTP synthetase  57.76 
 
 		 538 aa  676    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963897  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  60.57 
 
 		 535 aa  710    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  68.29 
 
 		 535 aa  793    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0107  CTP synthetase  78.99 
 
 		 534 aa  907    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0171408  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  67.73 
 
 		 535 aa  788    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  58.27 
 
 		 542 aa  665    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  67.92 
 
 		 535 aa  791    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  67.73 
 
 		 535 aa  790    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  68.11 
 
 		 535 aa  793    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  67.73 
 
 		 535 aa  790    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  65.35 
 
 		 531 aa  767    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2035  CTP synthase  56.82 
 
 		 533 aa  657    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00063614  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  68.11 
 
 		 535 aa  793    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  57.6 
 
 		 535 aa  664    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  67.92 
 
 		 535 aa  791    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2887  CTP synthetase  56.1 
 
 		 537 aa  638    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  56.95 
 
 		 536 aa  655    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  59.36 
 
 		 537 aa  691    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  56.02 
 
 		 534 aa  644    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  61.58 
 
 		 536 aa  719    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  54.61 
 
 		 534 aa  637    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3115  CTP synthetase  55.91 
 
 		 557 aa  636    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000124409  hitchhiker  0.00148298 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0230  CTP synthetase  65.98 
 
 		 534 aa  759    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181921  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  67.73 
 
 		 535 aa  789    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  60.15 
 
 		 535 aa  689    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  60.15 
 
 		 535 aa  689    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  60.76 
 
 		 533 aa  677    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  56.64 
 
 		 540 aa  645    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  66.23 
 
 		 531 aa  772    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0497  CTP synthetase  100 
 
 		 535 aa  1107    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0144764  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1786  CTP synthetase  61.89 
 
 		 544 aa  708    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0226  CTP synthetase  63.58 
 
 		 540 aa  723    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000246238  hitchhiker  4.1491499999999996e-20 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0519  CTP synthetase  64.03 
 
 		 537 aa  739    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.354414  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0193  CTP synthetase  77.67 
 
 		 534 aa  889    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0420117  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  57.82 
 
 		 532 aa  666    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  61.58 
 
 		 536 aa  719    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  57.14 
 
 		 533 aa  670    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  67.92 
 
 		 535 aa  791    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  68.11 
 
 		 535 aa  793    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  56.38 
 
 		 547 aa  629  1e-179  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  54.15 
 
 		 542 aa  630  1e-179  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  55.53 
 
 		 555 aa  625  1e-178  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0325  CTP synthetase  53.83 
 
 		 534 aa  614  1e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000736967  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  55.79 
 
 		 551 aa  615  1e-175  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1743  CTP synthetase  54.61 
 
 		 547 aa  616  1e-175  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0432346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21631  CTP synthetase  52.75 
 
 		 555 aa  612  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.397558 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0071  CTP synthase  54.36 
 
 		 559 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  52.07 
 
 		 545 aa  610  1e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  51.61 
 
 		 546 aa  608  1e-173  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0040  CTP synthase  55.95 
 
 		 531 aa  611  1e-173  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1291  CTP synthetase  52.37 
 
 		 555 aa  607  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  54.02 
 
 		 533 aa  606  9.999999999999999e-173  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  51.7 
 
 		 558 aa  606  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  51.41 
 
 		 547 aa  604  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  51.41 
 
 		 547 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2240  CTP synthase  53 
 
 		 538 aa  598  1e-170  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.480031  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1607  CTP synthetase  52.39 
 
 		 546 aa  600  1e-170  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.353292 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08750  CTP synthetase  54.82 
 
 		 535 aa  601  1e-170  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  unclonable  0.00000000194145 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1563  CTP synthetase  51.61 
 
 		 534 aa  600  1e-170  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0028  CTP synthetase  53.46 
 
 		 534 aa  599  1e-170  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.23296  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1135  CTP synthetase  52.72 
 
 		 535 aa  598  1e-170  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2598  CTP synthetase  52.94 
 
 		 549 aa  595  1e-169  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0553655  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  52.52 
 
 		 533 aa  595  1e-169  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  51.8 
 
 		 545 aa  595  1e-169  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09600  CTP synthetase  53.69 
 
 		 532 aa  597  1e-169  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0671161 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2586  CTP synthetase  52.62 
 
 		 538 aa  593  1e-168  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0528943 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1782  CTP synthetase  50.66 
 
 		 536 aa  593  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  51.96 
 
 		 533 aa  593  1e-168  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18211  CTP synthetase  51.8 
 
 		 555 aa  594  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0174  CTP synthetase  51.95 
 
 		 542 aa  590  1e-167  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.472124  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18801  CTP synthetase  50.57 
 
 		 536 aa  589  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1199  CTP synthetase  52.41 
 
 		 581 aa  590  1e-167  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.129574  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2235  CTP synthetase  52.75 
 
 		 549 aa  591  1e-167  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18801  CTP synthetase  50.19 
 
 		 536 aa  590  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.061143  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1250  CTP synthase  52.17 
 
 		 530 aa  589  1e-167  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18991  CTP synthetase  50.38 
 
 		 536 aa  587  1e-166  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.433411  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  51.59 
 
 		 536 aa  585  1e-166  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3086  CTP synthase  52.43 
 
 		 571 aa  587  1e-166  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2872  CTP synthetase  48.99 
 
 		 571 aa  587  1e-166  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29581  CTP synthetase  51.61 
 
 		 558 aa  587  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1132  CTP synthetase  52.13 
 
 		 558 aa  582  1.0000000000000001e-165  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1325  CTP synthetase  52.57 
 
 		 536 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00186219  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  52.43 
 
 		 538 aa  581  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0969  CTP synthase  52.5 
 
 		 546 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.538068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  52.26 
 
 		 555 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4327  CTP synthetase  52.26 
 
 		 555 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1487  CTP synthase  54.93 
 
 		 558 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.883119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2536  CTP synthetase  50.47 
 
 		 539 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1557  CTP synthetase  52.13 
 
 		 547 aa  584  1.0000000000000001e-165  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.591143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4305  CTP synthetase  52.26 
 
 		 555 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08471  CTP synthetase  50.56 
 
 		 539 aa  583  1.0000000000000001e-165  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.859496  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2692  CTP synthetase  50.75 
 
 		 536 aa  580  1e-164  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0475  CTP synthetase  52.81 
 
 		 549 aa  580  1e-164  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.984094 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2106  CTP synthetase  52.08 
 
 		 533 aa  581  1e-164  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0473416  normal  0.014711 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0156  CTP synthetase  51.83 
 
 		 546 aa  581  1e-164  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0157  CTP synthetase  50.28 
 
 		 539 aa  579  1e-164  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.337203  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1387  CTP synthetase  51.97 
 
 		 549 aa  579  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1191  CTP synthetase  53.79 
 
 		 544 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3157  CTP synthetase  51.76 
 
 		 608 aa  577  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0522365  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>