More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1276 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0975  CTP synthetase  60 
 
 		 547 aa  645    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21631  CTP synthetase  58.9 
 
 		 555 aa  642    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.397558 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  89.91 
 
 		 536 aa  1011    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  59.41 
 
 		 542 aa  658    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4327  CTP synthetase  67.04 
 
 		 555 aa  729    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  56.82 
 
 		 535 aa  640    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2513  CTP synthetase  60.82 
 
 		 552 aa  662    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294945  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1727  CTP synthetase  80.56 
 
 		 535 aa  900    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1563  CTP synthetase  60.11 
 
 		 534 aa  682    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  59.21 
 
 		 535 aa  660    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  62.69 
 
 		 541 aa  689    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  58.16 
 
 		 533 aa  642    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3443  CTP synthetase  58.44 
 
 		 559 aa  635    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  60.6 
 
 		 533 aa  677    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  59.04 
 
 		 542 aa  653    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1552  CTP synthase  59.38 
 
 		 543 aa  648    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.873983  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  59.4 
 
 		 535 aa  662    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  59.21 
 
 		 535 aa  662    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  59.21 
 
 		 535 aa  661    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  56.72 
 
 		 536 aa  641    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1184  CTP synthetase  59.45 
 
 		 545 aa  641    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1190  CTP synthetase  59.45 
 
 		 545 aa  642    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1361  CTP synthetase  59.38 
 
 		 543 aa  649    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0802006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1387  CTP synthetase  59.59 
 
 		 549 aa  647    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2366  CTP synthetase  62.52 
 
 		 546 aa  679    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.863535  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1291  CTP synthetase  58.9 
 
 		 555 aa  641    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1439  CTP synthetase  59.89 
 
 		 551 aa  667    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0767506  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0619  CTP synthetase  63.37 
 
 		 546 aa  691    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.626167  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  59.21 
 
 		 535 aa  661    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  59.17 
 
 		 545 aa  642    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  58.83 
 
 		 535 aa  659    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0850  CTP synthetase  59.63 
 
 		 550 aa  659    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1119  CTP synthetase  59.19 
 
 		 543 aa  652    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  75.28 
 
 		 534 aa  858    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  64.58 
 
 		 553 aa  724    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0320  CTP synthetase  61.45 
 
 		 555 aa  660    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2235  CTP synthetase  58.33 
 
 		 549 aa  636    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1093  CTP synthetase  56.52 
 
 		 533 aa  642    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2598  CTP synthetase  59.47 
 
 		 549 aa  648    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0553655  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  100 
 
 		 538 aa  1108    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  62.78 
 
 		 548 aa  694    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1262  CTP synthetase  62.96 
 
 		 543 aa  680    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  59.4 
 
 		 535 aa  662    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18211  CTP synthetase  58.9 
 
 		 555 aa  636    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  59.36 
 
 		 546 aa  651    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1227  CTP synthetase  60.04 
 
 		 566 aa  637    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1600  CTP synthetase  84.24 
 
 		 533 aa  922    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  61.31 
 
 		 537 aa  675    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  62.71 
 
 		 540 aa  690    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  67.23 
 
 		 555 aa  731    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  61.22 
 
 		 542 aa  688    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  59.77 
 
 		 532 aa  659    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  58.83 
 
 		 535 aa  659    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  59.41 
 
 		 542 aa  658    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1298  CTP synthetase  59.38 
 
 		 544 aa  639    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1243  CTP synthetase  59.37 
 
 		 543 aa  648    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1661  CTP synthetase  62.24 
 
 		 550 aa  660    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1911  CTP synthetase  62.36 
 
 		 542 aa  680    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.884152  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  60.11 
 
 		 545 aa  652    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0052  CTP synthetase  60.15 
 
 		 554 aa  661    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  59.41 
 
 		 542 aa  657    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300969 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0170  CTP synthetase  57.52 
 
 		 535 aa  641    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.357981 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0617  CTP synthetase  60.98 
 
 		 548 aa  654    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  59.41 
 
 		 542 aa  658    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  58 
 
 		 547 aa  655    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0433  CTP synthetase  62.59 
 
 		 550 aa  687    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589327 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0222  CTP synthetase  55.82 
 
 		 543 aa  639    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.555048  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  60.52 
 
 		 558 aa  681    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1511  CTP synthetase  61.31 
 
 		 547 aa  693    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174656  decreased coverage  0.000112124 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  61.39 
 
 		 533 aa  688    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  58.35 
 
 		 533 aa  644    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  60.82 
 
 		 534 aa  676    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  64.67 
 
 		 555 aa  717    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  59.02 
 
 		 535 aa  659    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  62.06 
 
 		 535 aa  677    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1634  CTP synthetase  58.26 
 
 		 545 aa  637    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.883771  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2536  CTP synthetase  58.03 
 
 		 539 aa  639    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  60.41 
 
 		 535 aa  665    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  60.41 
 
 		 535 aa  665    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4305  CTP synthetase  67.42 
 
 		 555 aa  731    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1182  CTP synthetase  63.81 
 
 		 547 aa  705    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  57.6 
 
 		 533 aa  640    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  57.25 
 
 		 534 aa  637    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  61.37 
 
 		 540 aa  680    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  59.85 
 
 		 543 aa  659    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  59.02 
 
 		 542 aa  670    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1408  CTP synthetase  58.74 
 
 		 542 aa  640    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0617949  hitchhiker  0.0000124662 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  56.72 
 
 		 536 aa  641    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  59.04 
 
 		 542 aa  653    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  59.21 
 
 		 535 aa  665    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29581  CTP synthetase  57.77 
 
 		 558 aa  635    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  56.87 
 
 		 558 aa  642    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  63.7 
 
 		 557 aa  721    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1557  CTP synthetase  60.63 
 
 		 547 aa  656    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.591143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  59.02 
 
 		 535 aa  659    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1614  CTP synthetase  79.63 
 
 		 535 aa  882    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.23037  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2979  CTP synthetase  87.38 
 
 		 534 aa  959    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.535852  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38810  CTP synthetase  58.64 
 
 		 543 aa  652    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1872  CTP synthetase  61.64 
 
 		 555 aa  664    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  60.37 
 
 		 542 aa  669    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>