More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_08750 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_18801  CTP synthetase  56.69 
 
 		 536 aa  644    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.061143  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  59.36 
 
 		 535 aa  664    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  57.36 
 
 		 547 aa  655    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  58.95 
 
 		 536 aa  665    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3115  CTP synthetase  58.41 
 
 		 557 aa  637    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000124409  hitchhiker  0.00148298 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  58.54 
 
 		 536 aa  658    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  57.2 
 
 		 535 aa  640    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  59.74 
 
 		 535 aa  665    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  60.3 
 
 		 535 aa  668    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  59.92 
 
 		 535 aa  665    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  59.92 
 
 		 535 aa  665    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18211  CTP synthetase  58.38 
 
 		 555 aa  655    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  61.81 
 
 		 531 aa  681    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1291  CTP synthetase  58.95 
 
 		 555 aa  663    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  60.19 
 
 		 541 aa  676    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  57.74 
 
 		 558 aa  666    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  57.28 
 
 		 545 aa  647    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2785  CTP synthetase  57.47 
 
 		 538 aa  641    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963897  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1250  CTP synthase  58.65 
 
 		 530 aa  642    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  61.63 
 
 		 547 aa  671    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2235  CTP synthetase  57.44 
 
 		 549 aa  638    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  55.91 
 
 		 534 aa  635    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2598  CTP synthetase  58.38 
 
 		 549 aa  654    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0553655  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  59.92 
 
 		 535 aa  666    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  60.3 
 
 		 535 aa  668    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1782  CTP synthetase  56.25 
 
 		 536 aa  635    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  56.9 
 
 		 546 aa  637    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  57.55 
 
 		 547 aa  657    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  59.4 
 
 		 533 aa  670    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  59.62 
 
 		 537 aa  664    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  58.19 
 
 		 542 aa  675    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  59.92 
 
 		 535 aa  665    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29581  CTP synthetase  57.01 
 
 		 558 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18801  CTP synthetase  56.5 
 
 		 536 aa  641    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  61.02 
 
 		 531 aa  682    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  59.29 
 
 		 540 aa  655    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  59.92 
 
 		 535 aa  665    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  59.74 
 
 		 535 aa  664    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09600  CTP synthetase  76.18 
 
 		 532 aa  851    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0671161 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18991  CTP synthetase  56.31 
 
 		 536 aa  640    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.433411  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08750  CTP synthetase  100 
 
 		 535 aa  1106    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  unclonable  0.00000000194145 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  59.55 
 
 		 532 aa  675    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  59.47 
 
 		 551 aa  651    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  58 
 
 		 535 aa  652    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  58 
 
 		 535 aa  652    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  58.54 
 
 		 536 aa  658    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2872  CTP synthetase  56.47 
 
 		 571 aa  659    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  58.61 
 
 		 542 aa  661    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21631  CTP synthetase  58.95 
 
 		 555 aa  662    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.397558 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  60.19 
 
 		 535 aa  686    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  57.09 
 
 		 545 aa  650    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0475  CTP synthetase  65.17 
 
 		 549 aa  715    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.984094 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  59.55 
 
 		 535 aa  664    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2106  CTP synthetase  75.98 
 
 		 533 aa  848    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0473416  normal  0.014711 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  61.81 
 
 		 533 aa  697    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0325  CTP synthetase  56.44 
 
 		 534 aa  633  1e-180  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000736967  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  56.37 
 
 		 534 aa  632  1e-180  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0433  CTP synthetase  56.98 
 
 		 550 aa  634  1e-180  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589327 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1199  CTP synthetase  57.96 
 
 		 581 aa  629  1e-179  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.129574  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  56.61 
 
 		 548 aa  630  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0230  CTP synthetase  57.17 
 
 		 534 aa  628  1e-179  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181921  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1519  CTP synthetase  56.51 
 
 		 597 aa  628  1e-179  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.154813  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1557  CTP synthetase  57.67 
 
 		 547 aa  629  1e-179  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.591143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  58.03 
 
 		 555 aa  627  1e-178  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2887  CTP synthetase  55.85 
 
 		 537 aa  627  1e-178  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0071  CTP synthase  55.28 
 
 		 559 aa  625  1e-178  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1518  CTP synthetase  56.19 
 
 		 587 aa  625  1e-178  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000885327 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0107  CTP synthetase  55.56 
 
 		 534 aa  622  1e-177  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0171408  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1511  CTP synthetase  55.58 
 
 		 547 aa  624  1e-177  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174656  decreased coverage  0.000112124 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  56.64 
 
 		 533 aa  622  1e-177  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25420  CTP synthetase  57.33 
 
 		 566 aa  623  1e-177  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.199429 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1135  CTP synthetase  56.55 
 
 		 535 aa  618  1e-176  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1387  CTP synthetase  56.25 
 
 		 549 aa  619  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22080  CTP synthase  57.06 
 
 		 554 aa  618  1e-176  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202828  normal  0.968992 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4064  CTP synthetase  55.82 
 
 		 583 aa  616  1e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.541211  normal  0.525358 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2035  CTP synthase  55.08 
 
 		 533 aa  616  1e-175  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00063614  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  55.7 
 
 		 533 aa  616  1e-175  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1743  CTP synthetase  56.06 
 
 		 547 aa  614  9.999999999999999e-175  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0432346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1607  CTP synthetase  55.33 
 
 		 546 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.353292 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  55.72 
 
 		 538 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  55.51 
 
 		 533 aa  614  9.999999999999999e-175  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1347  CTP synthase  55.87 
 
 		 560 aa  612  9.999999999999999e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543908  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0028  CTP synthetase  56.26 
 
 		 534 aa  613  9.999999999999999e-175  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.23296  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  54.43 
 
 		 536 aa  608  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  55.66 
 
 		 553 aa  609  1e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0052  CTP synthetase  56.26 
 
 		 554 aa  605  9.999999999999999e-173  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2349  CTP synthetase  56.3 
 
 		 567 aa  605  9.999999999999999e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00181138  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3141  CTP synthetase  54.92 
 
 		 572 aa  606  9.999999999999999e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151944  normal  0.766797 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1093  CTP synthetase  52.82 
 
 		 533 aa  606  9.999999999999999e-173  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2586  CTP synthetase  53.67 
 
 		 538 aa  606  9.999999999999999e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0528943 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1132  CTP synthetase  55.66 
 
 		 558 aa  605  9.999999999999999e-173  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1664  CTP synthase  56.82 
 
 		 553 aa  607  9.999999999999999e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0193  CTP synthetase  54.24 
 
 		 534 aa  605  9.999999999999999e-173  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0420117  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0174  CTP synthetase  54.07 
 
 		 542 aa  608  9.999999999999999e-173  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.472124  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1325  CTP synthetase  54.29 
 
 		 536 aa  608  9.999999999999999e-173  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00186219  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0608  CTP synthetase  54.07 
 
 		 553 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.235124  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1727  CTP synthetase  55.77 
 
 		 535 aa  601  1.0000000000000001e-171  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0969  CTP synthase  56.16 
 
 		 546 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.538068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0226  CTP synthetase  53.48 
 
 		 540 aa  603  1.0000000000000001e-171  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000246238  hitchhiker  4.1491499999999996e-20 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  56.87 
 
 		 555 aa  598  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>