More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3141 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1135  CTP synthetase  59.74 
 
 
535 aa  659    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0382  CTP synthase  69.98 
 
 
560 aa  807    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1664  CTP synthase  80.22 
 
 
553 aa  887    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.210101  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1754  CTP synthetase  74.67 
 
 
652 aa  832    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206256  hitchhiker  0.00103098 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11714  CTP synthetase  68.84 
 
 
586 aa  791    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.24232 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2959  CTP synthetase  67.71 
 
 
579 aa  796    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.736461 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1347  CTP synthase  76.78 
 
 
560 aa  883    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543908  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3001  CTP synthase  74.86 
 
 
566 aa  822    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.427451  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1199  CTP synthetase  72.76 
 
 
581 aa  833    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.129574  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1911  CTP synthetase  71.48 
 
 
581 aa  778    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.115982  hitchhiker  0.000439643 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3502  CTP synthetase  69.82 
 
 
585 aa  787    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.676775  normal  0.111203 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1518  CTP synthetase  78.11 
 
 
587 aa  873    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000885327 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  56.23 
 
 
541 aa  645    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2990  CTP synthase  76.03 
 
 
563 aa  838    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781575  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13730  CTP synthetase  71.07 
 
 
624 aa  820    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2377  CTP synthase  71.22 
 
 
581 aa  766    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0608  CTP synthetase  69.8 
 
 
553 aa  803    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.235124  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  58.18 
 
 
537 aa  638    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4064  CTP synthetase  71.02 
 
 
583 aa  816    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.541211  normal  0.525358 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3157  CTP synthetase  73.78 
 
 
608 aa  853    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0522365  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  57.22 
 
 
535 aa  646    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0969  CTP synthase  73.46 
 
 
546 aa  832    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.538068  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2823  CTP synthase  70.46 
 
 
578 aa  796    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.267203  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2836  CTP synthase  76.58 
 
 
559 aa  842    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0206831  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4432  CTP synthase  66.42 
 
 
587 aa  772    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.281255  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  58.69 
 
 
532 aa  641    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22080  CTP synthase  80.77 
 
 
554 aa  914    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202828  normal  0.968992 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2944  CTP synthetase  67.54 
 
 
579 aa  795    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  59.14 
 
 
551 aa  639    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  58.36 
 
 
535 aa  659    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  58.36 
 
 
535 aa  659    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  58.18 
 
 
533 aa  650    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  55.37 
 
 
542 aa  642    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5435  CTP synthetase  73.52 
 
 
589 aa  809    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00181043  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2349  CTP synthetase  79.74 
 
 
567 aa  890    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00181138  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1920  CTP synthetase  72.03 
 
 
581 aa  785    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.270417 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1487  CTP synthase  76.22 
 
 
558 aa  833    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.883119  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1132  CTP synthetase  78.86 
 
 
558 aa  899    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1519  CTP synthetase  75.4 
 
 
597 aa  880    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.154813  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5411  CTP synthetase  75.51 
 
 
565 aa  802    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1243  CTP synthetase  75.77 
 
 
558 aa  844    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0811753  normal  0.94922 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2485  CTP synthetase  74.82 
 
 
569 aa  879    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.996454  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3141  CTP synthetase  100 
 
 
572 aa  1169    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151944  normal  0.766797 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2988  CTP synthetase  67.54 
 
 
579 aa  795    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.705391  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3283  CTP synthetase  69.2 
 
 
583 aa  796    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  57.84 
 
 
533 aa  647    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25420  CTP synthetase  74.15 
 
 
566 aa  831    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.199429 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12400  CTP synthetase  76.38 
 
 
553 aa  843    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.023708  normal  0.233507 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14180  CTP synthetase  75.33 
 
 
563 aa  813    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.609851  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  57.7 
 
 
536 aa  632  1e-180  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  55.43 
 
 
533 aa  629  1e-179  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  56.05 
 
 
531 aa  631  1e-179  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1291  CTP synthetase  57.46 
 
 
555 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  56.67 
 
 
533 aa  630  1e-179  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  55.62 
 
 
533 aa  628  1e-179  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  56.1 
 
 
534 aa  630  1e-179  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  55.9 
 
 
542 aa  625  1e-178  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  55.78 
 
 
531 aa  627  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  58.4 
 
 
547 aa  627  1e-178  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21631  CTP synthetase  57.46 
 
 
555 aa  627  1e-178  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.397558 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  56.26 
 
 
540 aa  625  1e-178  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3115  CTP synthetase  56.55 
 
 
557 aa  623  1e-177  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000124409  hitchhiker  0.00148298 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  55.89 
 
 
547 aa  622  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  53.78 
 
 
558 aa  622  1e-177  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2785  CTP synthetase  57.41 
 
 
538 aa  624  1e-177  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963897  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  55.89 
 
 
547 aa  623  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  54.81 
 
 
536 aa  621  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  54.81 
 
 
536 aa  621  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  56.37 
 
 
555 aa  619  1e-176  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  56.26 
 
 
545 aa  618  1e-176  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0174  CTP synthetase  54.14 
 
 
542 aa  618  1e-175  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.472124  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  54.77 
 
 
545 aa  616  1e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  54.63 
 
 
534 aa  614  9.999999999999999e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1743  CTP synthetase  56.46 
 
 
547 aa  615  9.999999999999999e-175  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0432346  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0028  CTP synthetase  54.26 
 
 
534 aa  613  9.999999999999999e-175  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.23296  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29581  CTP synthetase  56.34 
 
 
558 aa  611  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  56.32 
 
 
536 aa  610  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2598  CTP synthetase  55.78 
 
 
549 aa  608  1e-173  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0553655  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1911  CTP synthetase  54.96 
 
 
542 aa  609  1e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.884152  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18211  CTP synthetase  55.04 
 
 
555 aa  611  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  54.77 
 
 
558 aa  608  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  54.35 
 
 
557 aa  610  1e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1557  CTP synthetase  57.22 
 
 
547 aa  610  1e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.591143  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  53.23 
 
 
535 aa  607  9.999999999999999e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0071  CTP synthase  54.61 
 
 
559 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2366  CTP synthetase  55.23 
 
 
546 aa  607  9.999999999999999e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.863535  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2235  CTP synthetase  56.16 
 
 
549 aa  606  9.999999999999999e-173  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1782  CTP synthetase  55.06 
 
 
536 aa  607  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  54.89 
 
 
546 aa  607  9.999999999999999e-173  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08750  CTP synthetase  54.92 
 
 
535 aa  606  9.999999999999999e-173  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  unclonable  0.00000000194145 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  56.72 
 
 
540 aa  605  9.999999999999999e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0433  CTP synthetase  53.83 
 
 
550 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589327 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0619  CTP synthetase  55.41 
 
 
546 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.626167  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18991  CTP synthetase  54.87 
 
 
536 aa  604  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.433411  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0230  CTP synthetase  53.54 
 
 
534 aa  603  1.0000000000000001e-171  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181921  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18801  CTP synthetase  55.06 
 
 
536 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1472  CTP synthase  54.87 
 
 
555 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  52.79 
 
 
535 aa  598  1e-170  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  54.17 
 
 
534 aa  599  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  52.6 
 
 
535 aa  598  1e-170  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>