More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2887 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0325  CTP synthetase  58.19 
 
 
534 aa  676    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000736967  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  58.22 
 
 
555 aa  648    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0040  CTP synthase  58.49 
 
 
531 aa  648    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0475  CTP synthetase  57.91 
 
 
549 aa  652    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.984094 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  57.55 
 
 
536 aa  652    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1387  CTP synthetase  59.47 
 
 
549 aa  660    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  59.62 
 
 
547 aa  677    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2692  CTP synthetase  55.81 
 
 
536 aa  640    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  63.47 
 
 
535 aa  728    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2513  CTP synthetase  56.54 
 
 
552 aa  646    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294945  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  66.16 
 
 
542 aa  764    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08750  CTP synthetase  55.85 
 
 
535 aa  643    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  unclonable  0.00000000194145 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  66.92 
 
 
535 aa  771    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  68.55 
 
 
533 aa  788    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  65.6 
 
 
533 aa  757    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0107  CTP synthetase  59.1 
 
 
534 aa  690    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0171408  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0433  CTP synthetase  57.04 
 
 
550 aa  644    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589327 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  67.29 
 
 
535 aa  778    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  66.92 
 
 
535 aa  771    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  66.73 
 
 
535 aa  771    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  61.99 
 
 
533 aa  687    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  66.73 
 
 
535 aa  770    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29581  CTP synthetase  57.09 
 
 
558 aa  664    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4305  CTP synthetase  58.65 
 
 
555 aa  646    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  66.41 
 
 
534 aa  745    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  61.35 
 
 
555 aa  692    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3115  CTP synthetase  61.91 
 
 
557 aa  704    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000124409  hitchhiker  0.00148298 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2751  CTP synthase  57.77 
 
 
555 aa  642    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0184273 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1182  CTP synthetase  56.03 
 
 
547 aa  639    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1291  CTP synthetase  57.66 
 
 
555 aa  674    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18991  CTP synthetase  57.66 
 
 
536 aa  671    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.433411  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  66.73 
 
 
535 aa  769    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  59.85 
 
 
545 aa  684    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21631  CTP synthetase  57.84 
 
 
555 aa  676    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.397558 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2785  CTP synthetase  63.52 
 
 
538 aa  736    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963897  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  66.35 
 
 
531 aa  770    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  58.76 
 
 
534 aa  653    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4327  CTP synthetase  58.65 
 
 
555 aa  649    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0174  CTP synthetase  59.52 
 
 
542 aa  673    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.472124  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2235  CTP synthetase  57.47 
 
 
549 aa  656    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  60.86 
 
 
533 aa  681    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2598  CTP synthetase  58.22 
 
 
549 aa  671    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0553655  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  57.52 
 
 
538 aa  649    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  58.14 
 
 
548 aa  655    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1135  CTP synthetase  56.95 
 
 
535 aa  653    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  66.92 
 
 
535 aa  771    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1782  CTP synthetase  57.52 
 
 
536 aa  671    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  59.63 
 
 
546 aa  681    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0157  CTP synthetase  57.49 
 
 
539 aa  638    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.337203  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  66.73 
 
 
535 aa  770    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  61.61 
 
 
533 aa  684    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  65.98 
 
 
537 aa  773    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  65.91 
 
 
531 aa  764    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  58.65 
 
 
555 aa  648    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3157  CTP synthetase  55.47 
 
 
608 aa  641    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0522365  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  59.81 
 
 
545 aa  676    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0230  CTP synthetase  58.61 
 
 
534 aa  677    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181921  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  62.97 
 
 
536 aa  735    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  65.47 
 
 
541 aa  744    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2887  CTP synthetase  100 
 
 
537 aa  1109    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  66.73 
 
 
535 aa  771    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09600  CTP synthetase  57.44 
 
 
532 aa  654    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0671161 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  66.54 
 
 
535 aa  769    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  65.29 
 
 
535 aa  748    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  64.72 
 
 
547 aa  738    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2106  CTP synthetase  58.41 
 
 
533 aa  665    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0473416  normal  0.014711 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0052  CTP synthetase  57.74 
 
 
554 aa  645    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18801  CTP synthetase  56.05 
 
 
536 aa  656    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.061143  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  59.81 
 
 
547 aa  679    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  58.03 
 
 
551 aa  667    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  58.89 
 
 
553 aa  654    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  62.34 
 
 
540 aa  692    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  64.97 
 
 
536 aa  739    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  64.78 
 
 
535 aa  753    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  64.78 
 
 
535 aa  753    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0028  CTP synthetase  61.05 
 
 
534 aa  676    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.23296  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2872  CTP synthetase  56.72 
 
 
571 aa  665    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1607  CTP synthetase  60.48 
 
 
546 aa  681    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.353292 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  66.73 
 
 
535 aa  770    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  56.83 
 
 
540 aa  654    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  64.85 
 
 
532 aa  735    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  63.96 
 
 
542 aa  746    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1325  CTP synthetase  59.06 
 
 
536 aa  662    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00186219  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  59.43 
 
 
558 aa  688    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1743  CTP synthetase  59.96 
 
 
547 aa  694    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0432346  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0497  CTP synthetase  56.1 
 
 
535 aa  657    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0144764  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1786  CTP synthetase  57.06 
 
 
544 aa  657    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0226  CTP synthetase  57.33 
 
 
540 aa  650    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000246238  hitchhiker  4.1491499999999996e-20 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0519  CTP synthetase  55.83 
 
 
537 aa  636    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.354414  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0193  CTP synthetase  60.49 
 
 
534 aa  696    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0420117  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2586  CTP synthetase  56.2 
 
 
538 aa  638    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0528943 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1727  CTP synthetase  57.36 
 
 
535 aa  637    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  57.04 
 
 
557 aa  649    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  62.59 
 
 
534 aa  711    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1093  CTP synthetase  57.14 
 
 
533 aa  641    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  62.97 
 
 
536 aa  735    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18801  CTP synthetase  57.84 
 
 
536 aa  673    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1132  CTP synthetase  55.95 
 
 
558 aa  637    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18211  CTP synthetase  57.66 
 
 
555 aa  657    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25420  CTP synthetase  59 
 
 
566 aa  656    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.199429 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>