More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2075 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2751  CTP synthase  63.75 
 
 		 555 aa  712    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0184273 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0973  CTP synthetase  60.62 
 
 		 545 aa  634    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0924832 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  58.6 
 
 		 531 aa  667    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  64.84 
 
 		 536 aa  737    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  57.14 
 
 		 542 aa  650    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38810  CTP synthetase  57.64 
 
 		 543 aa  653    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  57.86 
 
 		 531 aa  665    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2513  CTP synthetase  58.08 
 
 		 552 aa  661    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294945  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  61.81 
 
 		 555 aa  705    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1600  CTP synthetase  65.61 
 
 		 533 aa  716    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0847  CTP synthetase  60.62 
 
 		 545 aa  634    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.234606  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1236  CTP synthetase  57.54 
 
 		 545 aa  635    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000161678  hitchhiker  0.00000000200253 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  57.09 
 
 		 543 aa  650    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1151  CTP synthetase  54.28 
 
 		 554 aa  636    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.485284  normal  0.0237518 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3441  CTP synthetase  57.54 
 
 		 546 aa  635    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1552  CTP synthase  55.99 
 
 		 543 aa  642    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.873983  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0433  CTP synthetase  64.05 
 
 		 550 aa  744    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589327 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4327  CTP synthetase  60.55 
 
 		 555 aa  688    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  58.6 
 
 		 534 aa  652    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2026  CTP synthetase  59.1 
 
 		 545 aa  646    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000406175  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1184  CTP synthetase  60.98 
 
 		 545 aa  670    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1190  CTP synthetase  60.6 
 
 		 545 aa  665    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1361  CTP synthetase  55.99 
 
 		 543 aa  642    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0802006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  63.12 
 
 		 547 aa  698    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2366  CTP synthetase  59.63 
 
 		 546 aa  676    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.863535  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  58.83 
 
 		 540 aa  659    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3128  CTP synthetase  57.54 
 
 		 545 aa  635    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000112535  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0619  CTP synthetase  62.71 
 
 		 546 aa  696    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.626167  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3137  CTP synthetase  57.54 
 
 		 545 aa  635    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000110473  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  56.09 
 
 		 545 aa  643    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  55.74 
 
 		 558 aa  638    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0850  CTP synthetase  58.86 
 
 		 550 aa  652    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1119  CTP synthetase  56.72 
 
 		 543 aa  655    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  56.96 
 
 		 542 aa  650    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  66.79 
 
 		 534 aa  749    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  57.14 
 
 		 542 aa  650    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03526  CTP synthetase  57.78 
 
 		 546 aa  640    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2598  CTP synthetase  56.06 
 
 		 549 aa  639    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0553655  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  63.7 
 
 		 538 aa  721    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  64.65 
 
 		 548 aa  748    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1262  CTP synthetase  59.47 
 
 		 543 aa  666    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1182  CTP synthetase  61.73 
 
 		 547 aa  690    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  58.07 
 
 		 546 aa  649    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1227  CTP synthetase  59.44 
 
 		 566 aa  651    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0320  CTP synthetase  58.27 
 
 		 555 aa  660    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  60.52 
 
 		 537 aa  663    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  59.93 
 
 		 533 aa  660    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  60.36 
 
 		 555 aa  687    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1661  CTP synthetase  59.63 
 
 		 550 aa  665    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  60.51 
 
 		 541 aa  677    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1727  CTP synthetase  64.56 
 
 		 535 aa  705    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  58.87 
 
 		 542 aa  660    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2785  CTP synthetase  60.3 
 
 		 538 aa  660    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963897  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1243  CTP synthetase  56.8 
 
 		 543 aa  658    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  56.77 
 
 		 542 aa  649    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300969 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1911  CTP synthetase  59.07 
 
 		 542 aa  669    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.884152  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1472  CTP synthase  60.37 
 
 		 555 aa  676    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  55.95 
 
 		 542 aa  642    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  56.48 
 
 		 547 aa  644    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2613  CTP synthetase  65.24 
 
 		 533 aa  710    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0617  CTP synthetase  57.97 
 
 		 548 aa  651    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3280  CTP synthetase  57.54 
 
 		 545 aa  635    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000222232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0156  CTP synthetase  66.54 
 
 		 546 aa  735    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2845  CTP synthetase  56.4 
 
 		 555 aa  636    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0975  CTP synthetase  63.79 
 
 		 547 aa  715    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  59.78 
 
 		 558 aa  689    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2758  CTP synthetase  57.54 
 
 		 545 aa  635    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000221418  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  57.7 
 
 		 532 aa  640    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  56.3 
 
 		 547 aa  642    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  56.65 
 
 		 551 aa  644    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3265  CTP synthetase  58.91 
 
 		 543 aa  641    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1634  CTP synthetase  56.93 
 
 		 545 aa  635    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.883771  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1872  CTP synthetase  57.9 
 
 		 555 aa  658    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  57.86 
 
 		 535 aa  653    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  57.86 
 
 		 535 aa  653    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0552  CTP synthetase  58.18 
 
 		 542 aa  634    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1093  CTP synthetase  55.96 
 
 		 533 aa  637    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1114  CTP synthetase  57.72 
 
 		 546 aa  634    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000131384  normal  0.869869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1185  CTP synthetase  57.54 
 
 		 546 aa  635    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000285694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  58.85 
 
 		 540 aa  666    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  59.56 
 
 		 535 aa  657    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1563  CTP synthetase  59.4 
 
 		 534 aa  651    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  59.07 
 
 		 533 aa  659    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4305  CTP synthetase  60.55 
 
 		 555 aa  687    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  55.95 
 
 		 542 aa  642    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2979  CTP synthetase  65.31 
 
 		 534 aa  712    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.535852  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002506  CTP synthase  57.59 
 
 		 546 aa  640    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000244608  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1204  CTP synthetase  58.09 
 
 		 545 aa  640    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000204322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  100 
 
 		 557 aa  1152    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1557  CTP synthetase  60.48 
 
 		 547 aa  685    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.591143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  57.06 
 
 		 536 aa  637    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  69.33 
 
 		 553 aa  788    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1614  CTP synthetase  64.94 
 
 		 535 aa  700    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.23037  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1439  CTP synthetase  60.52 
 
 		 551 aa  681    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0767506  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1607  CTP synthetase  65.99 
 
 		 546 aa  737    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.353292 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0668  CTP synthetase  58.18 
 
 		 545 aa  652    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00226842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  56.8 
 
 		 542 aa  659    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1511  CTP synthetase  65.2 
 
 		 547 aa  748    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174656  decreased coverage  0.000112124 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0662  CTP synthetase  61.6 
 
 		 549 aa  689    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2515  CTP synthetase  57.22 
 
 		 546 aa  632  1e-180  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000298041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>